; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc05g0138541 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc05g0138541
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationCMiso1.1chr05:22886381..22888088
RNA-Seq ExpressionCmc05g0138541
SyntenyCmc05g0138541
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055589.1 hypothetical protein E6C27_scaffold222G00710 [Cucumis melo var. makuwa]2.9e-14798.32Show/hide
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KAE8652471.1 hypothetical protein Csa_014189 [Cucumis sativus]3.2e-13891.23Show/hide
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        EFRHVFSESRNDAFSLLRLRAAFFLPIYAFSLFLAVSTVSSTLLSF SKRPSLKS+LSGFK SWTRPLVTTICIY ILVAYSIVPNTLASISPSPA RFV
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        VLVFG+VFEVYLISI SLGLVVSIAEERFGFDAIRYAA LMADRRLSGSILTAMFL  SSLISSEMEGLMDGVDHWMRSTAAVTTNVAVSVGDKIGLISL
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        YGMVIIFG
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KAG6598865.1 hypothetical protein SDJN03_08643, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.5e-11480.74Show/hide
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        AFSLLRLRAAFFLPIY FSL  A STVS T LSF +KRP+LKS ++  KNSW RPLVTTICIY ILVAYSIVPNTLASIS SPA+RF +LV GV+FEVYL
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        I+I+SLGLVVSIAEERFGFDAIR AAALMADRRLSGSILTAMFL ASS IS EMEGLMDGVDHWMR+TAAVT+NVA+ V DK+GLISLYGMVII G
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XP_022997441.1 uncharacterized protein LOC111492360 [Cucurbita maxima]7.2e-11481.08Show/hide
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        AFSLLRLRAAFFLPIYAFSL  A STVS T  SF +KRP+LKS ++  KNSW RPLVTTICIY ILVAYSIVPNTLASIS SPALRF +LV GV+FEVYL
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        I+++SLGLVVSIAEERFGFDAIR AAALMADRRLSGSILTAMFL ASS IS EMEGLMDGVDHWMR+TAAVT+NVA+ V DK+GLISLYGMVII G
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XP_038889309.1 uncharacterized protein LOC120079221 [Benincasa hispida]2.3e-12887.76Show/hide
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        MSEREDSP  HHP  P ESLC  FFFKIL HSLQIFSRNKRHF S+FL LSLPLSLLLFTLSLSSHPLKSHILHLESVLRHSPTRFEFRHVFSESRNDAF
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        SLLRLRAAFF PIYA SLFLA++TVSSTLLSFQSKRPSLKSAL+GFKN+WTRPLVTTICIY ILVAYS++PNTLASISPS  LRFVVLVFGVVFEVYLIS
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        I+SL LVVSIAE+RFGFDAIR AA LMADR+L GSILTAMFL ASS ISSEMEGLMDGVDHWMRSTAAVT+NV + VGDKIGLISLYGMVII G
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A251QV24 Uncharacterized protein9.7e-6453.36Show/hide
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        K L  SL+IF RNK  F+SIF L +LPLS LLF+LSLSSHPLKSHI HLES+ R +PTRFE R V+ ESR+DA SLLR++A FFLP YA SL  +V+ V+
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Query:  STLLSFQSKRPSLKSALSGFKNSWTRPLVTTICIYTILVAYSIVPNTLASISPSPALRFVVLVFGVVFEVYLISIMSLGLVVSIAEERFGFDAIRYAAAL
        +T  SF  KRP L+S+L+  K +W RPLVT+ICIY + +AY++VP TL+ +  S   RF +LV G   E+YL++++ LGLV SI EERFG+DAIR   AL
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Query:  MADRRLSGSILTAMFLFASSLISSEMEGLMDGVDHWMRSTAAVTTNVAVSVGDKIGLISLYGMVIIFG
        MA +RL G  L+ +F+F + +++ ++E +MDG D    S+ A  T V V + DK+G + LYG+V+++G
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A0A2P5BBB7 Transmembrane protein9.7e-6451.33Show/hide
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        MSER+D    PHH    ++  S     C    KIL  SL+IF RNK+ FLSIF L +LPLS LLF+LSLSSH LKS I HLE +   +PTRFE RHV+ E
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Query:  SRNDAFSLLRLRAAFFLPIYAFSLFLAVSTVSSTLLSFQSKRPSLKSALSGFKNSWTRPLVTTICIYTILVAYSIVPNTLASISPSPALRFVVLVFGVVF
        SR DA S+LR +A FFLP YA SL  AV++VSS  L+   KRP+L+SA++  K +W RPLVT+I ++ +L+AY +   TL+++ PS A R ++L+ G   
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Query:  EVYLISIMSLGLVVSIAEERFGFDAIRYAAALMADRRLSGSILTAMFLFASSLISSEMEGLMDGVDHWMRSTAAVTTNVAVSVGDKIGLISLYGMVIIFG
        E+YL+++MSLGLVVSIAEERFG++AIR  + LM  RR+SG +L+ MF+  +  I+ E+E +M+G D + R ++ V   VA  VGDK+GLI LYG V+++G
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A0A5A7UQ45 Uncharacterized protein1.4e-14798.32Show/hide
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        MSEREDSPHHHH     PPSPRESLCFFFKILFHSLQIFSRNKRHFLSIFLLLSLPLSLLLFTLSLSSHPLKSHILHLESVLRHSPTRFEFRHVFSESRN
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Query:  DAFSLLRLRAAFFLPIYAFSLFLAVSTVSSTLLSFQSKRPSLKSALSGFKNSWTRPLVTTICIYTILVAYSIVPNTLASISPSPALRFVVLVFGVVFEVY
        DAFSLLRLRAAFFLPIYAFSLFLAVSTVSSTLLSFQSKRPSLKSALSGFKNSWTRPLVTTICIYTILVAYSIVPNTLASISPSPALRFVVLVFGVVFEVY
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Query:  LISIMSLGLVVSIAEERFGFDAIRYAAALMADRRLSGSILTAMFLFASSLISSEMEGLMDGVDHWMRSTAAVTTNVAVSVGDKIGLISLYGMVIIFG
        LISIMSLGLVVSIAEERFGFDAIRYAAALMADRRLSGSILTAMFLFASSLISSEMEGLMDGVDHWMRSTAAVTTNVAVSVGDKIGLISLYGMVIIFG
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A0A6J1K518 uncharacterized protein LOC1114923603.5e-11481.08Show/hide
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        MSER+DS  HH      ESLCFF    FKILF+SLQIFSRNKR FLSIF   +LPLSLLLF LSLSSHPLKSHILHLESVLRHSPTRFEFRHVFSESR+D
