; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc06g0169181 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc06g0169181
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein HAT22-like
Genome locationCMiso1.1chr06:23627416..23629156
RNA-Seq ExpressionCmc06g0169181
SyntenyCmc06g0169181
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060358.1 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like [Cucumis melo var. makuwa]4.2e-15299.63Show/hide
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XP_038903319.1 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like [Benincasa hispida]3.2e-10777.16Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBR7 Homeobox domain-containing protein1.3e-14696.7Show/hide
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A0A1S3BNL6 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like9.2e-153100Show/hide
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A0A5D3DEZ1 Homeobox-leucine zipper protein HAT22-like2.0e-15299.63Show/hide
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A0A6J1FR71 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like3.8e-9873.21Show/hide
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A0A6J1KP81 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like1.7e-9873.02Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XE76 Homeobox-leucine zipper protein HOX196.3e-5051.26Show/hide
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P46603 Homeobox-leucine zipper protein HAT95.5e-7057.49Show/hide
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         E E +  RV SD  ED++G  + RKKLRL+KQQSALLEESFK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCCETL DE
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        N RLQKE+QELK +KL +P YM M  +TLT CPSCER+G GG G    G            S +K  FS+   P F+NPF+NPSAAC
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P46604 Homeobox-leucine zipper protein HAT223.1e-7357.24Show/hide
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        MG DD   TGLVLGLGLS   ++    +KK  +      +  +P  LTL  S   G+ ++          + RQTS H S + S  SG+VKRER++S   
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            +EE     VC RVSD+ DD+   + RKKLRL+KQQSALLE++FK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCCE
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        TLTDENRRLQKE+Q+LKA+KL++P YM M  ATLT+CPSCER+G GG GG   A     +K  FS+   P FYNPF+NPSAAC
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Q67UE2 Homeobox-leucine zipper protein HOX111.1e-4952.84Show/hide
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        P P SS S   E    T GF       SGGGG       + + V      +SP++SA       FSG      D +      +R C R SDEDD G  + 
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Query:  RKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQM
        RKKLRLSK+QSA LEESFK++STLNPKQK  LA+QLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCETLT+ENRRLQKE+ EL+A+K   P YM +
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           TL++CPSCERV +      A   + S
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Q8GRL4 Homeobox-leucine zipper protein HOX196.3e-5051.26Show/hide
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        SGGGG  H                S  S +V ++ +  VKRER   +EE + ERV    +  DDD   +TRKKLRL+K+QSALLE+ F+++STLNPKQK 
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         LA+QLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCETLT+ENRRLQ+E+QEL+A+K A                 P YMQ+  ATLTICPSCERV
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        G             +K          F+NPF++ SAAC
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22800.1 Homeobox-leucine zipper protein family3.9e-7157.49Show/hide
Query:  MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDPHRKVIDHEGVRHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEE
        MGFDD   TGLVLGLG S + ++  +T+++      SS    EP  LTL  S   GDP   V+   G   L RQTS HS     S    VKRERD   E 
Subjt:  MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDPHRKVIDHEGVRHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEE

Query:  VELERVCWRV-SD--EDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDE
         E E +  RV SD  ED++G  + RKKLRL+KQQSALLEESFK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCCETL DE
Subjt:  VELERVCWRV-SD--EDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDE

Query:  NRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGGVADG-----------NSNSKPKFSMPPNPLFYNPFSNPSAAC
        N RLQKE+QELK +KL +P YM M  +TLT CPSCER+G GG G    G            S +K  FS+   P F+NPF+NPSAAC
Subjt:  NRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGGVADG-----------NSNSKPKFSMPPNPLFYNPFSNPSAAC

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 38.2e-4555.39Show/hide
Query:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSS----------EEVELERVCWRV--SDEDDDGCNN----TRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNL
        S  +S V S  SGK K ER+L +          E+ E+ER    +    +D+DG  N    +RKKLRLSK+Q+ +LEE+FK++STLNPKQK  LA+QLNL
Subjt:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSS----------EEVELERVCWRV--SDEDDDGCNN----TRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNL

