| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
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| KAA0035938.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.5e-86 | 87.71 | Show/hide |
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FT+IW+V+DRLTKSAHF+ GKSTYTASKWAQLY++EIVRLH VPVSIVSDRD FTSKF KGLQ A+GTRLDFSTAFHP
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| KAA0047038.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.2e-86 | 87.15 | Show/hide |
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RLCVP DSA+KTELL+EAHSSPF MHPGSTKMYQDLKRVY WCNMKREVAEFVS+CLVCQQVKAPRQKP GLLQPLS+PEWK ENVS DFITGLPRTLRG
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FT+IW+V+DRLTKSAHF+ GKSTYTASKWAQLY++EIVRLH VPVSIVSDRD FTSKF KGLQ A+GTRLDFSTAFHP
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| KAA0048561.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.9e-93 | 96.11 | Show/hide |
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MRLCVPVDSAVKTELLTEAHSSPFFMHPGSTKMYQDLKRVY WCNMKREVAEFVSKCLVCQQVKAPRQKP GLLQPLSVPEWKLENVSTDFITGLPRTLR
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| KAA0051368.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.0e-85 | 87.71 | Show/hide |
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FT+IW+V+DRLTKSAHF+ GKSTYTASKWAQLY++EIVRLH VPVSIVSDRD FTSKF KGLQ A+GTRLDFSTAFHP
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| TYK01613.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.0e-85 | 87.71 | Show/hide |
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FT+IW+V+DRLTKSAHF+ GKSTYTASKWAQLY++EIVRLH VPVSIVSDRD FTSKF KGLQ A+GTRLDFSTAFHP
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SZD6 Pol protein | 2.2e-86 | 87.71 | Show/hide |
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| A0A5A7TVX7 Reverse transcriptase | 5.8e-87 | 87.15 | Show/hide |
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FT+IW+V+DRLTKSAHF+ GKSTYTASKWAQLY++EIVRLH VPVSIVSDRD FTSKF KGLQ A+GTRLDFSTAFHP
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| A0A5A7U4R1 Ty3-gypsy retrotransposon protein | 1.4e-93 | 96.11 | Show/hide |
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MRLCVPVDSAVKTELLTEAHSSPFFMHPGSTKMYQDLKRVY WCNMKREVAEFVSKCLVCQQVKAPRQKP GLLQPLSVPEWKLENVSTDFITGLPRTLR
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GFTMIWIVIDRLTKSAHFIS KSTYTASK AQLYLTEIVRLH VPVSIVS+RDVCFTSKFRKGLQAAIGT LDFSTAFHP
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| A0A5A7U7V9 Reverse transcriptase | 4.9e-86 | 87.71 | Show/hide |
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RLCVP DSAVKTELL+EAHSSPF MHPGSTKMYQDLKRVY W NMKREVAEFVSKCLVCQQVKAPRQKP GLLQPLS+PEWK ENVS DFITGLPRTLRG
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| A0A5D3BPI1 Reverse transcriptase | 4.9e-86 | 87.71 | Show/hide |
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RLCVP DSAVKTELL+EAHSSPF MHPGSTKMYQDLKRVY W NMKREVAEFVSKCLVCQQVKAPRQKP GLLQPLS+PEWK ENVS DFITGLPRTLRG
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FT+IW+V+DRLTKSAHF+ GKSTYTASKWAQLY++EIVRLH VPVSIVSDRD FTSKF KGLQ A+GTRLDFSTAFHP
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein | 3.8e-19 | 27.37 | Show/hide |
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++ +P D+ + ++ + H +HPG + + R ++W +++++ E+V C CQ K+ KP G LQP+ E E++S DFIT LP + G
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+ +++V+DR +K A + + TA + A+++ ++ P I++D D FTS+ K + FS + P
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| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 3.8e-19 | 27.37 | Show/hide |
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++ +P D+ + ++ + H +HPG + + R ++W +++++ E+V C CQ K+ KP G LQP+ E E++S DFIT LP + G
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+ +++V+DR +K A + + TA + A+++ ++ P I++D D FTS+ K + FS + P
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| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 8.7e-24 | 34.08 | Show/hide |
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RL VP+ L H+ F H G T + +Y W ++ + +++ C+ CQ +K+ R + GLLQPL + E + ++S DF+TGLP T
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MI +V+DR +K AHFI+ + T A++ L I H P +I SDRDV T+ + L +G + S+A HP
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| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 8.7e-24 | 34.08 | Show/hide |
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RL VP+ L H+ F H G T + +Y W ++ + +++ C+ CQ +K+ R + GLLQPL + E + ++S DF+TGLP T
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MI +V+DR +K AHFI+ + T A++ L I H P +I SDRDV T+ + L +G + S+A HP
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| Q9UR07 Transposon Tf2-11 polyprotein | 3.8e-19 | 27.37 | Show/hide |
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++ +P D+ + ++ + H +HPG + + R ++W +++++ E+V C CQ K+ KP G LQP+ E E++S DFIT LP + G
Subjt: RLCVPVDSAVKTELLTEAHSSPFFMHPGSTKMYQDLKRVYSWCNMKREVAEFVSKCLVCQQVKAPRQKPTGLLQPLSVPEWKLENVSTDFITGLPRTLRG
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+ +++V+DR +K A + + TA + A+++ ++ P I++D D FTS+ K + FS + P
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