; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc06g0178461 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc06g0178461
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionGonadotropin-releasing hormone II receptor
Genome locationCMiso1.1chr06:34954745..34955945
RNA-Seq ExpressionCmc06g0178461
SyntenyCmc06g0178461
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KFD46974.1 hypothetical protein M513_12164 [Trichuris suis]2.5e-0536.41Show/hide
Query:  IHHPLHSLRHLRTLLLVHLHHHSHRRSHLLRHLHVLLLHSLSLLLLLRHFHIHHHFLHYHTHLPNHLLRRLHALHLRSLSLLLVLHRFHILLHSLLLHHN
        +HH  H   H   L+++H HHH H   H   H H    H     +++ H H HHH  H+H H  +H     H  H          H  H   H    HH+
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Query:  HHHLHFHHRHHLHNPIPRYHNHHQNHLLLHFRNHRPGHIRPRFHHHHHFLLLLLHHHHFHNHVLLHLHIRSHFLHLHHFHIHHH
        HHH H HH HH H+    +H+HH +H   H  +H   H     HHHHH      HHHH H+H   H H   H  H HH H HHH
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TNN23789.1 Gonadotropin-releasing hormone II receptor [Liparis tanakae]1.5e-1043.75Show/hide
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        HH LH   H R  L +H HHH H   H   HLH    H         H H+HHH LH+H HL +H     H LHL      L  H  H+ LH   LH   
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Query:  HNHHHLHF-----HHRHHLHNPIPRYHNHHQNHLLLHFRNHRPGHIRPRFHHHHHFLLLLLHHHHFHNHVLLHLHIRSHFLHLHHFHIHHHL
        H+HHHLH      HH HHLH     +H+HH +HL LH  +H   H     HHHHH    L HHHH H+H  LH H   H  H HH H HHHL
Subjt:  HNHHHLHF-----HHRHHLHNPIPRYHNHHQNHLLLHFRNHRPGHIRPRFHHHHHFLLLLLHHHHFHNHVLLHLHIRSHFLHLHHFHIHHHL
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A085LPS8 Uncharacterized protein1.2e-0536.41Show/hide
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        +HH  H   H   L+++H HHH H   H   H H    H     +++ H H HHH  H+H H  +H     H  H          H  H   H    HH+
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Query:  HHHLHFHHRHHLHNPIPRYHNHHQNHLLLHFRNHRPGHIRPRFHHHHHFLLLLLHHHHFHNHVLLHLHIRSHFLHLHHFHIHHH
        HHH H HH HH H+    +H+HH +H   H  +H   H     HHHHH      HHHH H+H   H H   H  H HH H HHH
Subjt:  HHHLHFHHRHHLHNPIPRYHNHHQNHLLLHFRNHRPGHIRPRFHHHHHFLLLLLHHHHFHNHVLLHLHIRSHFLHLHHFHIHHH
A0A4Z2E4X1 Gonadotropin-releasing hormone II receptor7.2e-1143.75Show/hide
Query:  HHPLHSLRHLRTLLLVHLHHHSHRRSHLLRHLHVLLLHSLSLLLLLRHFHIHHHFLHYHTHLPNHLLRRLHALHLRSLSLLLVLHRFHILLHSLLLH---
        HH LH   H R  L +H HHH H   H   HLH    H         H H+HHH LH+H HL +H     H LHL      L  H  H+ LH   LH   