Query:  LPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMS-GATLTICPSCERVG-TGGHGGVADGNSNSKPKFSMP
          RQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCE LTDENRRLQKEV EL+A+KL+  +YM M    TLT+CPSCERV  T     VA    NS    S P
Subjt:  LPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMS-GATLTICPSCERVG-TGGHGGVADGNSNSKPKFSMP

Query:  PNPL
          P+
Subjt:  PNPL

AT4G16780.1 homeobox protein 21.2e-4361.49Show/hide
Query:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERVCWRVSDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRART
        S  +S V SS   + +RE D   +         R   +D+DG +N+RKKLRLSK QSA+LEE+FK +STLNPKQKQ LA+QL L  RQVEVWFQNRRART
Subjt:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERVCWRVSDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRART

Query:  KVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMS-GATLTICPSCERV
        K+KQTEVDCE L++CCE LT+ENRRLQKEV EL+A+KL+   YM MS   TLT+CPSCE V
Subjt:  KVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMS-GATLTICPSCERV

AT4G37790.1 Homeobox-leucine zipper protein family2.2e-7457.24Show/hide
Query:  MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDPHRKVIDHEGVRHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLS---
        MG DD   TGLVLGLGLS   ++    +KK  +      +  +P  LTL  S   G+ ++          + RQTS H S + S  SG+VKRER++S   
Subjt:  MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDPHRKVIDHEGVRHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLS---

Query:  ----SEEVELERVCWRVSDE-DDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCE
            +EE     VC RVSD+ DD+   + RKKLRL+KQQSALLE++FK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCCE
Subjt:  ----SEEVELERVCWRVSDE-DDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCE

Query:  TLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGG--VADGNSNSKPKFSMPPNPLFYNPFSNPSAAC
        TLTDENRRLQKE+Q+LKA+KL++P YM M  ATLT+CPSCER+G GG GG   A     +K  FS+   P FYNPF+NPSAAC
Subjt:  TLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGG--VADGNSNSKPKFSMPPNPLFYNPFSNPSAAC

AT5G06710.1 homeobox from Arabidopsis thaliana1.2e-4871.53Show/hide
Query:  ELERVCWRVSDEDDDGCN-NTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRR
        E+ER   R S+ED+D  N +TRKKLRLSK QSA LE+SFK++STLNPKQK  LA+QLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCE+LT+ENRR
Subjt:  ELERVCWRVSDEDDDGCN-NTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRR

