; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc06g0165921 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc06g0165921
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionReverse transcriptase
Genome locationCMiso1.1chr06:17995884..17996381
RNA-Seq ExpressionCmc06g0165921
SyntenyCmc06g0165921
Gene Ontology termsGO:0006278 - RNA-dependent DNA biosynthetic process (biological process)
GO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0015074 - DNA integration (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0003964 - RNA-directed DNA polymerase activity (molecular function)
GO:0004190 - aspartic-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001584 - Integrase, catalytic core
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily
IPR036397 - Ribonuclease H superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TXQ9 DNA/RNA polymerases superfamily protein2.9e-7799.31Show/hide
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A0A5A7U2V7 Reverse transcriptase2.9e-6990.48Show/hide
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A0A5D3BHI1 Reverse transcriptase2.9e-6990.48Show/hide
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A0A5D3BS67 Reverse transcriptase2.9e-6990.48Show/hide
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A0A5D3DXZ3 DNA/RNA polymerases superfamily protein2.9e-7799.31Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein8.9e-2335.97Show/hide
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P0CT35 Transposon Tf2-2 polyprotein8.9e-2335.97Show/hide
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P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein8.9e-2335.97Show/hide
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Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein3.0e-2344.03Show/hide
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Q9UR07 Transposon Tf2-11 polyprotein8.9e-2335.97Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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