| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0032583.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 1.1e-66 | 87.41 | Show/hide |
Query: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
K+S PVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLTVRNKYP PII DLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQ+RIAEGDEPKTT VTRYGAF+FLVMPFGLTNAP T
Subjt: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
Query: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRD+ ++ F+
Subjt: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
|
|
| KAA0040442.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 3.3e-66 | 84.35 | Show/hide |
Query: LIVCKSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTN
++ K+ PVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLTVRNKYP PII DLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQ+RIAEGDEPKTT VTRYGAF+FLVMPFGLTN
Subjt: LIVCKSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTN
Query: APTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
AP TFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRD+ ++ F+
Subjt: APTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
|
|
| KAA0067557.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 4.3e-66 | 86.71 | Show/hide |
Query: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
K+ PVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLTVRNKYP PII DLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQ+RIAEGDEPKTT VTRYGAF+FLVMPFGLTNAP T
Subjt: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
Query: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRD+ ++ F+
Subjt: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
|
|
| TYK07954.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 1.9e-66 | 87.41 | Show/hide |
Query: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
K+ PVLFQKKKDGSLRLCIDYR LNKLTVRNKYP PII DLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQ+RIAEGDEPKTT VTRYGAF+FLVMPFGLTNAP T
Subjt: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
Query: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRD+ ++ F+
Subjt: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
|
|
| TYK28653.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 1.9e-66 | 87.41 | Show/hide |
Query: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
K+ PVLFQKKKDGSLRLCIDYR LNKLTVRNKYP PII DLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQ+RIAEGDEPKTT VTRYGAF+FLVMPFGLTNAP T
Subjt: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
Query: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRD+ ++ F+
Subjt: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SQC7 Reverse transcriptase | 5.5e-67 | 87.41 | Show/hide |
Query: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
K+S PVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLTVRNKYP PII DLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQ+RIAEGDEPKTT VTRYGAF+FLVMPFGLTNAP T
Subjt: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
Query: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRD+ ++ F+
Subjt: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
|
|
| A0A5A7TAG9 Reverse transcriptase | 1.6e-66 | 84.35 | Show/hide |
Query: LIVCKSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTN
++ K+ PVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLTVRNKYP PII DLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQ+RIAEGDEPKTT VTRYGAF+FLVMPFGLTN
Subjt: LIVCKSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTN
Query: APTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
AP TFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRD+ ++ F+
Subjt: APTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
|
|
| A0A5D3C4R1 Reverse transcriptase | 2.1e-66 | 86.71 | Show/hide |
Query: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
K+ PVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLTVRNKYP PII DLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQ+RIAEGDEPKTT VTRYGAF+FLVMPFGLTNAP T
Subjt: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
Query: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRD+ ++ F+
Subjt: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
|
|
| A0A5D3C9P8 Reverse transcriptase | 9.4e-67 | 87.41 | Show/hide |
Query: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
K+ PVLFQKKKDGSLRLCIDYR LNKLTVRNKYP PII DLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQ+RIAEGDEPKTT VTRYGAF+FLVMPFGLTNAP T
Subjt: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
Query: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRD+ ++ F+
Subjt: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
|
|
| A0A5D3DY42 Reverse transcriptase | 9.4e-67 | 87.41 | Show/hide |
Query: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
K+ PVLFQKKKDGSLRLCIDYR LNKLTVRNKYP PII DLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQ+RIAEGDEPKTT VTRYGAF+FLVMPFGLTNAP T
Subjt: KSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTT
Query: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRD+ ++ F+
Subjt: FCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYKRFFR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein | 3.5e-26 | 40.6 | Show/hide |
Query: PVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTTFCTLMN
PV+F KK+G+LR+ +DY+ LNK N YP P+I L ++ G+ F+KLDL+S Y+ +R+ +GDE K + G F++LVMP+G++ AP F +N
Subjt: PVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTTFCTLMN
Query: QVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYK
+ E + VV Y+DDI+++S + EH + K
Subjt: QVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYK
|
|
| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 3.5e-26 | 40.6 | Show/hide |
Query: PVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTTFCTLMN
PV+F KK+G+LR+ +DY+ LNK N YP P+I L ++ G+ F+KLDL+S Y+ +R+ +GDE K + G F++LVMP+G++ AP F +N
Subjt: PVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTTFCTLMN
Query: QVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYK
+ E + VV Y+DDI+++S + EH + K
Subjt: QVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEHRDYYK
|
|
| P31843 RNA-directed DNA polymerase homolog | 1.8e-43 | 69.42 | Show/hide |
Query: SLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKF
SLR+CIDYR L K+T++NKYP P + DLFDRL A +F+KLDLRSGY+Q+RIA+GDEPKTT VTRYG+F+F VMPFGLTNA TFC LMN V +EYLD F
Subjt: SLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTNAPTTFCTLMNQVFHEYLDKF
Query: VVVYLDDIVV---YSTTMEEH
VVVYLDD+VV YS ++ EH
Subjt: VVVYLDDIVV---YSTTMEEH
|
|
| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 6.8e-30 | 45.65 | Show/hide |
Query: LIVCKSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTN
++ KS PV+ KKDG+ RLC+DYR LNK T+ + +P P I +L R+ A+ F+ LDL SGY+Q+ + D KT +VT G +++ VMPFGL N
Subjt: LIVCKSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTN
Query: APTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEH
AP+TF M F + +FV VYLDDI+++S + EEH
Subjt: APTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEH
|
|
| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 6.8e-30 | 45.65 | Show/hide |
Query: LIVCKSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTN
++ KS PV+ KKDG+ RLC+DYR LNK T+ + +P P I +L R+ A+ F+ LDL SGY+Q+ + D KT +VT G +++ VMPFGL N
Subjt: LIVCKSSVWGPVLFQKKKDGSLRLCIDYRVLNKLTVRNKYPFPIIIDLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQLRIAEGDEPKTTYVTRYGAFKFLVMPFGLTN
Query: APTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEH
AP+TF M F + +FV VYLDDI+++S + EEH
Subjt: APTTFCTLMNQVFHEYLDKFVVVYLDDIVVYSTTMEEH
|
|
