| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AAO45752.1 pol protein [Cucumis melo subsp. melo] | 4.0e-131 | 96.72 | Show/hide |
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| KAA0048687.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.1e-131 | 97.13 | Show/hide |
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| KAA0058399.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.1e-131 | 97.13 | Show/hide |
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| KAA0060847.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.0e-131 | 97.13 | Show/hide |
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| TYK01613.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 8.1e-132 | 97.54 | Show/hide |
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|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7U330 Reverse transcriptase | 1.5e-131 | 97.13 | Show/hide |
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|
| A0A5A7UY04 Reverse transcriptase | 1.5e-131 | 97.13 | Show/hide |
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|
| A0A5A7V1X7 Pol protein | 2.0e-131 | 97.13 | Show/hide |
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|
|
| A0A5D3BPI1 Reverse transcriptase | 3.9e-132 | 97.54 | Show/hide |
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|
|
| Q84KB0 Pol protein | 2.0e-131 | 96.72 | Show/hide |
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EHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKGAPF
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VWSKACEDSFQTLKQKLVTAPVLTVPDGSG+FVIYSDASKKGLG
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 3.8e-47 | 37.65 | Show/hide |
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+P +D++ +L F+ IDL G+HQ+ + E + KTAF +++GHYE++ M FGL NAPA F MN + R L+ +V++DDI+++S + EH +
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L +V + L L + KCEF ++ +FLGHV++ G+ +P KIEA+ + P+ E+++FLGL GYYR+F+ NF+ IA P+T+ +K +
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DS F+ LK + P+L VPD + F + +DAS LG G
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|
|
| P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein | 1.7e-44 | 37.24 | Show/hide |
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LP I+ L ++QG+T+F+K+DL+S YH +R+++ D K AFR G +E++VM +G++ APA F +N + E ++ V+ ++DDILI+SK+E+EH +H
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Query: LRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKGAPFVWSKA
++ VLQ L++ L +KCEF QV F+G+ +S+ G + I+ V W +P E+R FLG Y R+F+ S++ PL L +K + W+
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Query: CEDSFQTLKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLG
+ + +KQ LV+ PVL D S ++ +DAS +G
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|
|
| P0CT35 Transposon Tf2-2 polyprotein | 1.7e-44 | 37.24 | Show/hide |
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LP I+ L ++QG+T+F+K+DL+S YH +R+++ D K AFR G +E++VM +G++ APA F +N + E ++ V+ ++DDILI+SK+E+EH +H
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++ VLQ L++ L +KCEF QV F+G+ +S+ G + I+ V W +P E+R FLG Y R+F+ S++ PL L +K + W+
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Query: CEDSFQTLKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLG
+ + +KQ LV+ PVL D S ++ +DAS +G
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|
|
| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 1.7e-44 | 37.24 | Show/hide |
Query: LPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKEEDIPKTAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEH
LP I+ L ++QG+T+F+K+DL+S YH +R+++ D K AFR G +E++VM +G++ APA F +N + E ++ V+ ++DDILI+SK+E+EH +H
Subjt: LPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKEEDIPKTAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEH
Query: LRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKGAPFVWSKA
++ VLQ L++ L +KCEF QV F+G+ +S+ G + I+ V W +P E+R FLG Y R+F+ S++ PL L +K + W+
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Query: CEDSFQTLKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLG
+ + +KQ LV+ PVL D S ++ +DAS +G
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|
|
| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 3.1e-49 | 37.45 | Show/hide |
Query: EQISLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKEEDIPKTAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAE
++ +P +D++ +L F+ IDL G+HQ+ + EE I KTAF ++ GHYE++ M FGL NAPA F MN + R L+ +V++DDI+I+S + E
Subjt: EQISLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKEEDIPKTAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPAVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAE
Query: HEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKGAPFV
H +++V L D L + KCEF K+ +FLGH+V+ G+ +P K++A+ + P+ E+R+FLGL GYYR+F+ N++ IA P+T +K
Subjt: HEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVSVDPAKIEAVTGWTRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKGAPFV
Query: WSK-ACEDSFQTLKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGLCFDAAG
K ++F+ LK ++ P+L +PD FV+ +DAS LG G
Subjt: WSK-ACEDSFQTLKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGLCFDAAG
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