; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc04g0112821 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc04g0112821
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionCold and drought regulatory protein
Genome locationCMiso1.1chr04:31533700..31534723
RNA-Seq ExpressionCmc04g0112821
SyntenyCmc04g0112821
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR039285 - Dehydrin HIRD11-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7028450.1 Protein SRC1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.0e-2375.73Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDEH-KKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGE-KKKKEKKKKGEHGHEHHGG-DSSSDS
        M+G +EKIGEKLHIGGDHKGEHH+  K EH  EH KKH +K EHHGEGHKEG++EKIKDKIHG   HHDEKGE KKKKEKKKKGEH   H GG  SSSDS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDEH-KKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGE-KKKKEKKKKGEHGHEHHGG-DSSSDS

Query:  DSD
        DSD
Subjt:  DSD
XP_008443295.1 PREDICTED: protein SRC1 [Cucumis melo]1.8e-44100Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDSD
        MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDSD
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDSD
XP_011652200.1 protein SRC1 [Cucumis sativus]6.5e-3486.67Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDA----HKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEG-HKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSS
        MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDA    HKGEHHDEHKKH   EEHHGEG HKEGI++KIKDKIHGGD HH+EKGEKKKKEKKKKGEHGH+H GGDSSS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDA----HKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEG-HKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSS

Query:  DSDSD
        DSDSD
Subjt:  DSDSD
XP_022973362.1 protein SRC1-like [Cucurbita maxima]5.2e-2370.3Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHH-DAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDS
        MSG +EKIGEKLHIGGDHKGEH  D H+ + H+  KKH +K EHHGEGHKEG++EKIKDKIHGG  HHDEKGEKKKK+K+KK +  H+  G  SSSDSDS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHH-DAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDS

Query:  D
        D
Subjt:  D
XP_038903205.1 protein SRC1 [Benincasa hispida]1.5e-3084.62Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDH-KGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKK---KKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSD
        MSGFIEKIGEKLHIGGDH KGEHHD HKGEHHDEHKKH K EEHHGEGHKEG+IEKIKDKIH   G HDEKGEKK   KKEKKKKGEH H H GG SSSD
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDH-KGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKK---KKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSD

Query:  SDSD
        SDSD
Subjt:  SDSD
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B8E4 protein SRC18.8e-45100Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDSD
        MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDSD
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDSD
A0A5A7UF86 Zinc transporter ZIP68.8e-45100Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDSD
        MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDSD
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDSD
A0A6J1FQD3 protein SRC1-like2.3e-2171.84Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHH-DAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGE-KKKKEKKKKGEHGHEHHGG-DSSSDS
        M+G +EKIGEKLHIGGDHKGEH  + H+ + H+  KKH +K EHHGEGHKEG++EKIKDKIHG   HHDEKGE KKKKEKKKKGEH   H GG  SSSDS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHH-DAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGE-KKKKEKKKKGEHGHEHHGG-DSSSDS

Query:  DSD
        DSD
Subjt:  DSD
A0A6J1I7B7 protein SRC1-like2.5e-2370.3Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHH-DAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDS
        MSG +EKIGEKLHIGGDHKGEH  D H+ + H+  KKH +K EHHGEGHKEG++EKIKDKIHGG  HHDEKGEKKKK+K+KK +  H+  G  SSSDSDS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHH-DAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDS

Query:  D
        D
Subjt:  D
A0A6J1IAZ2 protein SRC1-like7.3e-2369.31Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHH-DAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDS
        MSG +EKIGEKLHIGGDHKGEH  + H+ + H+  KKH +K EHHGEGHKEG++EKIKDKIHGG  HHDEKGEKKKK+K+KK +  H+  G  SSSDSDS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHH-DAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDS

Query:  D
        D
Subjt:  D
SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04132 Protein SRC17.8e-2266.04Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGG----DHKGEHH----DAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGD
        MSG I KI E LH+GG    +HKGEHH      HKGEHH EHK   K E+HHGE HKEG+++KIKDKIH GDGH  +KGEKKKK+ KKK EHGH+HHG  
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGG----DHKGEHH----DAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGD

