; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc05g0143861 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc05g0143861
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionSerine-rich protein-like protein
Genome locationCMiso1.1chr05:27309457..27313633
RNA-Seq ExpressionCmc05g0143861
SyntenyCmc05g0143861
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063558.1 putative serine-rich protein C215.13-like protein [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-57100Show/hide
Query:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
        MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
Subjt:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ

Query:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
Subjt:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

XP_016902457.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496492 [Cucumis melo]9.1e-5799.22Show/hide
Query:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
        MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSS RSGGTNRVVQ
Subjt:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ

Query:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
Subjt:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

XP_022965947.1 uncharacterized protein LOC111465673 [Cucurbita maxima]4.0e-4484.38Show/hide
Query:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
        MAATSRRS+ SVLRS SPS RFYG+R SS SAFASSTS+FSS SATSFFCRSTSPSRV +HGS SVSVPSVRF +DRA SPNRSVSV SSRS G N+VV+
Subjt:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ

Query:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
Subjt:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

XP_031737100.1 uncharacterized protein LOC101209679 [Cucumis sativus]5.4e-5799.22Show/hide
Query:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
        MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
Subjt:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ

Query:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        RQSS+KRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
Subjt:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

XP_038890503.1 uncharacterized protein LOC120080038 [Benincasa hispida]1.7e-5092.19Show/hide
Query:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
        MAATSRRS+ASVLRSLSPSGRFYG+R+SSSSAFASS+S+FSS SATSFFCRSTSPSRV LHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSV SSRSGG++RVVQ
Subjt:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ

Query:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
Subjt:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LL69 Uncharacterized protein2.6e-5799.22Show/hide
Query:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
        MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
Subjt:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ

Query:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        RQSS+KRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
Subjt:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

A0A1S4E2K6 uncharacterized protein LOC1034964924.4e-5799.22Show/hide
Query:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
        MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSS RSGGTNRVVQ
Subjt:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ

Query:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
Subjt:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

A0A5A7V7K3 Putative serine-rich protein C215.13-like protein1.2e-57100Show/hide
Query:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
        MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
Subjt:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ

Query:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
Subjt:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

A0A6J1FCB9 uncharacterized protein LOC1114441072.5e-4483.59Show/hide
Query:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
        MAATSRRS+ SVLRS SPS RFYG+R SS SAFASSTS+FSS SATSFFCRSTSPSRV +HGS SVSVPSVRF +DRA SPNRSVSV SSR GG N+VV+
Subjt:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ

Query:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        RQ+SSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
Subjt:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

A0A6J1HLP3 uncharacterized protein LOC1114656731.9e-4484.38Show/hide
Query:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ
        MAATSRRS+ SVLRS SPS RFYG+R SS SAFASSTS+FSS SATSFFCRSTSPSRV +HGS SVSVPSVRF +DRA SPNRSVSV SSRS G N+VV+
Subjt:  MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQ

Query:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
Subjt:  RQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G67910.1 unknown protein3.0e-0548.57Show/hide
Query:  GTNRVVQRQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        G+  + ++ S +K  C+CSPTTHPGSFRC +H+ +
Subjt:  GTNRVVQRQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

AT1G67910.2 unknown protein3.0e-0548.57Show/hide
Query:  GTNRVVQRQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        G+  + ++ S +K  C+CSPTTHPGSFRC +H+ +
Subjt:  GTNRVVQRQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

AT5G11090.1 serine-rich protein-related2.0e-1748.32Show/hide
Query:  MAATSRR--SSASVLRSLSPSGRFYGH-----RTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFC------------RSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLD-RATS
        M  TS R  S+  VLRS SPSGRF G       +SSSSAFASSTS+  S  +++FF             RS SP+RVNL+ +  +S  S R+SLD R+ S
Subjt:  MAATSRR--SSASVLRSLSPSGRFYGH-----RTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFC------------RSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLD-RATS

Query:  P-NRSVSVSSSRSGGTNRVVQRQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        P N+S+SVS ++    N  + R+      CMCSPTTHPGSFRCSLHK +
Subjt:  P-NRSVSVSSSRSGGTNRVVQRQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

AT5G25280.1 serine-rich protein-related1.1e-1846.85Show/hide
Query:  TSRRSSASVLRSLSPSGRFYG-------HRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFC----------RSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLD-RATSPNRSV
        T+R + ++ LRS SPSGRF G         + SSS FASSTS+  S  +T+FF           RS SP+RVNL  S  ++  S R+S+D R+ SPNRS+
Subjt:  TSRRSSASVLRSLSPSGRFYG-------HRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFC----------RSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLD-RATSPNRSV

Query:  SVSSSRSGGTNRVVQRQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        +VSS++    +++      S+R CMCSPTTHPGSFRCSLHK +
Subjt:  SVSSSRSGGTNRVVQRQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI

AT5G25280.2 serine-rich protein-related1.1e-1846.85Show/hide
Query:  TSRRSSASVLRSLSPSGRFYG-------HRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFC----------RSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLD-RATSPNRSV
        T+R + ++ LRS SPSGRF G         + SSS FASSTS+  S  +T+FF           RS SP+RVNL  S  ++  S R+S+D R+ SPNRS+
Subjt:  TSRRSSASVLRSLSPSGRFYG-------HRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFC----------RSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLD-RATSPNRSV

Query:  SVSSSRSGGTNRVVQRQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI
        +VSS++    +++      S+R CMCSPTTHPGSFRCSLHK +
Subjt:  SVSSSRSGGTNRVVQRQSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCAACTTCCCGAAGATCAAGCGCATCAGTTCTCAGGTCCCTCTCACCGTCCGGAAGATTCTACGGTCATCGGACTTCATCTTCCTCCGCCTTCGCATCCTCCAC
CTCCACTTTCTCCTCCAGATCCGCCACTTCCTTCTTCTGCAGATCAACTTCCCCCTCGCGTGTGAACCTCCACGGTTCGCCTTCGGTTTCCGTTCCCTCCGTGCGGTTTT
CTCTTGACCGTGCGACCTCTCCGAACAGATCCGTCTCTGTTTCTTCTTCTCGCAGCGGTGGAACTAATCGTGTTGTGCAGAGACAGAGCAGTTCGAAGAGGACGTGTATG
TGTTCTCCTACAACTCACCCTGGCTCGTTCCGGTGTAGTCTCCATAAAGGGATATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTGGAGTTGTTTTAGCGTTGAATCCCTATAAATACATAGTGGGAGTGAAGACGGGTTTGCCAAACTCAGCAGCCGAACGCGGCCTATAAGGCTTTTAGACTACAAAGCT
TAGATTCATTCCCCCTTCTATTCCCTCTCTTCTACGACCAAAATGGCGGCAACTTCCCGAAGATCAAGCGCATCAGTTCTCAGGTCCCTCTCACCGTCCGGAAGATTCTA
CGGTCATCGGACTTCATCTTCCTCCGCCTTCGCATCCTCCACCTCCACTTTCTCCTCCAGATCCGCCACTTCCTTCTTCTGCAGATCAACTTCCCCCTCGCGTGTGAACC
TCCACGGTTCGCCTTCGGTTTCCGTTCCCTCCGTGCGGTTTTCTCTTGACCGTGCGACCTCTCCGAACAGATCCGTCTCTGTTTCTTCTTCTCGCAGCGGTGGAACTAAT
CGTGTTGTGCAGAGACAGAGCAGTTCGAAGAGGACGTGTATGTGTTCTCCTACAACTCACCCTGGCTCGTTCCGGTGTAGTCTCCATAAAGGGATATGATTGGATTGATT
CTCGGCAGCCATGGATGTGGATTCTTATTATTGTTTTTAGCAACAAATACTTCAAAATGGAGATTTCTTTTTTGTTTTCTTAAATCTTCACTTTGCCTTTTATGTTCCTC
TTAACATCTGTTTTTGGTTCTTGAATTTATTTGTTTTCCTTAGAAAGAAATTTCACATGTTTTGTTGATAGTAAATCTGGTCCCTTATTTTTAAATGTTATTCTTTTAAT
GATTTTAGAGGAAAATTACTCAAAGTTTTGAAGAATACGGTCCTTAGTTTTGAAATGGATCTTTTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTCGAGTGAACCGATCCTGAGTTTTCAA
TTCTATATTTTTAGTTTTGAGGTTTCAAAATTTGATTTAAAATGGATGAACTAATTTAGGAATAAGGTTTTGTGTTTCTAGTGGTATTTTTAGGGGTTTTGAAAAAATGT
AACACACCAATATATTTTGCAAACGGAAAAAGTCTACGCCACGTTGGAAACAATATCTTTTTATATTTGTTGAGGTTTAAATTTTTATATTTTTGGTATGGAATATTTAG
