; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc07g0186201 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc07g0186201
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionZinc finger MYM-type protein
Genome locationCMiso1.1chr07:4166587..4174091
RNA-Seq ExpressionCmc07g0186201
SyntenyCmc07g0186201
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008906 - HAT, C-terminal dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0066112.1 Dimer_Tnp_hAT domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]2.8e-3181.52Show/hide
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KAF8378325.1 hypothetical protein HHK36_029664 [Tetracentron sinense]9.6e-2464.04Show/hide
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XP_008245511.1 PREDICTED: zinc finger MYM-type protein 1-like [Prunus mume]1.7e-2568.54Show/hide
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XP_008449194.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491145 [Cucumis melo]4.3e-2465.17Show/hide
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XP_021829887.1 uncharacterized protein LOC110770113 [Prunus avium]6.6e-2567.42Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BM43 uncharacterized protein LOC1034911452.1e-2465.17Show/hide
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A0A3S3NV96 Zinc finger MYM-type protein 1-like protein1.0e-2365.17Show/hide
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A0A5A7VCQ2 Dimer_Tnp_hAT domain-containing protein1.3e-3181.52Show/hide
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A0A5D3BDJ0 Dimer_Tnp_hAT domain-containing protein1.3e-2378.75Show/hide
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A0A6P5TRY7 uncharacterized protein LOC1107701133.2e-2567.42Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19260.1 TTF-type zinc finger protein with HAT dimerisation domain1.6e-1647.73Show/hide
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AT2G06541.1 TTF-type zinc finger protein with HAT dimerisation domain4.0e-1240.48Show/hide
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AT2G06541.2 TTF-type zinc finger protein with HAT dimerisation domain4.0e-1240.48Show/hide
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AT3G29765.1 General transcription factor 2-related zinc finger protein6.0e-1647.73Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATTTTCTGTTATGAATATTGTGAAGACTCGATTGCGCAATCGAATGAGAGATCAATGGATGAATGATTGTTTTATAGCTTATATTGAGAAAGATTTATTGGATAAATTAA
ATGATAAACTTATCATGGATCAGTTTCAAAATATGAAAACTCGTAGAGGACAATTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCTAAACAAGTTTGGTGTTTTTAAGCAAGCTTGGTGTTTTTTAAACAATCCTTGCTCTTCCTTGGTTGCTAAGGTGTTACTAGGGAGATATTTTCCTTCTATTCTTTTGC
AAACTAAGGTTTCTCAAAATTGTTTGTTTTTTTGGAAAGGTTTTGTTTTGGGTATTAATTTGTTGAAATTTGGACCTCGCACAAGCATTGGTACTGGAGTATCAACTCAT
ATGTTTAGTGATCCTTGAATTCCAAGGCTTTCTGCTTTTCATCCTATTACACTGAATCTAGTGCTTTAGATCTCCTAGTGTTGGATTTTATAACCATGTAAAGATAGAGG
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AGTTTGTATTGGGCCTCGAGCCATTTGCAGAAGTTGTAATACAATTTCTCATAATTTATTGGTTCCATCGATGTCATTTCGGAGTGTTTGGACTAGAGTATGTTCACAGC
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ATTTTGATTCTATAGACTTTAGAGGCAGGGGCGGATTTATTAAGGGCCAGCGGGGCACGTGCTCTCCTCACATTATCGATTTTTGTATTTTAATATTAATTTTGAAGTGT
CAGATTATAATATATATTAAATAATGCTTTAATTTTTCAAAATTTTGGTTCTAGTGTAGTGACTGTGCCTCCATTTTGTAATCTAGGTTAGAGGTGATTGAATGATTTAT
TAGAATAATCCATGTCAATAATACAAGTGTCTTATCACTTAAGGAAGCTATTGATGGTTTTTTCTCTCAACATGGGTTAAATATTGCTAATTTGCGAGGACAAGGATATG
ATGGAGTAAGTAATATGCAAGTGAAAATGGTCGTTACGAAAAGAAATAAATTCTACCAATTAGTTTATTGGTTGCTCACATTGGCATTGATTTTACCGGTTGCAACAACT
ACTATAGAGAGAACATTTTCTGTTATGAATATTGTGAAGACTCGATTGCGCAATCGAATGAGAGATCAATGGATGAATGATTGTTTTATAGCTTATATTGAGAAAGATTT
ATTGGATAAATTAAATGATAAACTTATCATGGATCAGTTTCAAAATATGAAAACTCGTAGAGGACAATTATAATACGTATTAAATTAATTAGTCTTTGAAGCTATTAATT
TTCTTTTTTACATTTTTTAGTGTGTTTATTATATAGTGTTTTCCTATACAAAATTTCTGGATGCGCCAGTGTTTGAAGTCTATGGTGATGGATGATACAGGTTCTGTTCG
AGTTGTGTTGCTTGATTTTAGGGACGATTATTTGACTATTTGTACTAAGTGACTCAGTTCCAAAAGGTCCATTTCATACATGTTCGTGAGAGGAATATGAAACTGTCCAT
ACTTTGGCTCATTGAGGTTTATATGAAACTTCATTTGTTTTGTTTCTTTATTTTTTAGATAATCGGTTGTTATCTAATTGTAAAACGGATTGTCTTAAACATGTAGTCGA
TATGGCTTCTTTTGTTTAATGTTTAGTTCCTCTATTTAGAAAAGATTATACATTTTAAGTTGAAAAAACACTTTTGGTACTGTACTTTCGTTCGTAGAGGAAATTTCTTC
CATTTATTGCACTTTTAAAAATAAAAATATGTAACACGGTCTTAGTACGATAGATAGAAAGAAAAACTTAACAAAAGCATCAAGTAAAGTTAATCCATGAGATGTATTTT
AAGTCATTCAATTAAATAATGAAATCTACGAGCATGAGTAGCTAACTTATAGCATCAGTTAAAAAGATGCTTACCAAGTGAAATCCAATTGAGTAGCTAACTCATAGCAT
GAAACACTGGTGGAAAAGGATGCTTATCAAGTGAAATCCAATTTAGAGGTGACCAAGTTCCATAGATTTGTAGATTGATAAATTAAGTAGGAGAAATTCTAATCAAATAT
ACTCAAATAAATGAAGCATAATTTCTTCAGGTTAATAGCAAAACATACTTTGGATGTCCGCACTTAACATTTGTTTGTGAGTGAATATGAGAACCACTTGATTAGTAGAG
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AATATGCGAAAACTTAACTGATCGTATCTTTCAAATTTTGTAATTATTTAGTATAATCGTAAATATATCTATTAAGATTTAGTATAGTGGATACCAAATATGTATATAGA
ATTACATTGACTAAATTCGCTAATAAAAATCGGCACTTAGTTTTTATGAGATCAGTTACGATACAAAACATTAAAAATTTTAAAGGCCTGTTTGGGGTTAGGGTTAGGGT
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GGCAATGGGTGCCGATCGAACATGGTAGGGAGATATTGGACTCTTTGAATCCATTTTTTTCTACAAAAGCTGATGATGAGTTCCCAATGTTTTCAATTTTCTTTTCCATA
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TGCATTTTGGATTCTGTCATGGTTTAGTTTGGGTATGCTATTTTTTCTTTTAGCCTTTGATTCTGTTCTGTTTAATGCTTTACATACTTTTCTTTATAAATTATATTGGC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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