; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc06g0167191 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc06g0167191
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptionribonucleoside-diphosphate reductase small chain
Genome locationCMiso1.1chr06:20222180..20223214
RNA-Seq ExpressionCmc06g0167191
SyntenyCmc06g0167191
Gene Ontology termsGO:0009263 - deoxyribonucleotide biosynthetic process (biological process)
GO:0016491 - oxidoreductase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581100.1 hypothetical protein SDJN03_21102, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-17893.31Show/hide
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XP_038878212.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain [Benincasa hispida]6.4e-17993.62Show/hide
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A0A0A0L8R8 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain3.9e-18295.14Show/hide
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A0A1S3BNB8 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain7.8e-191100Show/hide
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A0A6J1BWR9 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain2.8e-17288.45Show/hide
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A0A6J1F5K5 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain9.0e-17993.31Show/hide
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A0A6J1J9K8 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain2.2e-17793.01Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0DKH3 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain B3.5e-15679.28Show/hide
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P49730 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain9.0e-16885.11Show/hide
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P50651 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain A2.7e-14074.07Show/hide
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        +EPLL     RF MFPI+Y  IWEMYKKA ASFWTAEEVDLS D++ W++LT  EKHFI+++LAFFAASDGIVLENLA RF+ +VQV EARAFYGFQI +
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        ENIHSEMYSLLLET+IKDS EK+RLF+AI+T+PC+ KKA W L WI S  SFA R++AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
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Query:  CDFACLLYSLLRKKLSEDRVRQIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGTLGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEY
        CDFACLLYSLL+K+L  ++V QIV EAV+IE EFVC ALP  L+GMN +LMSQYI+FVADRL+ TLG E+ Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVGEY
Subjt:  CDFACLLYSLLRKKLSEDRVRQIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGTLGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEY

Query:  QKASVMSSLNGNGGIHEFKMDEDF
        QKASVMS+L      +EF  +EDF
Subjt:  QKASVMSSLNGNGGIHEFKMDEDF

P79733 Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M25.1e-13169.51Show/hide
Query:  SIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKALASFWTAEEVDLSQDLRHWDSLTSDEKHFITYVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGFQ
        ++ +EPLL  NP RF +FPIQY  IW+MYKKA ASFWTAEEVDLS+DL+HWDSL  +E++FI++VLAFFAASDGIV ENL  RF +EVQV EAR FYGFQ
Subjt:  SIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKALASFWTAEEVDLSQDLRHWDSLTSDEKHFITYVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGFQ

Query:  ICIENIHSEMYSLLLETYIKDSSEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWI-DSTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRD
        I +ENIHSEMYSLL++TYIKDS E+  LF+AI+T+PCVKKKADWAL WI D    + ER++AFA VEGIFFSGSF SIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRD
Subjt:  ICIENIHSEMYSLLLETYIKDSSEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWI-DSTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRD

Query:  EGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVRQIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGTLGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKR
        EGLHCDFACL++  L  K SE+ V++I+  AV+IE+EF+ DALPV L+GMN DLM QYIEFVADRL+  LG++K+Y V+NPFD+ME ISL+GKTNFFEKR
Subjt:  EGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVRQIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGTLGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKR

Query:  VGEYQKASVMSSLNGNGGIHEFKMDEDF
        VGEYQ+  VMS    N     F +D DF
Subjt:  VGEYQKASVMSSLNGNGGIHEFKMDEDF

Q9LSD0 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain C1.1e-15780.72Show/hide
Query:  MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKALASFWTAEEVDLSQDLRHWD-SLTSDEKHFITYVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFY
        MPS+P+EPLL P PDRFCMFPI YPQIWEMYKKA ASFWTAEEVDLSQD R W+ SL   E+HFI +VLAFFAASDGIVLENLA RFM +VQV+EARAFY
Subjt:  MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKALASFWTAEEVDLSQDLRHWD-SLTSDEKHFITYVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFY

Query:  GFQICIENIHSEMYSLLLETYIKDSSEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQI IENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E++ LF AI+T+PCV KKA WA+KWID + +FAERI+AFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
Subjt:  GFQICIENIHSEMYSLLLETYIKDSSEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS

Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVRQIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGTLGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+ KLSE+RV+ IV +AV+IEREFVCDALP ALVGMN DLMSQYIEFVADRL+G LGY K+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
Subjt:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVRQIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGTLGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE

Query:  KRVGEYQKASVMSSLNGNGGI--HEFKMDEDF
        KRVG+YQKASVMSS+NGNG    H F +DEDF
Subjt:  KRVGEYQKASVMSSLNGNGGI--HEFKMDEDF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23580.1 ribonucleotide reductase 2A1.9e-14174.07Show/hide
Query:  DEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKALASFWTAEEVDLSQDLRHWDSLTSDEKHFITYVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGFQICI
        +EPLL     RF MFPI+Y  IWEMYKKA ASFWTAEEVDLS D++ W++LT  EKHFI+++LAFFAASDGIVLENLA RF+ +VQV EARAFYGFQI +
Subjt:  DEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKALASFWTAEEVDLSQDLRHWDSLTSDEKHFITYVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGFQICI

Query:  ENIHSEMYSLLLETYIKDSSEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
        ENIHSEMYSLLLET+IKDS EK+RLF+AI+T+PC+ KKA W L WI S  SFA R++AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
Subjt:  ENIHSEMYSLLLETYIKDSSEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH

Query:  CDFACLLYSLLRKKLSEDRVRQIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGTLGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEY
        CDFACLLYSLL+K+L  ++V QIV EAV+IE EFVC ALP  L+GMN +LMSQYI+FVADRL+ TLG E+ Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVGEY
Subjt:  CDFACLLYSLLRKKLSEDRVRQIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGTLGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEY

Query:  QKASVMSSLNGNGGIHEFKMDEDF
        QKASVMS+L      +EF  +EDF
Subjt:  QKASVMSSLNGNGGIHEFKMDEDF

AT3G27060.1 Ferritin/ribonucleotide reductase-like family protein7.8e-15980.72Show/hide
Query:  MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKALASFWTAEEVDLSQDLRHWD-SLTSDEKHFITYVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFY
        MPS+P+EPLL P PDRFCMFPI YPQIWEMYKKA ASFWTAEEVDLSQD R W+ SL   E+HFI +VLAFFAASDGIVLENLA RFM +VQV+EARAFY
Subjt:  MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKALASFWTAEEVDLSQDLRHWD-SLTSDEKHFITYVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFY

Query:  GFQICIENIHSEMYSLLLETYIKDSSEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQI IENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E++ LF AI+T+PCV KKA WA+KWID + +FAERI+AFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
Subjt:  GFQICIENIHSEMYSLLLETYIKDSSEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS

Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVRQIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGTLGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+ KLSE+RV+ IV +AV+IEREFVCDALP ALVGMN DLMSQYIEFVADRL+G LGY K+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
Subjt:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVRQIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGTLGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE

Query:  KRVGEYQKASVMSSLNGNGGI--HEFKMDEDF
        KRVG+YQKASVMSS+NGNG    H F +DEDF
Subjt:  KRVGEYQKASVMSSLNGNGGI--HEFKMDEDF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTTCAATTCCCGACGAGCCTCTCCTCGCCCCTAACCCCGATCGCTTCTGCATGTTCCCAATTCAATATCCTCAAATCTGGGAGATGTACAAGAAAGCCCTAGCCTC
CTTCTGGACCGCCGAAGAGGTCGATCTCTCACAAGACCTCCGCCATTGGGATTCCTTAACTTCCGACGAGAAACACTTCATCACTTACGTCCTTGCCTTCTTCGCCGCCT
CTGATGGTATCGTTTTGGAGAACCTTGCCGGACGGTTCATGAAAGAAGTCCAAGTCGCTGAAGCCAGAGCCTTCTATGGATTTCAAATTTGTATTGAGAACATTCATTCT
GAGATGTATAGTCTTCTCCTTGAAACTTATATCAAGGATTCCAGTGAGAAGAATCGGCTGTTTCATGCTATTGATACTGTCCCATGTGTGAAGAAGAAGGCCGATTGGGC
GTTGAAGTGGATTGATAGCACGGACTCATTTGCTGAGCGGATTTTGGCATTTGCTTGCGTCGAGGGAATTTTCTTCTCAGGTAGTTTCTGCTCTATTTTCTGGTTGAAAA
AACGTGGGTTAATGCCTGGATTGACGTTCTCAAACGAATTGATTTCACGAGATGAAGGTCTTCATTGTGATTTTGCTTGTTTGTTGTATTCATTGTTGAGGAAGAAATTG
AGTGAGGATCGAGTGAGGCAGATTGTTACGGAGGCCGTGGATATAGAGAGGGAATTCGTTTGTGATGCTTTGCCGGTGGCTCTTGTTGGAATGAATGGAGATTTGATGAG
TCAATACATTGAATTTGTGGCGGATAGGTTGGTTGGAACATTGGGGTACGAGAAAATCTATAATGTTCAAAACCCATTTGATTGGATGGAGTTGATTTCGTTGCAAGGGA
AGACTAATTTCTTTGAGAAAAGAGTTGGGGAATACCAAAAGGCATCTGTGATGTCAAGTCTAAATGGAAATGGAGGAATTCATGAGTTTAAGATGGATGAAGATTTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCTTCAATTCCCGACGAGCCTCTCCTCGCCCCTAACCCCGATCGCTTCTGCATGTTCCCAATTCAATATCCTCAAATCTGGGAGATGTACAAGAAAGCCCTAGCCTC
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CTGATGGTATCGTTTTGGAGAACCTTGCCGGACGGTTCATGAAAGAAGTCCAAGTCGCTGAAGCCAGAGCCTTCTATGGATTTCAAATTTGTATTGAGAACATTCATTCT
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TCAATACATTGAATTTGTGGCGGATAGGTTGGTTGGAACATTGGGGTACGAGAAAATCTATAATGTTCAAAACCCATTTGATTGGATGGAGTTGATTTCGTTGCAAGGGA
AGACTAATTTCTTTGAGAAAAGAGTTGGGGAATACCAAAAGGCATCTGTGATGTCAAGTCTAAATGGAAATGGAGGAATTCATGAGTTTAAGATGGATGAAGATTTCTGA
AGATTGAAGATGAAGATGAGTTCACTGTGTAGAATAATGTTTGTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKALASFWTAEEVDLSQDLRHWDSLTSDEKHFITYVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGFQICIENIHS
EMYSLLLETYIKDSSEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTDSFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLLYSLLRKKL
SEDRVRQIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGTLGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEYQKASVMSSLNGNGGIHEFKMDEDF