| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0055877.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 4.6e-137 | 95.26 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
MMNSKPVATPIETGT LSKHEEGDDVDPSYFKSL+GSLRYLTCTRP+ILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYL+GTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
SDWAGDTNDRKSTSGYVFFI NTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEY+ A SCVCHAVWLRNLLKTVGILQ+DPT+IH+DN+STIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Query: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
Subjt: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
|
|
| TYK03241.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.0e-136 | 95.65 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
MMNSKPVATPIETGT LSKHEEGDDVDPSYFKSL+GSLRYLTCTRP+ILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYL+GTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
SDWAGDTNDRKSTSGYVFFI NTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYV A SCVCHAVWLRNLLKTVGILQ+DPT+IHVDN+STIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Query: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQ KKHV
Subjt: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
|
|
| TYK06895.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.4e-136 | 95.26 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
MMNSKPVATPIETGT LSKHEEGDDVDPSYFKSL+GSLRYLTCTRP+ILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYL+GTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
SDWAGDTNDRKSTSGYVFFI NTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYV A SCVCHAVWLRNLLKTVGILQ+DPT+IH+DN+STIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Query: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQ KKHV
Subjt: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
|
|
| TYK13816.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.4e-136 | 95.26 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
MMNSKPVATPIETGT LSKHEEGDDVDPSYFKSL+GSLRYLTCTRP+ILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYL+GTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
SDWAGDTNDRKSTSGYVFFI NTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYV A SCVCHAVWLRNLLKTVGILQ+DPT+IH+DN+STIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Query: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQ KKHV
Subjt: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
|
|
| TYK18362.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.4e-136 | 95.26 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
MMNSKPVATPIETGT LSKHEEGDDVDPSYFKSL+GSLRYLTCTRP+ILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYL+GTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
SDWAGDTNDRKSTSGYVFFI NTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYV A SCVCHAVWLRNLLKTVGILQ+DPT+IH+DN+STIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Query: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQ KKHV
Subjt: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SJX6 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 6.5e-137 | 95.26 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
MMNSKPVATPIETGT LSKHEEGDDVDPSYFKSL+GSLRYLTCTRP+ILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYL+GTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
SDWAGDTNDRKSTSGYVFFI NTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYV A SCVCHAVWLRNLLKTVGILQ+DPT+IH+DN+STIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Query: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQ KKHV
Subjt: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
|
|
| A0A5A7UMQ1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 2.2e-137 | 95.26 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
MMNSKPVATPIETGT LSKHEEGDDVDPSYFKSL+GSLRYLTCTRP+ILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYL+GTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
SDWAGDTNDRKSTSGYVFFI NTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEY+ A SCVCHAVWLRNLLKTVGILQ+DPT+IH+DN+STIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Query: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
Subjt: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
|
|
| A0A5A7V3X9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 6.5e-137 | 95.26 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
MMNSKPVATPIETGT LSKHEEGDDVDPSYFKSL+GSLRYLTCTRP+ILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYL+GTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
SDWAGDTNDRKSTSGYVFFI NTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYV A SCVCHAVWLRNLLKTVGILQ+DPT+IH+DN+STIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Query: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQ KKHV
Subjt: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
|
|
| A0A5D3BU42 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 5.0e-137 | 95.65 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
MMNSKPVATPIETGT LSKHEEGDDVDPSYFKSL+GSLRYLTCTRP+ILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYL+GTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
SDWAGDTNDRKSTSGYVFFI NTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYV A SCVCHAVWLRNLLKTVGILQ+DPT+IHVDN+STIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Query: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQ KKHV
