; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc04g0110071 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc04g0110071
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptionrhomboid-like protein 20
Genome locationCMiso1.1chr04:29389280..29396598
RNA-Seq ExpressionCmc04g0110071
SyntenyCmc04g0110071
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR009060 - UBA-like superfamily
IPR015940 - Ubiquitin-associated domain
IPR022764 - Peptidase S54, rhomboid domain
IPR035952 - Rhomboid-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022154191.1 rhomboid-like protein 20 [Momordica charantia]4.4e-14793.84Show/hide
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XP_023516629.1 rhomboid-like protein 20 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.3e-14693.13Show/hide
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XP_038904170.1 rhomboid-like protein 20 isoform X1 [Benincasa hispida]4.2e-15096.56Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LG81 UBA domain-containing protein1.4e-15197.59Show/hide
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A0A1S3CMQ9 rhomboid-like protein 203.3e-156100Show/hide
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A0A5D3D5B1 Rhomboid-like protein 203.3e-156100Show/hide
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A0A6J1DN01 rhomboid-like protein 202.1e-14793.84Show/hide
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A0A6J1EXA3 rhomboid-like protein 208.9e-14692.78Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q4R910 Ubiquitin-associated domain-containing protein 21.5e-1725.95Show/hide
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           E  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q5ZJQ8 Ubiquitin-associated domain-containing protein 22.0e-1725.81Show/hide
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        G +G   AP++++ ++  +  +I   +  +  +   +Y    +K   + W+LV          +      L+Y FR+FER+ GS K+S F+L +   S L
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         P +++  FS    P   +  A P  ++R  M                                            P    R  E    ++PS    P  
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        TE  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q8NBM4 Ubiquitin-associated domain-containing protein 23.7e-1626.24Show/hide
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           E  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q8RXQ2 Rhomboid-like protein 181.6e-10769.42Show/hide
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        + E + +SL KDP ANL+TSGPY L+FASFVPFF DIPV+ RF V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  GICGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
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        ++S FSR SLPS  +    P R      P+   + V       PS TEP E+AIATLVSMGFD+N+ARQALV ARNDVN ATNILLE+ SH
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Q9LET3 Rhomboid-like protein 205.0e-12276.45Show/hide
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        MNGGPSGF+NAPVT+ F+I SALFT+FFGIQGRS KLGLSYQD+  K R WKL+MS FAFSSTPELMFGL+LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS   SL
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        L EV+ +SLLKD  ANL+TSGPYGL+FASF+PF+ DIPVSTRFRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PGICGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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        ++SFFSRLS PS GN PP AP+R++ G +     R  ER+ P+  PS+ EP E+AI TLVSMGFDRN+ARQALV ARNDVN ATNILLE+QSH
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41160.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein1.1e-10869.42Show/hide
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        MNGGPSGFNNAPVT+ F+IA+ALFT+FFGI+G S KLGLSYQD+  K R WKL++S FAFSST +L+ GL+LLY+FRVFERQIGSNKYSVFI FS   SL
