; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc04g0106841 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc04g0106841
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionNBS-LRR type resistance protein
Genome locationCMiso1.1chr04:25085557..25086175
RNA-Seq ExpressionCmc04g0106841
SyntenyCmc04g0106841
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ADN34241.1 NBS-LRR type resistance protein [Cucumis melo subsp. melo]4.2e-3190.12Show/hide
Query:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
        MRI TSSATIISAVHSRSNH +TRLLDRSSLTIIVAG S FYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCS KHTFELGHSCRR PRMR+
Subjt:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
KAA0036833.1 NBS-LRR type resistance protein [Cucumis melo var. makuwa]1.8e-3493.83Show/hide
Query:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
        MRIGTSS TIISAVHSRSNHG+TRLLDRSSLTIIV G SRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMR+
Subjt:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
KAA0040675.1 NBS-LRR type resistance protein [Cucumis melo var. makuwa]8.1e-3593.83Show/hide
Query:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
        MRIGTSS TIISA+HSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAG SRFYNDSMSSLKEEGSRS+VWNCSGKHTFELG+SCRRPPRMRM
Subjt:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
KAA0055453.1 CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]7.9e-3086.42Show/hide
Query:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
        MRIGTSSATIIS VHSRSNHG+TR+LD+SSLTI VAG SRFYNDSMSSLKE+GSRSIVWN  GK TFELGHSCRRPPRM M
Subjt:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
TYK08760.1 NBS-LRR type resistance protein [Cucumis melo var. makuwa]4.0e-3492.59Show/hide
Query:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
        MRIGTSS TIISA+HSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAG SRFYNDSMSSLKEE SRS+VWNCSGKHTFELG+SCRRPPRMRM
Subjt:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7T1N6 NBS-LRR type resistance protein8.8e-3593.83Show/hide
Query:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
        MRIGTSS TIISAVHSRSNHG+TRLLDRSSLTIIV G SRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMR+
Subjt:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
A0A5A7TGV8 NBS-LRR type resistance protein3.9e-3593.83Show/hide
Query:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
        MRIGTSS TIISA+HSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAG SRFYNDSMSSLKEEGSRS+VWNCSGKHTFELG+SCRRPPRMRM
Subjt:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
A0A5A7UHP1 CACTA en-spm transposon protein3.8e-3086.42Show/hide
Query:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
        MRIGTSSATIIS VHSRSNHG+TR+LD+SSLTI VAG SRFYNDSMSSLKE+GSRSIVWN  GK TFELGHSCRRPPRM M
Subjt:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
A0A5D3CBP1 NBS-LRR type resistance protein2.0e-3492.59Show/hide
Query:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
        MRIGTSS TIISA+HSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAG SRFYNDSMSSLKEE SRS+VWNCSGKHTFELG+SCRRPPRMRM
Subjt:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
E5GCP2 NBS-LRR type resistance protein2.0e-3190.12Show/hide
Query:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
        MRI TSSATIISAVHSRSNH +TRLLDRSSLTIIVAG S FYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCS KHTFELGHSCRR PRMR+
Subjt:  MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGATTGGCACTTCCTCTGCGACCATTATATCAGCCGTGCATTCCAGGAGCAATCACGGACAAACAAGGCTGCTAGACAGAAGCAGCCTTACAATCATAGTAGCGGG
TCGAAGTCGTTTCTACAACGACAGTATGAGCTCGCTGAAAGAAGAGGGCAGCCGGTCGATCGTGTGGAATTGTTCCGGGAAACACACGTTCGAGCTGGGACATTCGTGTC
GCAGGCCGCCGAGGATGCGCATGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTGGGAGAGAATACATTGAGGTCGTCAAGGGCGACCTCCAGCGATTCTTTGTGCTTGATTTCAACGATCAAGCAATGAACAGGTTTGTTGAGCATCAGATGCTCACGAC
CTTTAAAGAGTTCCGGGCCGACTGTCATAAACATTTCAAAAAGTACAGCGACCCGGAGGAGGCTCGTGCCAACCCACCAAACGCATTGGTTGGACGTGATGAGGATTGGC
ACTTCCTCTGCGACCATTATATCAGCCGTGCATTCCAGGAGCAATCACGGACAAACAAGGCTGCTAGACAGAAGCAGCCTTACAATCATAGTAGCGGGTCGAAGTCGTTT
CTACAACGACAGTATGAGCTCGCTGAAAGAAGAGGGCAGCCGGTCGATCGTGTGGAATTGTTCCGGGAAACACACGTTCGAGCTGGGACATTCGTGTCGCAGGCCGCCGA
GGATGCGCATGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRIGTSSATIISAVHSRSNHGQTRLLDRSSLTIIVAGRSRFYNDSMSSLKEEGSRSIVWNCSGKHTFELGHSCRRPPRMRM