; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc07g0187751 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc07g0187751
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionSplicing factor YJU2
Genome locationCMiso1.1chr07:5818056..5820813
RNA-Seq ExpressionCmc07g0187751
SyntenyCmc07g0187751
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007590 - Saf4/Yju2 protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060823.1 NBS-LRR type resistance protein [Cucumis melo var. makuwa]3.1e-1882.35Show/hide
Query:  KVGLNEGSRVGLQDGKSATVGGSPSAARRTTRRMAAGRRQTRSNEGRTVASGYVKPRGRSGKDGTAAE
        +VGL+EGSRVGLQDGKSATVGG PSAARRTTRRMAAGRRQTRS+E RT A GYV+ RGRSGKD TA +
Subjt:  KVGLNEGSRVGLQDGKSATVGGSPSAARRTTRRMAAGRRQTRSNEGRTVASGYVKPRGRSGKDGTAAE
KAG6652701.1 hypothetical protein CIPAW_05G024500 [Carya illinoinensis]1.5e-09100Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
XP_016714091.2 splicing factor YJU2 [Gossypium hirsutum]1.5e-09100Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
XP_022761492.1 coiled-coil domain-containing protein 94 homolog isoform X2 [Durio zibethinus]1.5e-09100Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
XP_022761494.1 coiled-coil domain-containing protein 94 isoform X4 [Durio zibethinus]1.5e-09100Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0B0MV50 Splicing factor YJU27.4e-10100Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
A0A5A7UXY3 NBS-LRR type resistance protein1.5e-1882.35Show/hide
Query:  KVGLNEGSRVGLQDGKSATVGGSPSAARRTTRRMAAGRRQTRSNEGRTVASGYVKPRGRSGKDGTAAE
        +VGL+EGSRVGLQDGKSATVGG PSAARRTTRRMAAGRRQTRS+E RT A GYV+ RGRSGKD TA +
Subjt:  KVGLNEGSRVGLQDGKSATVGGSPSAARRTTRRMAAGRRQTRSNEGRTVASGYVKPRGRSGKDGTAAE
A0A6J1AVA5 Splicing factor YJU27.4e-10100Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
A0A6P9EB24 Splicing factor YJU27.4e-10100Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
A0A6P9ED46 Splicing factor YJU27.4e-10100Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
SwissProt top hitse value%identityAlignment
A8WHR3 Splicing factor YJU22.5e-0768.57Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKVGL
        M ERKVLNKYYPPDFDPSK+P+++ PK++Q  V L
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKVGL
Q54WR5 Splicing factor YJU23.4e-0470.83Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVR
        MGERKV++KYYPPDFDPSK+ +++
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVR
Q9BW85 Splicing factor YJU22.5e-0768.57Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKVGL
        M ERKVLNKYYPPDFDPSK+P+++ PK++Q  V L
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKVGL
Q9D6J3 Splicing factor YJU22.5e-0768.57Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKVGL
        M ERKVLNKYYPPDFDPSK+P+++ PK++Q  V L
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKVGL
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17130.1 Family of unknown function (DUF572)1.7e-1187.88Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
        MGERKVLNKYYPPDFDP+KL R+RRPKNQQ+KV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
AT1G17130.2 Family of unknown function (DUF572)1.7e-1187.88Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
        MGERKVLNKYYPPDFDP+KL R+RRPKNQQ+KV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
AT2G32050.1 Family of unknown function (DUF572)9.6e-1072.73Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
        MGERK LNKYYPP+FDP ++PR+R+PKNQQ K+
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
AT3G43250.1 Family of unknown function (DUF572)2.1e-0972.73Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV
        MGERK LNKYYPPDFDP K+ R+++PKNQQ K+
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKV

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTGAGAGGAAGGTGCTTAACAAATACTACCCACCGGATTTTGATCCGTCAAAGCTACCAAGGGTTCGTAGACCCAAAAACCAGCAAATGAAGGTCGGTTTGAACGA
GGGTTCTCGGGTCGGCTTGCAAGATGGGAAATCCGCGACTGTTGGAGGTTCGCCGTCAGCTGCTCGGCGAACGACGCGGCGGATGGCGGCTGGACGTCGGCAGACGCGGT
CAAACGAAGGACGCACGGTGGCGTCCGGTTACGTGAAACCGAGAGGAAGGTCGGGAAAAGACGGGACCGCGGCGGAAACATGTAATACCATTAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAGATAAAATGGGTGAGAGGAAGGTGCTTAACAAATACTACCCACCGGATTTTGATCCGTCAAAGCTACCAAGGGTTCGTAGACCCAAAAACCAGCAAATGAAGGTCGGT
TTGAACGAGGGTTCTCGGGTCGGCTTGCAAGATGGGAAATCCGCGACTGTTGGAGGTTCGCCGTCAGCTGCTCGGCGAACGACGCGGCGGATGGCGGCTGGACGTCGGCA
GACGCGGTCAAACGAAGGACGCACGGTGGCGTCCGGTTACGTGAAACCGAGAGGAAGGTCGGGAAAAGACGGGACCGCGGCGGAAACATGTAATACCATTAATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKVGLNEGSRVGLQDGKSATVGGSPSAARRTTRRMAAGRRQTRSNEGRTVASGYVKPRGRSGKDGTAAETCNTIN