Subjt: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
|
|
| A0A5D3D497 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 6.5e-137 | 95.26 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
MMNSKPVATPIETGT LSKHEEGDDVDPSYFKSL+GSLRYLTCTRP+ILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYL+GTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
SDWAGDTNDRKSTSGYVFFI NTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYV A SCVCHAVWLRNLLKTVGILQ+DPT+IH+DN+STIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Query: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQ KKHV
Subjt: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQKKKHV
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04146 Copia protein | 3.0e-46 | 40.48 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRY-LTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEF--KLEG
M N V+TP+ + N +D + + +SLIG L Y + CTRP++ +V ++SR+ + + KR+LRYLKGT+D L + + F K+ G
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRY-LTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEF--KLEG
Query: YCDSDWAGDTNDRKSTSGYVF-FIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKH
Y DSDWAG DRKST+GY+F D W++K+Q V S+ EAEY+ V A+WL+ LL ++ I ++P I+ DN+ I++A NP H R+KH
Subjt: YCDSDWAGDTNDRKSTSGYVF-FIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKH
Query: IDTRFHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQ
ID ++HF R+ + + +EY+ TE+Q+ADIFTKPL F LR LG+ Q
Subjt: IDTRFHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQ
|
|
| P10978 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 1.6e-44 | 39.53 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKH------EEGDDVDPSYFKSLIGSLRY-LTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEF
M N+KPV+TP+ LSK EE ++ + S +GSL Y + CTRP+I +VG+VSRF+E+P H + K ILRYL+GT L + S
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKH------EEGDDVDPSYFKSLIGSLRY-LTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEF
Query: KLEGYCDSDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDR
L+GY D+D AGD ++RKS++GY+F A +W SK Q V LST EAEY+ A +WL+ L+ +G+ Q + +++ D++S I L+KN ++H R
Subjt: KLEGYCDSDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDR
Query: SKHIDTRFHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGV
+KHID R+H+IR+ + + ++V + T + AD+ TK + N F + L+G+
Subjt: SKHIDTRFHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGV
|
|
| P92519 Uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810 | 3.7e-28 | 38.46 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
M++ KP++TP+ N S DPS F+S++G+L+YLT TRP+I ++V +V + M PT + KR+LRY+KGT+ +GL+ + + ++ +CD
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVW
SDWAG T+ R+ST+G+ F+ +WS+K+QP V+ S+ E EY W
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVW
|
|
| Q94HW2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 | 2.6e-50 | 41.06 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
M+ +KPV TP+ LS + DP+ ++ ++GSL+YL TRP+I ++V +S+FM PT HL+ KRILRYL GT ++G+F L Y D
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
+DWAGD +D ST+GY+ ++ + +WSSKKQ V S+ EAEY + W+ +LL +GI P +I+ DN L NPVFH R KHI
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Query: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGV
+HFIR+ + ++V +V T DQ+AD TKPL F N + +GV
Subjt: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGV
|
|
| Q9ZT94 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 | 3.1e-51 | 40.73 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
M+ +KPVATP+ T L+ H DP+ ++ ++GSL+YL TRP++ ++V +S++M PT H KR+LRYL GT D+G+F L Y D
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
+DWAGDT+D ST+GY+ ++ + +WSSKKQ V S+ EAEY + W+ +LL +GI P +I+ DN L NPVFH R KHI
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Query: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQ
+HFIR+ + ++V +V T DQ+AD TKPL F N +GV +
Subjt: FHFIRDCISRKEVQVEYVKTEDQIADIFTKPLKVNVFNNLRTLLGVFQ
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT4G23160.1 cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 | 6.9e-38 | 36.41 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
++ KP + P++ S H GD VD ++ LIG L YL TR +I F+V +S+F E+P H + +IL Y+KGT+ GLFYSS E +L+ + D
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
+ + + R+ST+GY F+ + +W SKKQ +V+ S+ EAEY +WL + + + PT++ DN + I +A N VFH+R+KHI++
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVWLRNLLKTVGILQDDPTMIHVDNESTIALAKNPVFHDRSKHIDTR
Query: FHFIRD
H +R+
Subjt: FHFIRD
|
|
| ATMG00240.1 Gag-Pol-related retrotransposon family protein | 4.5e-13 | 38.96 | Show/hide |
Query: YLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCDSDWAGDTNDRKSTSGY
YLT TRP++ F+V +S+F + T ++ ++L Y+KGT+ GLFYS++ + +L+ + DSDWA + R+S +G+
Subjt: YLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCDSDWAGDTNDRKSTSGY
|
|
| ATMG00810.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein | 2.6e-29 | 38.46 | Show/hide |
Query: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
M++ KP++TP+ N S DPS F+S++G+L+YLT TRP+I ++V +V + M PT + KR+LRY+KGT+ +GL+ + + ++ +CD
Subjt: MMNSKPVATPIETGTNLSKHEEGDDVDPSYFKSLIGSLRYLTCTRPNILFSVGLVSRFMESPTTTHLKVAKRILRYLKGTLDYGLFYSSSKEFKLEGYCD
Query: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVW
SDWAG T+ R+ST+G+ F+ +WS+K+QP V+ S+ E EY W
Subjt: SDWAGDTNDRKSTSGYVFFIDNTAFTWSSKKQPIVTLSTCEAEYVVAVSCVCHAVW
|
|
