CuGenDBv2

Gene ID	Cmc06g0179581
Organism	Cucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Description	Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold containing protein
Genome location	CMiso1.1chr06:35760323..35762961
RNA-Seq Expression	Cmc06g0179581
Synteny	Cmc06g0179581
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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KAE8649997.1 hypothetical protein Csa_011663 [Cucumis sativus]

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TYK11399.1 putative universal stress protein [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_004146157.1 uncharacterized protein LOC101219661 [Cucumis sativus]

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XP_008448520.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490671 [Cucumis melo]

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XP_038903454.1 uncharacterized protein LOC120090039 [Benincasa hispida]

1.0e-99

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TrEMBL top hits

e value

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A0A0A0L108 Uncharacterized protein

2.3e-105

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A0A1S3BJ95 uncharacterized protein LOC103490671

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A0A5A7UB34 Putative universal stress protein

1.0e-113

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A0A5D3CMG3 Putative universal stress protein

3.9e-113

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A0A6J1FSW2 uncharacterized protein LOC111448467 isoform X1

1.3e-92

79.31

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        S   S S  +  LLL    L +MA ARC LP  LET KHP S    +SSST CSFT+AF S  RR   F  PI+TLCCK  HRVKAKP DSEAT+VAGSF
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        TEFKHLLLPITDRNPFLSEGTRQAIATTAALAKNNGADITV+LID KQK+S PEHENQLSSIRWHLSEGGFQE+KLLERLG+GSKPTAIIGEVADDLNLD
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G66090.1 unknown protein

1.9e-56

58.95

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        T  S+  S +  +P    R +  +  ++     +  RVKA+ +++EA+     V  +F+  KHLLLP+ DRNP+LSEGTRQA ATT +LAK  GADITVV
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        +ID ++++S  EHE Q+S+IRWHLSEGGF+EFKLLERLGEG K TAIIGEVAD+L ++LVV+SMEAIHSK++DANLLAEFIPCPV+LLPL
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGATTTCCTTACAATATTCTCTTTCCCCCTTGAAACCTTCATTTTCACTTCCATTTCTCTTCTTCTCCTTTCTCGAATCACCTTCCCAACTTACGATCTTTCTT
CTTCTTAGTTCTTCCAACCTTCAATCTATGGCGGTTGCTCGTTGCTTCCTCCCTTTTTCTCTTGAAACTTCAAAGCATCCACTCTCTCCTTCCATTTTCACTTCT
TCTTCTACTGATTGTTCCTTCACTCTCGCTTTTCCTTCGGATTATCGTCGCCCCCGAGGTTTTAAGCCCCCAATCACCACTCTCTGCTGCAAAATGATCCATCGC
GTAAAAGCCAAGCCACAAGATTCAGAAGCAACATTAGTTGCCGGCTCCTTCACTGAATTTAAACACCTGCTACTGCCAATAACCGATCGCAATCCATTTCTTTCC
GAGGGAACGAGACAGGCTATTGCTACTACTGCTGCTTTGGCAAAGAACAATGGGGCTGACATAACAGTAGTCTTGATCGATGCAAAGCAGAAAGATTCGATTCCA
GAACACGAGAACCAACTCTCGAGCATTCGTTGGCATTTGTCTGAAGGGGGATTCCAAGAGTTTAAATTGTTGGAGCGATTAGGGGAAGGAAGCAAGCCAACAGCA
ATCATTGGGGAGGTGGCTGATGATCTGAATTTAGATTTGGTAGTTCTAAGCATGGAAGCCATTCATTCCAAGCATGTGGATGCTAACCTACTGGCTGAGTTCATT
CCATGCCCTGTTATGCTCTTGCCGTTATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AATGATTTCCTTACAATATTCTCTTTCCCCCTTGAAACCTTCATTTTCACTTCCATTTCTCTTCTTCTCCTTTCTCGAATCACCTTCCCAACTTACGATCTTTCT
TCTTCTTAGTTCTTCCAACCTTCAATCTATGGCGGTTGCTCGTTGCTTCCTCCCTTTTTCTCTTGAAACTTCAAAGCATCCACTCTCTCCTTCCATTTTCACTTC
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CGTAAAAGCCAAGCCACAAGATTCAGAAGCAACATTAGTTGCCGGCTCCTTCACTGAATTTAAACACCTGCTACTGCCAATAACCGATCGCAATCCATTTCTTTC
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TGTGATTTATGTATATATTATAAAGTGCTTTTGGAGTTCAATGAATCCTTATATATTATCTAGACAAATTAATATTAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MISLQYSLSPLKPSFSLPFLFFSFLESPSQLTIFLLLSSSNLQSMAVARCFLPFSLETSKHPLSPSIFTSSSTDCSFTLAFPSDYRRPRGFKPPITTLCCKMIHR
VKAKPQDSEATLVAGSFTEFKHLLLPITDRNPFLSEGTRQAIATTAALAKNNGADITVVLIDAKQKDSIPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFKLLERLGEGSKPTA
IIGEVADDLNLDLVVLSMEAIHSKHVDANLLAEFIPCPVMLLPL

Cmc06g0179581 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome