; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc07g0187781 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc07g0187781
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Description40S ribosomal protein S15a
Genome locationCMiso1.1chr07:5842450..5843953
RNA-Seq ExpressionCmc07g0187781
SyntenyCmc07g0187781
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:1990904 - ribonucleoprotein complex (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000630 - Ribosomal protein S8
IPR035987 - Ribosomal protein S8 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAF7148267.1 hypothetical protein RHSIM_Rhsim03G0129000 [Rhododendron simsii]4.3e-67100Show/hide
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KAG5557696.1 hypothetical protein RHGRI_007820 [Rhododendron griersonianum]4.3e-67100Show/hide
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XP_004144630.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Cucumis sativus]4.3e-67100Show/hide
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XP_007147788.1 hypothetical protein PHAVU_006G155200g [Phaseolus vulgaris]5.7e-6794.96Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KZP3 Uncharacterized protein3.0e-10692.89Show/hide
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A0A1S3CPB7 40S ribosomal protein S15a-12.1e-67100Show/hide
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A0A5A7SSH5 40S ribosomal protein S15a-12.1e-67100Show/hide
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Q9SBL9 Wrp15a2.1e-67100Show/hide
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V7BP91 Uncharacterized protein2.7e-6794.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80646 40S ribosomal protein S15a-31.4e-6390Show/hide
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P42798 40S ribosomal protein S15a-16.3e-6996.92Show/hide
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Q00332 40S ribosomal protein S15a1.8e-6896.15Show/hide
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Q9AT34 40S ribosomal protein S15a1.6e-6795.38Show/hide
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Q9LX88 40S ribosomal protein S15a-48.2e-6996.92Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07770.1 ribosomal protein S15A4.5e-7096.92Show/hide
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AT1G07770.2 ribosomal protein S15A4.5e-7096.92Show/hide
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AT2G39590.1 Ribosomal protein S8 family protein4.3e-6588.06Show/hide
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AT3G46040.1 ribosomal protein S15A D5.8e-7096.92Show/hide
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AT5G59850.1 Ribosomal protein S8 family protein4.5e-7096.92Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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GACAGTTTGGATTCATTGTGTTGACTACGTCTGCGGGAATCATGGATCACGAAGAGGCCAGAAGAAAGAATGTTGGTGGTAAAGTGCTTGGTTTCTTTTACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GCTTTGGAATTCATTGCAATTTTTTCAGACAGCAATTATCCTTCCCTCGCCCATCAATTTGTGTGTTCTATATCTCATGTTTATGTATGATTCCTTTTCCAGCTTTTGAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVETILSNINLWANKNSKTTLSKFPNLGLNPKPYSFEPSPILNGTINKLGFILTLLSFHSAVEEPEALIPIRSLQLSSSGLPSLSVIMVRVSVLNDALKSMYNAEKRGKR
QVMIRPSSKVIIKFLLVMQKHGYIGEFEFVDDHRSGKIVVELNGRLNKCGVISPRFDVGVKEIEGWTARLLPSRQFGFIVLTTSAGIMDHEEARRKNVGGKVLGFFY