| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0032254.1 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.5e-72 | 65.4 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
MPFGLTNAP TFQSLM++IFKPYLR F +L+AN+KKC+F +RVEYL H+I GVEVDP KI++IADW
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
Query: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYS
PKPTN+ ETRGFLGLTGYY+RFVH+YGA+ APLTQLLKK GF W+ EA++ FEKLKKAMMSLP+LALP FD+PFEIETDAS +G+GAVLIQ KRPIAFYS
Subjt: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYS
Query: HTLAMRDIGRP
HTLA+RD GRP
Subjt: HTLAMRDIGRP
|
|
| KAA0033134.1 Transposon Tf2-6 polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.5e-72 | 76.8 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSFDSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADWPKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIV
MPFGLTNAP TFQSLM+AIFKPYLRS F K+RV+YL H+I GNG EVDP KIR IA+WPKPTNV ETRGFLG+TGYY +FVH+YGAIV
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSFDSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADWPKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIV
Query: APLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYSHTLAMRDIGRP
A LTQLLKK FKWSEEA++ FEKLKKAMMSLP+LALP FDQPFEIET+AS FG+GAVLIQAKRPIAFYSHTLAMRD GRP
Subjt: APLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYSHTLAMRDIGRP
|
|
| KAA0048104.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 1.5e-72 | 65.88 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
MPFGLTNAP TFQSLM++IF+PYLR F EL+AN+KKC+F +RVEYL H+I GVEVDP KI++IADW
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
Query: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYS
PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVH YGA+ PLTQLLKK GF W+ EA++ FEKLKKAMMSLP+LALP FD+PFEIETDAS +G+GAVLIQ K PIAFYS
Subjt: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYS
Query: HTLAMRDIGRP
HTLA+RD GRP
Subjt: HTLAMRDIGRP
|
|
| KAA0054134.1 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.5e-88 | 97.04 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLR-SFDSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADWPKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAI
MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLR SFDSELYANKKKCNFAKSRVEYL HIIFGNGVEVDPGKIRSIADWPKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAI
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLR-SFDSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADWPKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAI
Query: VAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAF
VAPLTQLLKKWGFKWSEEAD+TFEKLKKAMMSLPILALPKFDQ FEIETDAS FGLGAVLIQAKRPIAF
Subjt: VAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAF
|
|
| TYJ96446.1 Transposon Tf2-6 polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.5e-72 | 65.88 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
MPFGLTNAP TFQSLM++IF+PYLR F EL+AN+KKC+F +RVEYL H+I GVEVDP KI++IADW
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
Query: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYS
PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVH YGA+ PLTQLLKK GF W+ EA++ FEKLKKAMMSLP+LALP FD+PFEIETDAS +G+GAVLIQ K PIAFYS
Subjt: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYS
Query: HTLAMRDIGRP
HTLA+RD GRP
Subjt: HTLAMRDIGRP
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SM43 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 7.2e-73 | 65.4 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
MPFGLTNAP TFQSLM++IFKPYLR F +L+AN+KKC+F +RVEYL H+I GVEVDP KI++IADW
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
Query: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYS
PKPTN+ ETRGFLGLTGYY+RFVH+YGA+ APLTQLLKK GF W+ EA++ FEKLKKAMMSLP+LALP FD+PFEIETDAS +G+GAVLIQ KRPIAFYS
Subjt: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYS
Query: HTLAMRDIGRP
HTLA+RD GRP
Subjt: HTLAMRDIGRP
|
|
| A0A5A7SPI7 Transposon Tf2-6 polyprotein | 1.2e-72 | 76.8 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSFDSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADWPKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIV
MPFGLTNAP TFQSLM+AIFKPYLRS F K+RV+YL H+I GNG EVDP KIR IA+WPKPTNV ETRGFLG+TGYY +FVH+YGAIV
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSFDSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADWPKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIV
Query: APLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYSHTLAMRDIGRP
A LTQLLKK FKWSEEA++ FEKLKKAMMSLP+LALP FDQPFEIET+AS FG+GAVLIQAKRPIAFYSHTLAMRD GRP
Subjt: APLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYSHTLAMRDIGRP
|
|
| A0A5A7TYJ6 Reverse transcriptase | 7.2e-73 | 65.88 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
MPFGLTNAP TFQSLM++IF+PYLR F EL+AN+KKC+F +RVEYL H+I GVEVDP KI++IADW
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
Query: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYS
PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVH YGA+ PLTQLLKK GF W+ EA++ FEKLKKAMMSLP+LALP FD+PFEIETDAS +G+GAVLIQ K PIAFYS
Subjt: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYS
Query: HTLAMRDIGRP
HTLA+RD GRP
Subjt: HTLAMRDIGRP
|
|
| A0A5A7UG09 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 1.2e-88 | 97.04 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLR-SFDSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADWPKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAI
MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLR SFDSELYANKKKCNFAKSRVEYL HIIFGNGVEVDPGKIRSIADWPKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAI
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLR-SFDSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADWPKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAI
Query: VAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAF
VAPLTQLLKKWGFKWSEEAD+TFEKLKKAMMSLPILALPKFDQ FEIETDAS FGLGAVLIQAKRPIAF
Subjt: VAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAF
|
|
| A0A5D3BC12 Transposon Tf2-6 polyprotein | 7.2e-73 | 65.88 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
MPFGLTNAP TFQSLM++IF+PYLR F EL+AN+KKC+F +RVEYL H+I GVEVDP KI++IADW
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
Query: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYS
PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVH YGA+ PLTQLLKK GF W+ EA++ FEKLKKAMMSLP+LALP FD+PFEIETDAS +G+GAVLIQ K PIAFYS
Subjt: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAFYS
Query: HTLAMRDIGRP
HTLA+RD GRP
Subjt: HTLAMRDIGRP
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 7.2e-30 | 36.97 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRS--------------------------FDSELYANKK----KCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
MPFGL NAP TFQ M+ I +P L F+ AN K KC F K +L H++ +G++ +P KI +I +
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRS--------------------------FDSELYANKK----KCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
Query: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFK---WSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIA
P PT +E + FLGLTGYYR+F+ + I P+T+ LKK K + E D F+KLK + PIL +P F + F + TDAS LGAVL Q P++
Subjt: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFK---WSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIA
Query: FYSHTLAMRDI
+ S TL +I
Subjt: FYSHTLAMRDI
|
|
| P10401 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon gypsy | 1.6e-24 | 31.48 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRS------------------------------FDSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
+PFGL NA FQ +D + + + D+ + +++K F K VEYL I+ +G + DP K+++I ++
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRS------------------------------FDSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
Query: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLL------------KKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLP-ILALPKFDQPFEIETDASSFGLGA
P+P V + R FLGL YYR F+ + AI P+T +L KK +++E F++L+ + S IL P F +PF++ TDAS+ G+GA
Subjt: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLL------------KKWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLP-ILALPKFDQPFEIETDASSFGLGA
Query: VLIQAKRPIAFYSHTL
VL Q RPI S TL
Subjt: VLIQAKRPIAFYSHTL
|
|
| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 1.0e-31 | 38.05 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
MPFGL NAP TFQ M+ I +P L D+ L KC F K +L HI+ +G++ +P K+++I +
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYLRSF------------------------------DSELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
Query: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEAD--KTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAF
P PT +E R FLGLTGYYR+F+ Y I P+T LKK +++ + + FEKLK ++ PIL LP F++ F + TDAS+ LGAVL Q PI+F
Subjt: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEAD--KTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAVLIQAKRPIAF
Query: YSHTL
S TL
Subjt: YSHTL
|
|
| P92523 Uncharacterized mitochondrial protein AtMg00860 | 5.9e-32 | 55.56 | Show/hide |
Query: ELYANKKKCNFAKSRVEYL--RHIIFGNGVEVDPGKIRSIADWPKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKK
+ YAN+KKC F + ++ YL RHII G GV DP K+ ++ WP+P N E RGFLGLTGYYRRFV YG IV PLT+LLKK KW+E A F+ LK
Subjt: ELYANKKKCNFAKSRVEYL--RHIIFGNGVEVDPGKIRSIADWPKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLKKWGFKWSEEADKTFEKLKK
Query: AMMSLPILALPKFDQPF
A+ +LP+LALP PF
Subjt: AMMSLPILALPKFDQPF
|
|
| Q8I7P9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus | 3.0e-28 | 33.33 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYL---------------RSFD---------------SELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
+PFGL NAP FQ ++D I + ++ +D + L N +K +F ++VE+L +I+ +G++ DP K+R+I++
Subjt: MPFGLTNAPPTFQSLMDAIFKPYL---------------RSFD---------------SELYANKKKCNFAKSRVEYLRHIIFGNGVEVDPGKIRSIADW
Query: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLK------------KWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAV
P PT+V+E + FLG+T YYR+F+ Y + PLT L + K E A ++F LK + S ILA P F +PF + TDAS++ +GAV
Subjt: PKPTNVRETRGFLGLTGYYRRFVHKYGAIVAPLTQLLK------------KWGFKWSEEADKTFEKLKKAMMSLPILALPKFDQPFEIETDASSFGLGAV
Query: LIQ----AKRPIAFYSHTL
L Q RPIA+ S +L
Subjt: LIQ----AKRPIAFYSHTL
|
|
