| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0026271.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.4e-135 | 94.57 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
M FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLR++LQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGV V+PAKIEA+T W
Subjt: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
Query: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
RPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRK APFVWSK CEDSFQNLKQKLVTAP+LTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ KVVAYA
Subjt: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
Query: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
SRQLKSHEQNYPTHDLELAA+VFALKIWRHYLY EKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
Subjt: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
|
|
| KAA0042119.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 6.8e-136 | 95.35 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
M FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRM+LQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGV V+PAKIEA+TSW
Subjt: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
Query: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
RPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRK APFVWSK CEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDAS+KGLGCVLMQQ KVVAYA
Subjt: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
Query: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
SRQLKSHEQNYPTHDLELAA+VFALKIWRHYLY EKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
Subjt: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
|
|
| KAA0046049.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.8e-136 | 96.09 | Show/hide |
Query: FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSWPR
FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRM+LQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGV V+PAKIEA+TSW R
Subjt: FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSWPR
Query: PSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYASR
PSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSK CEDSFQNLKQKLVTAP+LTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ KVVAYASR
Subjt: PSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYASR
Query: QLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
QLKSHEQNYPTHDLELAA+VFALKIWRHYLY EKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
Subjt: QLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
|
|
| KAA0048687.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.2e-135 | 94.96 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
M FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRM+LQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGV V+PAKIEA+T W
Subjt: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
Query: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
RPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRK APFVWSK CEDSFQNLKQKLVTAP+LTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ KVVAYA
Subjt: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
Query: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
SRQLKSHEQNYPTHDLELAA+VFALKIWRHYLY EKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
Subjt: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
|
|
| KAA0063718.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.6e-135 | 94.19 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
M FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLR++LQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGV+V+PAKIEA+T W
Subjt: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
Query: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
RPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRK APFVWSK CEDSFQNLKQKLVTAP+LTVPDGSGSFVIYSDASKKGL CVLMQQ KVVAYA
Subjt: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
Query: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
SRQLKSHEQNYPTHDLELAA+VFALKIWRHYLY EKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
Subjt: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SPZ2 Pol protein | 1.6e-135 | 94.57 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
M FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLR++LQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGV V+PAKIEA+T W
Subjt: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
Query: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
RPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRK APFVWSK CEDSFQNLKQKLVTAP+LTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ KVVAYA
Subjt: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
Query: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
SRQLKSHEQNYPTHDLELAA+VFALKIWRHYLY EKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
Subjt: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
|
|
| A0A5A7TLA3 Pol protein | 3.3e-136 | 95.35 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
M FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRM+LQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGV V+PAKIEA+TSW
Subjt: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
Query: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
RPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRK APFVWSK CEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDAS+KGLGCVLMQQ KVVAYA
Subjt: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
Query: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
SRQLKSHEQNYPTHDLELAA+VFALKIWRHYLY EKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
Subjt: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
|
|
| A0A5A7TXS2 Reverse transcriptase | 8.7e-137 | 96.09 | Show/hide |
Query: FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSWPR
FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRM+LQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGV V+PAKIEA+TSW R
Subjt: FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSWPR
Query: PSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYASR
PSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSK CEDSFQNLKQKLVTAP+LTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ KVVAYASR