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        + E + +SL KDP ANL+TSGPY L+FASFVPFF DIPV+ RF V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  GICGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
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        ++S FSR SLPS  +    P R      P+   + V       PS TEP E+AIATLVSMGFD+N+ARQALV ARNDVN ATNILLE+ SH
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AT3G56740.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein3.6e-12376.45Show/hide
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        MNGGPSGF+NAPVT+ F+I SALFT+FFGIQGRS KLGLSYQD+  K R WKL+MS FAFSSTPELMFGL+LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS   SL
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        L EV+ +SLLKD  ANL+TSGPYGL+FASF+PF+ DIPVSTRFRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PGICGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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        ++SFFSRLS PS GN PP AP+R++ G +     R  ER+ P+  PS+ EP E+AI TLVSMGFDRN+ARQALV ARNDVN ATNILLE+QSH
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACGGCGGCCCCTCCGGTTTCAACAATGCTCCCGTCACCCGGACCTTCATCATCGCCTCCGCTCTTTTCACCATTTTCTTCGGGATCCAAGGCCGTTCAATTAAGCT
TGGTTTGTCCTATCAGGATGTGATTGTGAAGCTCCGATTCTGGAAGTTAGTAATGTCAGTTTTTGCTTTTTCGTCTACTCCTGAATTGATGTTCGGACTGTTTCTGCTAT
ATTACTTCAGAGTATTTGAGAGACAAATAGGTTCCAACAAATACTCGGTCTTTATATTGTTCTCAATAATATCCTCCTTACTTTTTGAGGTCCTTGCGATATCATTACTT
AAAGATCCTGCAGCAAATCTAGTGACTTCTGGACCTTATGGTCTTTTGTTTGCTTCCTTTGTACCCTTCTTCTTTGATATTCCTGTTTCAACTCGGTTCCGTGTATTTGG
AGTTCGTTTCTCTGACAAGTCTTTCATATATCTGGCTGGTCTTCAGCTCCTTCTGTCTTCGTGGAGAAGATCCATCTTACCAGGGATATGCGGAATTCTTGCTGGTTCCT
TATATCGGTTGAATGTATTTGGCATCCGCAAGGCCAAGTTTCCAGAGTTTATCAGTTCATTCTTTTCAAGACTTTCTTTGCCATCTGCGGGGAATCCTCCAGCAGCCCCA
AACAGAGATGTTAGAGGAAACATGCCATCCTTCATGAGCCGCCCGGTTGAGAGGAACTATCCTTCGGCGCCAAGTGCCACAGAACCACCAGAAGACGCCATTGCTACACT
TGTTTCAATGGGGTTTGACAGAAACTCAGCCAGGCAGGCCCTTGTGCAAGCCAGAAACGACGTTAACATTGCGACAAACATACTTCTTGAATCACAATCGCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGGGGGAAGAGGAAGAGATATCGAATTTCCACTCTCAAGTTCCCAACAGACGAAGACGACAAATCGAAATCAAAATCAAATAGAGAAAGAAAGAAGAAGGCTGTGACCGT
CTCAGAGAATCGTTCCTTCCTCTCTGAGACGATGAACGGCGGCCCCTCCGGTTTCAACAATGCTCCCGTCACCCGGACCTTCATCATCGCCTCCGCTCTTTTCACCATTT
TCTTCGGGATCCAAGGCCGTTCAATTAAGCTTGGTTTGTCCTATCAGGATGTGATTGTGAAGCTCCGATTCTGGAAGTTAGTAATGTCAGTTTTTGCTTTTTCGTCTACT
CCTGAATTGATGTTCGGACTGTTTCTGCTATATTACTTCAGAGTATTTGAGAGACAAATAGGTTCCAACAAATACTCGGTCTTTATATTGTTCTCAATAATATCCTCCTT
ACTTTTTGAGGTCCTTGCGATATCATTACTTAAAGATCCTGCAGCAAATCTAGTGACTTCTGGACCTTATGGTCTTTTGTTTGCTTCCTTTGTACCCTTCTTCTTTGATA
TTCCTGTTTCAACTCGGTTCCGTGTATTTGGAGTTCGTTTCTCTGACAAGTCTTTCATATATCTGGCTGGTCTTCAGCTCCTTCTGTCTTCGTGGAGAAGATCCATCTTA
CCAGGGATATGCGGAATTCTTGCTGGTTCCTTATATCGGTTGAATGTATTTGGCATCCGCAAGGCCAAGTTTCCAGAGTTTATCAGTTCATTCTTTTCAAGACTTTCTTT
GCCATCTGCGGGGAATCCTCCAGCAGCCCCAAACAGAGATGTTAGAGGAAACATGCCATCCTTCATGAGCCGCCCGGTTGAGAGGAACTATCCTTCGGCGCCAAGTGCCA
CAGAACCACCAGAAGACGCCATTGCTACACTTGTTTCAATGGGGTTTGACAGAAACTCAGCCAGGCAGGCCCTTGTGCAAGCCAGAAACGACGTTAACATTGCGACAAAC
ATACTTCTTGAATCACAATCGCACTAATTTGAAGAATTTTGAGGGGTAATTTTAAAACTTTGATGTCCCAGGTCGGAGAAACAACCAAATTTGAGTATCGAGGGTTGATG
AATTTGCTGACAAACGAGTTTTGATGGTTGGAGGAACTCACCGAGCTGTTTTTTTATGAACTCTTTAAGGTGTCTCCCTTTTGTGTTCCTCTCTACCGTAGCTCTCAAAT
TTTCTTGATAATTAATGTCCGATTACACAAGATTGCTTAGTTTGTACGTCTTACTACTAAGATCAAAACATCAAGTAGAAATGTTTATGGAACCATAATGTGCAGAATTC
TTATGTTATAATCTAAATTTCAGATTTTTACACAATTTTTTTGGCTCCTAATCTTTATTATATTTAGTAAGCAAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNGGPSGFNNAPVTRTFIIASALFTIFFGIQGRSIKLGLSYQDVIVKLRFWKLVMSVFAFSSTPELMFGLFLLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFSIISSLLFEVLAISLL
KDPAANLVTSGPYGLLFASFVPFFFDIPVSTRFRVFGVRFSDKSFIYLAGLQLLLSSWRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIRKAKFPEFISSFFSRLSLPSAGNPPAAP
NRDVRGNMPSFMSRPVERNYPSAPSATEPPEDAIATLVSMGFDRNSARQALVQARNDVNIATNILLESQSH