AAAAATAAATGAGAAAAAAATGTAAACGAATGGAAATTTTTGGAATATTTAAAGAAATAAATGGAAAAAAAAAAAAGAGATGGGAAGGAAGTACATATTTAGAAAAAATA
AATAGGACGAAAAAGAGACCACTTGGAATATTTAGAAAAAATAAATAAGAAGAAAAAGAGAAACTTGAATATTTAGAGAAAATAAACGAGAAGAAAAAAGAAAAATAAAT
TAAAAAGAAAAATAAAAGAGAAAAATAAAAACTAAAAGAAGGATAAATTTGAAATGTTTAAAGAAAATAATTGAGAAAAAAATTATATGAAACGGAAGATCAAATTTTAA
ATATTTAAAAAAATATGGTCTCTTTTCATGTGATTTTTTTGTTTTGTTAGATTAAATATTTTGATATTTGGTGTATTTAGGAAAATTATTTTTTTCTATTAGCCTTTGAT
CAAATATTTACGAAATTATTTTGAAAATAAAAAAATTATATAGTACAATTTTGAAAATATAGTAAAGAGAAATTTTAAAATAAAAAAGTACTGTATAGATAATTTCAAAA
ATGAAAAAAATACTATATAAAATAATTTTGAAAATATAAAAAGTTTACGAATCTAATAGAAAATACAGAAAATGTTAATTTAAAAAATAGAAAAAGTTGGAATACCTATA
ATAGAAAATACTTACTATCTTTTATTTAGCTACTTTTTAAGTTTATATTTGACTATCCAAATCTAAACGATATTTTTTTAAATTCTTTTATAATAAATAATAATTTAAGA
AAAAAAAAAGAAAAAGACATGAAAAGAAAAAAATAAACGATATTTTTTTAAATTCTTTTATAATAAATAATAATTTAAGAAAAAAAAAAGAAAAAGACATGAAAAGAAAA
AAATAATTAGAAAATGAGAAAGAAAAATGATAAAAGAAAAGAAAAACCTCAAACATTTTAAAAATTGTTAATTTCATGAATTATGTTACATAGATGAAGTCGTAAATATT
TTATACGAAAATTTTTACTATTTTATTTGTATTTTTTTATTATTGTTGCAAAAATTTCCAACATTTGTATTAAATAACTATATATATATATTAAAGGAATAGCTTCTTGA
AAATCAAACTAATTTATCTCAATTTTACCCAACTCTTCAAAAGCTTAAAAAACAAAAATGAAATCTTTTATATATTCATATAAAGACTATGGAGCCTAAATTTTAAAACC
CAATGAAAAAAGAAGCCTTTGGAAACTTAAAAAAACAAATGTTTAAACTTTACCTTTTGATAACTTAAAAAAGTAAAAAATTTATACTTAGAGTTTATATTAATAAAAAA
ATTTATTTTCATTGTTTAATCATTTAAAAAATATGGATAAAAGATAATTAAAAATGAGTGGTGGTCAAAAGCCTTTACTACTCTCATTAAAGTCTTCTTTTGAAAGGAAA
GAGACCTAAACCCTTTTTATTTTTCAATTAGGAGATAACAAACAAGAAAAAAATGTCCACACAACCCCCCAAGAGGTCCAAAGGGTTAACACAGACATTCATCATCCCCA
AAAACATACACTTTACTAAGGATAATGATCATATGATAAAATGATAATTTACTTTAGTATATTATTTCTAAAATAATTTGATTTAATTAATTTGTATATTCTTTTTGCAA
TAATGAAAGGTGTCACAATCAATCATAGTAAAGAAGGTGGGGGGGGGGGGGGCCCTGCCCTCCACGTCACCTACAATCATCTATTGATAAGTTTTTCCCTTTTCTTTTTT
TGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTGGATTATAATAATTTACTTTGGAAAAAGAAAAGTGTGGATAAGGCACTCAAAATGTGGGACTTTCAATAATACAATATGGCTTCTCTTT
CTTTCTATTATTCTTATTGGATGTTTTCACTTTTATTCTTATTTTTAATTCTAAAAACAAAAGACTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT
TTATATATGTTGAAAAATATGATTGAACCTTTTAATTGGTCTGTTTCCTTTGAGGCAAGGATTATTCGAACTATAATAACTCATTATTATCGGATTAAAATTTATTTTAT
ATTTTACAATTAGCTATGCTGCTAATACCATTTCAGAACTTTTTGTTCATTGTTTTTATTATTTATCACATATGTTTACTATTTCTTTATTAAACTAAAATAGTTTAAAC
TTTGAACATATATTTTTGTAATTCAAACTAAAAAAAATTGACATTTAAAATACAAACTATTACAACTAAATTATAATAATTGAAATCTATAATAACCAATTATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQRQSSSKRTCM
CSPTTHPGSFRCSLHKGI