Subjt:  MSEREDSPHHHHPPSPRESLCFF----FKILFHSLQIFSRNKRHFLSIFLLLSLPLSLLLFTLSLSSHPLKSHILHLESVLRHSPTRFEFRHVFSESRND

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        AFSLLRLRAAFFLPIYAFSL  A STVS T  SF +KRP+LKS ++  KNSW RPLVTTICIY ILVAYSIVPNTLASIS SPALRF +LV GV+FEVYL
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Query:  ISIMSLGLVVSIAEERFGFDAIRYAAALMADRRLSGSILTAMFLFASSLISSEMEGLMDGVDHWMRSTAAVTTNVAVSVGDKIGLISLYGMVIIFG
        I+++SLGLVVSIAEERFGFDAIR AAALMADRRLSGSILTAMFL ASS IS EMEGLMDGVDHWMR+TAAVT+NVA+ V DK+GLISLYGMVII G
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A0A6J5VZ77 Uncharacterized protein2.2e-6353.36Show/hide
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        K L  SL+IF RNK+ F+SIF L +LPLS LLF+LSLSSHPLKSHI HLES+ R SPTRFE R V+ ESR+DA SLLR++A FFLP YA SL  +V+ V+
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Query:  STLLSFQSKRPSLKSALSGFKNSWTRPLVTTICIYTILVAYSIVPNTLASISPSPALRFVVLVFGVVFEVYLISIMSLGLVVSIAEERFGFDAIRYAAAL
        +T  SF  KRP L+S+L+  K +W RPLVT+ICIY + +AY+ VP TL+ +  S   RF +LV G   E+YL++++ LGLV SI EERF +DAIR   AL
Subjt:  STLLSFQSKRPSLKSALSGFKNSWTRPLVTTICIYTILVAYSIVPNTLASISPSPALRFVVLVFGVVFEVYLISIMSLGLVVSIAEERFGFDAIRYAAAL

Query:  MADRRLSGSILTAMFLFASSLISSEMEGLMDGVDHWMRSTAAVTTNVAVSVGDKIGLISLYGMVIIFG
        MA +RL G  L+ +F+F + +++ ++E +MDG D    S+ A  T V V + DK+G + LYG+V+++G
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G16850.1 unknown protein2.0e-3737.74Show/hide
Query:  LFHSLQIFSRNKRHFLSIFLLLSLPLSLLLFTLSLSSHPLKSHILHLESVLRHSPTRFEFRHVFSESRNDAFSLLRLRAAFFLPIYAFSLFLAVSTVSST
        L  S  I  RNK   L IF  +++PL+ L  +L+L+S  LK+H+  LE++     TRFE R ++ ESR DA SLL L+  +F+P +  S   +++ ++ST
Subjt:  LFHSLQIFSRNKRHFLSIFLLLSLPLSLLLFTLSLSSHPLKSHILHLESVLRHSPTRFEFRHVFSESRNDAFSLLRLRAAFFLPIYAFSLFLAVSTVSST

Query:  LLSFQSKRPSLKSALSGFKNSWTRPLVTTICIYTILVAYSIVPNTL-ASISPSPALRFVVLVFGVVFEVYLISIMSLGLVVSIAEERFGFDAIRYAAALM
          S Q   PSLKS+ +  K+SW R   T+I +Y +L  YS +   L A +  +P LR+++ +  +  EVY+++I  LG VVS+ EER+GFDAI+   ALM
Subjt:  LLSFQSKRPSLKSALSGFKNSWTRPLVTTICIYTILVAYSIVPNTL-ASISPSPALRFVVLVFGVVFEVYLISIMSLGLVVSIAEERFGFDAIRYAAALM

Query:  ADRRLSGSILTAMFLFASSLISSEMEGLMDGVDHWMRSTAAVTTNVAVSVGDKIGLISLYGMVII
          RR++G  L  +F+F SS I   ME L   +D  + S +   + V     D   L+ +YG  ++
Subjt:  ADRRLSGSILTAMFLFASSLISSEMEGLMDGVDHWMRSTAAVTTNVAVSVGDKIGLISLYGMVII


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTGAAAGAGAAGACTCTCCTCATCATCATCATCCTCCTTCTCCTCGTGAATCTCTCTGTTTCTTCTTCAAAATCCTTTTCCATTCCCTTCAAATCTTCTCCAGAAA