Query:  SSSDSD
        SSSDSD
Subjt:  SSSDSD
Q9SLJ2 Dehydrin HIRD118.0e-1153.7Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHK-GEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDG-HHDEKG------EKKKKEKKKKGEHGHEHHGGD
        M+G I KIG+ LHIGG +K GEH      +  +EHKKH   +EH    HKEGI++KIKDKIHGG+G  HD +G      +KKKK+KK+K  H   HH   
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHK-GEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDG-HHDEKG------EKKKKEKKKKGEHGHEHHGGD

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G54410.1 dehydrin family protein5.7e-1253.7Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHK-GEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDG-HHDEKG------EKKKKEKKKKGEHGHEHHGGD
        M+G I KIG+ LHIGG +K GEH      +  +EHKKH   +EH    HKEGI++KIKDKIHGG+G  HD +G      +KKKK+KK+K  H   HH   
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHK-GEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDG-HHDEKG------EKKKKEKKKKGEHGHEHHGGD

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGGATTCATCGAGAAAATTGGCGAGAAGCTCCACATTGGAGGCGATCACAAGGGAGAGCACCACGACGCTCACAAGGGTGAGCATCACGACGAACACAAGAAGCA
CGAGAAGAAAGAGGAGCACCATGGAGAAGGGCACAAGGAAGGGATAATTGAGAAGATCAAGGATAAGATCCATGGGGGGGATGGTCATCATGACGAGAAAGGGGAGAAGA
AGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAGGGTGAGCACGGCCACGAACACCACGGCGGAGATAGCAGCAGCGATAGCGATAGCGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTATTAAAGCAATAAGATAACGTCAATCAAAATCAACGGATACATTTTGGATAAACTGAATTTATTCGTTTCAATTCACCTTTTCCCATCTATAAATTCCCCTTCTTTCC
TTCCCCATTTTCCACAAACACAAGAACGTAACCCCATTCCAAATCCATCATCAACAATCAAAACATGTCGGGATTCATCGAGAAAATTGGCGAGAAGCTCCACATTGGAG
GCGATCACAAGGGAGAGCACCACGACGCTCACAAGGGTGAGCATCACGACGAACACAAGAAGCACGAGAAGAAAGAGGAGCACCATGGAGAAGGGCACAAGGAAGGGATA
ATTGAGAAGATCAAGGATAAGATCCATGGGGGGGATGGTCATCATGACGAGAAAGGGGAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAGGGTGAGCACGGCCACGAACACCA
CGGCGGAGATAGCAGCAGCGATAGCGATAGCGATTGATGGATCAGATCAGCTCGGAATCATTAATTAAGAGGTAGATTGTGTTCCGATCGCGTGTGTTGTGTGTTTAGTA
TAATAATAATAATCTCATGACTCCCTTTTGGTTCAATCCCTCTGTTTCCGATCTACGTTTTTTTGTTTTTAATGTAAGATTGTTATGTACTGTATGTGTGGTGTATAATA
AAGATTAAGAGATTTTATATGATCTTTACCCATTTTCATAAGATCTGTATGGTGATTTTTTCTATTAAGATCAAGAAGATCAGATCGGATATCGATTACGGAAACCGATC
ACTTTTAACTTCTCGGAGAAACAAGAGAAATGCATAAAAATTGGTCGTTGGGACTCTTAAAAAAAGATTATCAAAACAGTTTCACCATTCAATTGTTCACAAATTTATAT
TTTTTTTTAGTCTCATGTGACCTCGTGGCTTCCATGAAAATTTTAATTTAAATAGAATGGACAAAATTTAAAATTTGAAGGAAGTTTGTGAAATGTGGGCTCAATGCTTT
TTTCTAAAAAGATTTTAATGTCTGCCATAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHHDEHKKHEKKEEHHGEGHKEGIIEKIKDKIHGGDGHHDEKGEKKKKEKKKKGEHGHEHHGGDSSSDSDSD