Query:  LQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGT
        LQKEV+EL+ +K + P YMQ+   TLT+CPSCERV T
Subjt:  LQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTTTGATGATTTTTCTAAAACAGGGTTGGTGTTGGGATTAGGGCTCTCAGAATTAGCTGACGATCAAAGGACGACATTGAAGAAGAAGCCTGCACCTTGC
TCCTCCAGTTCACTTGATTTCGAGCCTTGTGTTTTGACTTTGGGATTTTCCGGTGGTGGTGGCGACCCTCATCGGAAAGTTATTGATCATGAGGGTGTTCGTCAT
TTATATCGCCAAACATCCCCTCATAGCAGCGCTGTTTGTTCTTCCTTCTCGGGTAAGGTTAAAAGAGAGAGAGATCTGAGCAGTGAAGAAGTTGAACTGGAGAGA
GTTTGTTGGAGAGTTAGTGATGAAGATGACGATGGTTGTAATAATACTAGAAAGAAACTTAGACTCTCTAAACAACAATCCGCTCTCTTGGAAGAAAGTTTCAAA
CAGAATAGCACGCTCAATCCTAAGCAAAAACAAGGCTTAGCAAGACAGCTAAATCTACTGCCACGACAAGTTGAAGTATGGTTTCAGAATAGGAGAGCTCGAACA
AAAGTGAAACAAACGGAAGTAGATTGTGAGTTGTTGAAGAAGTGTTGTGAGACGTTGACGGATGAAAATAGAAGATTACAAAAGGAGGTTCAAGAATTGAAGGCA
ATAAAGCTGGCAAAACCGGTATACATGCAGATGTCGGGGGCGACATTAACCATATGCCCCTCATGCGAAAGGGTGGGTACTGGCGGCCATGGTGGTGTCGCGGAC
GGTAATTCTAATTCCAAACCCAAATTTTCAATGCCTCCTAACCCTCTCTTTTACAATCCCTTCTCCAATCCTTCAGCCGCTTGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCAAAAGTGGTAGTAATAGTTAAATGTAGCAAACAAGAAAGAGAGAGAAAGAAAGAATGATACTTTCTTGATGTGTTCCCCACAACCATGTGAACTATGGGATT
CGAGCACGAAAAGGAAATTAAGTAATTGTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTCGTTCATTATTAATAATGTGAAGATAATATAGGTAAGTGGGGTT
TTAAAGGTCAACCTATGTATAGAGAGATAGAAGGGAGTTTTAATTTGATAATTTATTATTTATTTTCCAAATGCTAACTAGATTCTTTTGTCTTCTCAATTTCTT
TTCTTTTCGATTATTAATCGTACCCATATCTCTCTCTCTATTTTTATTTTTTTTCCCTCTCTTCTTAAAAACCCTTCATATTAGTTTCTTATTGTTCACAAGTTT
CGCTTTTTCCAGTTCCCATCCACAATTATTATTTCCCTCTCACCCGAGATGGGTTTTGATGATTTTTCTAAAACAGGGTTGGTGTTGGGATTAGGGCTCTCAGAA
TTAGCTGACGATCAAAGGACGACATTGAAGAAGAAGCCTGCACCTTGCTCCTCCAGTTCACTTGATTTCGAGCCTTGTGTTTTGACTTTGGGATTTTCCGGTGGT
GGTGGCGACCCTCATCGGAAAGTTATTGATCATGAGGGTGTTCGTCATTTATATCGCCAAACATCCCCTCATAGCAGCGCTGTTTGTTCTTCCTTCTCGGGTAAG
GTTAAAAGAGAGAGAGATCTGAGCAGTGAAGAAGTTGAACTGGAGAGAGTTTGTTGGAGAGTTAGTGATGAAGATGACGATGGTTGTAATAATACTAGAAAGAAA
CTTAGACTCTCTAAACAACAATCCGCTCTCTTGGAAGAAAGTTTCAAACAGAATAGCACGCTCAATCCTAAGCAAAAACAAGGCTTAGCAAGACAGCTAAATCTA
CTGCCACGACAAGTTGAAGTATGGTTTCAGAATAGGAGAGCTCGAACAAAAGTGAAACAAACGGAAGTAGATTGTGAGTTGTTGAAGAAGTGTTGTGAGACGTTG
ACGGATGAAAATAGAAGATTACAAAAGGAGGTTCAAGAATTGAAGGCAATAAAGCTGGCAAAACCGGTATACATGCAGATGTCGGGGGCGACATTAACCATATGC
CCCTCATGCGAAAGGGTGGGTACTGGCGGCCATGGTGGTGTCGCGGACGGTAATTCTAATTCCAAACCCAAATTTTCAATGCCTCCTAACCCTCTCTTTTACAAT
CCCTTCTCCAATCCTTCAGCCGCTTGTTAGACAATATTTATTATTCCAACCTACACAATAATATAATTACCTTTTTTCTTTTATCTTTTCTTCTTCAGAAAGGGT
TGTAGAGCTAAATTGGCGATTAGACAAATTTAATGTAAGTAGTAGCTACCTAGCTAGCTTGTAAAAAATTACTCTTTTATCATATCCAACATCAAATTATGTCAG
TCTTATTTTTCTTTACCATGATGTTAAATGTTTCGAAGATAATTGTAAGGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDPHRKVIDHEGVRHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELER
VCWRVSDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKA
IKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGGVADGNSNSKPKFSMPPNPLFYNPFSNPSAAC