| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0037220.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 4.4e-104 | 88.58 | Show/hide |
Query: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
MPDSL KSLPPRRMID+EIELVP AKPPAKNAYRM PPELAELRKQLDELLNA FIRPAKAPY APVLF +KKDGSLRL IDYRALNKLT+RNKYPLPI+
Subjt: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
Query: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
TDLFDRLHG KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTT +TRY AFEFLVMPFGLTNAP TFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVY+TT+EEH DHLQ
Subjt: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
Query: ----KENQLYVKREKCSFA
KENQLYVKREKCSFA
Subjt: ----KENQLYVKREKCSFA
|
|
| KAA0067557.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 4.4e-104 | 88.58 | Show/hide |
Query: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
MPDSL KSLPPRRMID+EIELVP AKPPAKNAYRM PPELAELRKQLDELLNA FIRPAKAPY APVLF +KKDGSLRL IDYRALNKLT+RNKYPLPI+
Subjt: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
Query: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
TDLFDRLHG KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTT +TRY AFEFLVMPFGLTNAP TFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVY+TT+EEH DHLQ
Subjt: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
Query: ----KENQLYVKREKCSFA
KENQLYVKREKCSFA
Subjt: ----KENQLYVKREKCSFA
|
|
| KAA0068074.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 2.3e-113 | 99.03 | Show/hide |
Query: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
Subjt: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
Query: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQKE
TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQKE
Subjt: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQKE
Query: NQLYVKR
NQL+ KR
Subjt: NQLYVKR
|
|
| TYK07954.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 2.0e-104 | 89.04 | Show/hide |
Query: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
MPDSL KSLPPRRMID+EIELVP AKPPAKNAYRM PPELAELRKQLDELLNA FIRPAKAPY APVLF KKKDGSLRL IDYRALNKLT+RNKYPLPI+
Subjt: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
Query: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
TDLFDRLHG KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTT +TRY AFEFLVMPFGLTNAP TFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVY+TT+EEH DHLQ
Subjt: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
Query: ----KENQLYVKREKCSFA
KENQLYVKREKCSFA
Subjt: ----KENQLYVKREKCSFA
|
|
| TYK28653.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 2.0e-104 | 89.04 | Show/hide |
Query: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
MPDSL KSLPPRRMID+EIELVP AKPPAKNAYRM PPELAELRKQLDELLNA FIRPAKAPY APVLF KKKDGSLRL IDYRALNKLT+RNKYPLPI+
Subjt: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
Query: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
TDLFDRLHG KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTT +TRY AFEFLVMPFGLTNAP TFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVY+TT+EEH DHLQ
Subjt: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
Query: ----KENQLYVKREKCSFA
KENQLYVKREKCSFA
Subjt: ----KENQLYVKREKCSFA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5D3BRZ6 Reverse transcriptase | 2.1e-104 | 88.58 | Show/hide |
Query: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
MPDSL KSLPPRRMID+EIELVP AKPPAKNAYRM PPELAELRKQLDELLNA FIRPAKAPY APVLF +KKDGSLRL IDYRALNKLT+RNKYPLPI+
Subjt: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
Query: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
TDLFDRLHG KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTT +TRY AFEFLVMPFGLTNAP TFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVY+TT+EEH DHLQ
Subjt: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
Query: ----KENQLYVKREKCSFA
KENQLYVKREKCSFA
Subjt: ----KENQLYVKREKCSFA
|
|
| A0A5D3C4R1 Reverse transcriptase | 2.1e-104 | 88.58 | Show/hide |
Query: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
MPDSL KSLPPRRMID+EIELVP AKPPAKNAYRM PPELAELRKQLDELLNA FIRPAKAPY APVLF +KKDGSLRL IDYRALNKLT+RNKYPLPI+
Subjt: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
Query: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
TDLFDRLHG KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTT +TRY AFEFLVMPFGLTNAP TFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVY+TT+EEH DHLQ
Subjt: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
Query: ----KENQLYVKREKCSFA
KENQLYVKREKCSFA
Subjt: ----KENQLYVKREKCSFA
|
|
| A0A5D3C9P8 Reverse transcriptase | 9.5e-105 | 89.04 | Show/hide |
Query: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