Subjt:  HHPLHSLRHLRTLLLVHLHHHSHRRSHLLRHLHVLLLHSLSLLLLLRHFHIHHHFLHYHTHLPNHLLRRLHALHLRSLSLLLVLHRFHILLHSLLLH---

Query:  HNHHHLHF-----HHRHHLHNPIPRYHNHHQNHLLLHFRNHRPGHIRPRFHHHHHFLLLLLHHHHFHNHVLLHLHIRSHFLHLHHFHIHHHL
        H+HHHLH      HH HHLH     +H+HH +HL LH  +H   H     HHHHH    L HHHH H+H  LH H   H  H HH H HHHL
Subjt:  HNHHHLHF-----HHRHHLHNPIPRYHNHHQNHLLLHFRNHRPGHIRPRFHHHHHFLLLLLHHHHFHNHVLLHLHIRSHFLHLHHFHIHHHL
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAATCAACTAAGGTGAATATCCACCACCCCCTCCACTCCCTCCGCCACCTCCGTACCCTCCTCCTTGTGCACCTCCACCACCATAGCCACCGCCGGAGCCACCTCCT
CCGCCACCTCCATGTCCTCCTGCTCCACTCCCTGAGCCTCCTCCTTCTCCTCCGCCACTTCCATATCCACCACCATTTCCTCCACTACCATACCCACCTCCCCAACCACC
TCCTCCGCCGCCTCCATGCCCTCCACCTCCGCTCCCTGAGCCTCCTCCTTGTCCTCCACCGCTTCCATATCCTCCTCCACTCGCTGCTCCTGCACCATAACCACCACCAC
CTCCATTTCCACCACCGCCACCACCTCCATAACCCGATCCCCCGCTACCATAACCACCACCAGAACCACCTCCTTCTCCACTTCCGTAACCACCGACCGGGCCATATCCG
ACCCCGCTTCCACCACCACCACCACTTCCTCCTCCTCCTCCTCCACCACCACCATTTCCATAACCACGTTCTTCTCCACCTCCATATCCGGAGCCACTTCCTTCACCTCC
ACCATTTCCATATCCACCACCATTTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACTTTTTTTTTAGTTCTAACAGTATGCAACGTAATTTAAAACTTTGATTCAATTTGTATCATGTATGTATTTACATATCATCTCTTTTATGTTTTACATATATTTAGAA
TGAACTGAAAAGTTGTAAAATATCACAATCGCGATTGCATATTTGATCATACAAAATACAAATACATATTAGGGAAATATGATCAAAAGGAATGGTTTCCCCTAATTTCC
CATTCTTCAATCAGTATCACCACTATAGTTATAAAACTTAATTCATTAAGAACATAAAATATAATCAATAGTCCTTTCTTGTTTAGACCTTTCTTCTTCTTATAAATTAT
TTTCCTTTTTGTTGAGATAATAACAAATGGAATCAACTAAGGTGAATATCCACCACCCCCTCCACTCCCTCCGCCACCTCCGTACCCTCCTCCTTGTGCACCTCCACCAC
CATAGCCACCGCCGGAGCCACCTCCTCCGCCACCTCCATGTCCTCCTGCTCCACTCCCTGAGCCTCCTCCTTCTCCTCCGCCACTTCCATATCCACCACCATTTCCTCCA
CTACCATACCCACCTCCCCAACCACCTCCTCCGCCGCCTCCATGCCCTCCACCTCCGCTCCCTGAGCCTCCTCCTTGTCCTCCACCGCTTCCATATCCTCCTCCACTCGC
TGCTCCTGCACCATAACCACCACCACCTCCATTTCCACCACCGCCACCACCTCCATAACCCGATCCCCCGCTACCATAACCACCACCAGAACCACCTCCTTCTCCACTTC
CGTAACCACCGACCGGGCCATATCCGACCCCGCTTCCACCACCACCACCACTTCCTCCTCCTCCTCCTCCACCACCACCATTTCCATAACCACGTTCTTCTCCACCTCCA
TATCCGGAGCCACTTCCTTCACCTCCACCATTTCCATATCCACCACCATTTGTAGAACCACCTCCACCTCCATGTCCTCCTCCGCCACCACCGCCATATCCAAGGCTAAG
TCCATATCCACTACCACCTCCTTCTCCACCACCATATCCAACAGAAGTATGCCCTAACACAGGAACGCGGACATCGCCATCATAAGCAATAAGAGTTCTGGCGGCCGAAG
CTAACCCCAAACCCAACAAAGCAAACAAAGCAAGGAATTGTACTCTATGGTTCTCCATGGGAACTCAAAACACAAGGCCTATGCTTACAATGCATGTTCTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MESTKVNIHHPLHSLRHLRTLLLVHLHHHSHRRSHLLRHLHVLLLHSLSLLLLLRHFHIHHHFLHYHTHLPNHLLRRLHALHLRSLSLLLVLHRFHILLHSLLLHHNHHH
LHFHHRHHLHNPIPRYHNHHQNHLLLHFRNHRPGHIRPRFHHHHHFLLLLLHHHHFHNHVLLHLHIRSHFLHLHHFHIHHHL