CAAACGCCATTTCCTCTCCATCTTTCTCCTCCTCTCCCTCCCTCTCTCTCTCCTCCTCTTCACCCTTTCTCTCTCCTCTCACCCTCTCAAATCCCACATCCTCCACCTCG
AATCCGTCCTCCGCCATTCCCCCACCCGTTTCGAGTTCCGTCATGTCTTCTCCGAGTCCCGTAACGACGCTTTCTCCCTCCTCCGTCTTCGTGCCGCCTTCTTTCTCCCC
ATCTACGCCTTTTCCCTCTTCCTCGCTGTCTCCACCGTCTCCTCCACTCTTCTCTCCTTCCAATCCAAACGCCCTTCTCTCAAATCCGCTCTCTCCGGCTTCAAAAACTC
CTGGACTCGTCCTCTTGTTACCACGATTTGCATCTACACGATTCTCGTAGCCTACTCTATTGTGCCTAACACGCTCGCTTCGATTTCTCCGTCTCCGGCTTTGAGGTTTG
TGGTTTTGGTGTTTGGCGTTGTTTTCGAGGTGTATTTGATTTCAATTATGAGTTTAGGGCTTGTTGTTTCGATTGCCGAAGAGAGATTTGGTTTTGATGCGATTCGTTAT
GCGGCGGCGTTGATGGCGGATCGGAGATTGAGTGGTTCGATTCTTACAGCGATGTTTCTTTTTGCGTCGAGTTTGATCTCGTCGGAGATGGAGGGGCTTATGGATGGGGT
CGATCATTGGATGAGATCGACGGCGGCGGTGACGACGAATGTGGCGGTGAGCGTTGGGGATAAGATCGGGTTAATTTCTTTGTACGGTATGGTAATTATTTTCGGAATTT
ATAGAAAGTGGTTCTCGATTTCTACCCACGTGGCATCACGTTTTACCCCTACTACACATTGGAGAAAGGAACTCGCGAACCTGGAATCATGGATCAAGTCCACAATTTCT
ATATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAAATGAAGTGTAAAAGTGATTGAATTCTAGGGTTTGTTTCAATTGAATAAACGGTTAAAAGAACAAAAAAATAAACGAACGGCCAAAGAAAAAAAAGCTTAAAAA
AGGAAAGAGAAAGGGAAGGAAAATCGGAGGAAAAAGAAAATGTCTGAAAGAGAAGACTCTCCTCATCATCATCATCCTCCTTCTCCTCGTGAATCTCTCTGTTTCTTCTT
CAAAATCCTTTTCCATTCCCTTCAAATCTTCTCCAGAAACAAACGCCATTTCCTCTCCATCTTTCTCCTCCTCTCCCTCCCTCTCTCTCTCCTCCTCTTCACCCTTTCTC
TCTCCTCTCACCCTCTCAAATCCCACATCCTCCACCTCGAATCCGTCCTCCGCCATTCCCCCACCCGTTTCGAGTTCCGTCATGTCTTCTCCGAGTCCCGTAACGACGCT
TTCTCCCTCCTCCGTCTTCGTGCCGCCTTCTTTCTCCCCATCTACGCCTTTTCCCTCTTCCTCGCTGTCTCCACCGTCTCCTCCACTCTTCTCTCCTTCCAATCCAAACG
CCCTTCTCTCAAATCCGCTCTCTCCGGCTTCAAAAACTCCTGGACTCGTCCTCTTGTTACCACGATTTGCATCTACACGATTCTCGTAGCCTACTCTATTGTGCCTAACA
CGCTCGCTTCGATTTCTCCGTCTCCGGCTTTGAGGTTTGTGGTTTTGGTGTTTGGCGTTGTTTTCGAGGTGTATTTGATTTCAATTATGAGTTTAGGGCTTGTTGTTTCG
ATTGCCGAAGAGAGATTTGGTTTTGATGCGATTCGTTATGCGGCGGCGTTGATGGCGGATCGGAGATTGAGTGGTTCGATTCTTACAGCGATGTTTCTTTTTGCGTCGAG
TTTGATCTCGTCGGAGATGGAGGGGCTTATGGATGGGGTCGATCATTGGATGAGATCGACGGCGGCGGTGACGACGAATGTGGCGGTGAGCGTTGGGGATAAGATCGGGT
TAATTTCTTTGTACGGTATGGTAATTATTTTCGGAATTTATAGAAAGTGGTTCTCGATTTCTACCCACGTGGCATCACGTTTTACCCCTACTACACATTGGAGAAAGGAA
CTCGCGAACCTGGAATCATGGATCAAGTCCACAATTTCTATATAGAATTTATAAATTTTGTTACCTATTAGTTGGTTTTTTGTCATCATCAATGAATACCCATCTTCTAT
CTTGAGTTCAATTTCTTGCAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSEREDSPHHHHPPSPRESLCFFFKILFHSLQIFSRNKRHFLSIFLLLSLPLSLLLFTLSLSSHPLKSHILHLESVLRHSPTRFEFRHVFSESRNDAFSLLRLRAAFFLP
IYAFSLFLAVSTVSSTLLSFQSKRPSLKSALSGFKNSWTRPLVTTICIYTILVAYSIVPNTLASISPSPALRFVVLVFGVVFEVYLISIMSLGLVVSIAEERFGFDAIRY
AAALMADRRLSGSILTAMFLFASSLISSEMEGLMDGVDHWMRSTAAVTTNVAVSVGDKIGLISLYGMVIIFGIYRKWFSISTHVASRFTPTTHWRKELANLESWIKSTIS
I