MPDSL KSLPPRRMID+EIELVP AKPPAKNAYRM PPELAELRKQLDELLNA FIRPAKAPY APVLF KKKDGSLRL IDYRALNKLT+RNKYPLPI+
Subjt: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
Query: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
TDLFDRLHG KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTT +TRY AFEFLVMPFGLTNAP TFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVY+TT+EEH DHLQ
Subjt: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
Query: ----KENQLYVKREKCSFA
KENQLYVKREKCSFA
Subjt: ----KENQLYVKREKCSFA
|
|
| A0A5D3DR74 Reverse transcriptase | 1.1e-113 | 99.03 | Show/hide |
Query: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
Subjt: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
Query: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQKE
TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQKE
Subjt: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQKE
Query: NQLYVKR
NQL+ KR
Subjt: NQLYVKR
|
|
| A0A5D3DY42 Reverse transcriptase | 9.5e-105 | 89.04 | Show/hide |
Query: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
MPDSL KSLPPRRMID+EIELVP AKPPAKNAYRM PPELAELRKQLDELLNA FIRPAKAPY APVLF KKKDGSLRL IDYRALNKLT+RNKYPLPI+
Subjt: MPDSLSKSLPPRRMIDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIV
Query: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
TDLFDRLHG KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTT +TRY AFEFLVMPFGLTNAP TFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVY+TT+EEH DHLQ
Subjt: TDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ--
Query: ----KENQLYVKREKCSFA
KENQLYVKREKCSFA
Subjt: ----KENQLYVKREKCSFA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein | 2.3e-31 | 33.95 | Show/hide |
Query: SKSLP-PRRMIDNEIELVPK-AKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIVTDL
++ LP P + ++ E+EL + + P +N Y + P ++ + ++++ L + IR +KA PV+F KK+G+LR+ +DY+ LNK N YPLP++ L
Subjt: SKSLP-PRRMIDNEIELVPK-AKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIVTDL
Query: FDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ-----
++ G F+KLDL+S Y+ +R+ +GDE K + FE+LVMP+G++ AP F +N + E + VV Y+DDI++++ + EH H++
Subjt: FDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ-----
Query: -KENQLYVKREKCSF
K L + + KC F
Subjt: -KENQLYVKREKCSF
|
|
| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 2.3e-31 | 33.95 | Show/hide |
Query: SKSLP-PRRMIDNEIELVPK-AKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIVTDL
++ LP P + ++ E+EL + + P +N Y + P ++ + ++++ L + IR +KA PV+F KK+G+LR+ +DY+ LNK N YPLP++ L
Subjt: SKSLP-PRRMIDNEIELVPK-AKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIVTDL
Query: FDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ-----
++ G F+KLDL+S Y+ +R+ +GDE K + FE+LVMP+G++ AP F +N + E + VV Y+DDI++++ + EH H++
Subjt: FDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ-----
Query: -KENQLYVKREKCSF
K L + + KC F
Subjt: -KENQLYVKREKCSF
|
|
| P31843 RNA-directed DNA polymerase homolog | 9.9e-43 | 68.25 | Show/hide |
Query: SLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIVTDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKF
SLR+ IDYRAL K+TI+NKYP+P V DLFDRL +F+KLDLRSGY+QVRIA+GDEPKTT +TRY +FEF VMPFGLTNA TFC LMN V +EYLD F
Subjt: SLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLPIVTDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKF
Query: VVVYLDDIVV---YNTTIEEHSDHLQ
VVVYLDD+VV Y+ ++ EH HL+
Subjt: VVVYLDDIVV---YNTTIEEHSDHLQ
|
|
| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 3.3e-38 | 39.37 | Show/hide |
Query: LSKSLPPRRM------IDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLP
+ LPPR + ++IE+ P A+ P Y + E+ K + +LL+ FI P+K+P +PV+ KKDG+ RL +DYR LNK TI + +PLP
Subjt: LSKSLPPRRM------IDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLP
Query: IVTDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ
+ +L R+ + F+ LDL SGY+Q+ + D KT ++T +E+ VMPFGL NAP+TF M F + +FV VYLDDI++++ + EEH HL
Subjt: IVTDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ
Query: ------KENQLYVKREKCSFA
K L VK++KC FA
Subjt: ------KENQLYVKREKCSFA
|
|
| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 3.3e-38 | 39.37 | Show/hide |
Query: LSKSLPPRRM------IDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLP
+ LPPR + ++IE+ P A+ P Y + E+ K + +LL+ FI P+K+P +PV+ KKDG+ RL +DYR LNK TI + +PLP
Subjt: LSKSLPPRRM------IDNEIELVPKAKPPAKNAYRMMPPELAELRKQLDELLNAWFIRPAKAPYRAPVLFYKKKDGSLRLYIDYRALNKLTIRNKYPLP
Query: IVTDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ
+ +L R+ + F+ LDL SGY+Q+ + D KT ++T +E+ VMPFGL NAP+TF M F + +FV VYLDDI++++ + EEH HL
Subjt: IVTDLFDRLHGEKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDEPKTTYITRYKAFEFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYNTTIEEHSDHLQ
Query: ------KENQLYVKREKCSFA
K L VK++KC FA
Subjt: ------KENQLYVKREKCSFA
|
|