Subjt: PSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYASR
Query: QLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
QLKSHEQNYPTHDLELAA+VFALKIWRHYLY EKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
Subjt: QLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
|
|
| A0A5A7U330 Reverse transcriptase | 5.7e-136 | 94.96 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
M FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRM+LQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGV V+PAKIEA+T W
Subjt: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
Query: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
RPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRK APFVWSK CEDSFQNLKQKLVTAP+LTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ KVVAYA
Subjt: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
Query: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
SRQLKSHEQNYPTHDLELAA+VFALKIWRHYLY EKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
Subjt: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
|
|
| A0A5A7V810 Reverse transcriptase | 1.3e-135 | 94.19 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
M FGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLR++LQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGV+V+PAKIEA+T W
Subjt: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
Query: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
RPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRK APFVWSK CEDSFQNLKQKLVTAP+LTVPDGSGSFVIYSDASKKGL CVLMQQ KVVAYA
Subjt: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAYA
Query: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
SRQLKSHEQNYPTHDLELAA+VFALKIWRHYLY EKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
Subjt: SRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 2.7e-50 | 40.54 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
MPFGL NAPA F MN + R L+ +V++DDI+++S + EH + L ++ + L L + KCEF ++ +FLGHV++ G+ NP KIEAI +
Subjt: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
Query: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDS-FQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAY
P P+ E+++FLGL GYYR+F+ NF+ IA P+T+ +K + DS F+ LK + PIL VPD + F + +DAS LG VL Q ++Y
Subjt: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDS-FQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAY
Query: ASRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
SR L HE NY T + EL A+V+A K +RHYL +I +DH+ L + + K+ N +
Subjt: ASRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
|
|
| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 7.8e-42 | 35.57 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
MP+G++ APA F +N + E ++ V+ ++DDILI+SK+E+EH +H++ +LQ L++ L +KCEF QV F+G+ +S+ G I+ + W
Subjt: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
Query: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQ-----QVK
+P E+R FLG Y R+F+ S++ PL L +K + W+ T + +N+KQ LV+ P+L D S ++ +DAS +G VL Q +
Subjt: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQ-----QVK
Query: VVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYL--YVEKIQIFTDHKSL
V Y S ++ + NY D E+ A++ +LK WRHYL +E +I TDH++L
Subjt: VVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYL--YVEKIQIFTDHKSL
|
|
| P10401 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon gypsy | 2.2e-44 | 36.53 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
+PFGL NA ++F ++ V RE + V++DD++I+S+ E++H H+ +L+ L D + K F+ + V +LG +VSK G +P K++AI +
Subjt: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
Query: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTR-----------KRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAP-ILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGC
P P V +VRSFLGLA YYR F+++F+ IA P+T + + K+ P +++T ++FQ L+ L + IL PD F + +DAS G+G
Subjt: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTR-----------KRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAP-ILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGC
Query: VLMQQVKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLY-VEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
VL Q+ + + SR LK EQNY T++ EL A+V+AL +++LY +I IFTDH+ L + + N +
Subjt: VLMQQVKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLY-VEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
|
|
| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 1.4e-51 | 40.78 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
MPFGL NAPA F MN + R L+ +V++DDI+I+S + EH ++++ L D L + KCEF K+ +FLGH+V+ G+ NP K++AI S+
Subjt: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
Query: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSK-TCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAY
P P+ E+R+FLGL GYYR+F+ N++ IA P+T +KR K ++F+ LK ++ PIL +PD FV+ +DAS LG VL Q +++
Subjt: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKRAPFVWSK-TCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQVKVVAY
Query: ASRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKE
SR L HE NY + EL A+V+A K +RHYL + I +DH+ L++ KE
Subjt: ASRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLYVEKIQIFTDHKSLKYFFTQKE
|
|
| Q8I7P9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus | 9.2e-43 | 34.31 | Show/hide |
Query: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
+PFGL NAPA+F +++ + RE + V+IDDI+++S+ H ++LR++L +L L K F QV FLG++V+ G+ +P K+ AI+
Subjt: MPFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMILQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVFVNPAKIEAITSW
Query: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTR-----------KRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCV
P P++V E++ FLG+ YYR+F+++++++A PLT LTR + P +T SF +LK L ++ IL P + F + +DAS +G V
Subjt: PRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTR-----------KRAPFVWSKTCEDSFQNLKQKLVTAPILTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCV
Query: LMQ----QVKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLY-VEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
L Q + + +AY SR L E+NY T + E+ A++++L R YLY I+++TDH+ L + + N +
Subjt: LMQ----QVKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAMVFALKIWRHYLY-VEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMR
|
|
