; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc07g0196551 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc07g0196551
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptioncationic amino acid transporter 8, vacuolar
Genome locationCMiso1.1chr07:19707058..19710517
RNA-Seq ExpressionCmc07g0196551
SyntenyCmc07g0196551
Gene Ontology termsGO:0003333 - amino acid transmembrane transport (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0015171 - amino acid transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002293 - Amino acid/polyamine transporter I


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063013.1 cationic amino acid transporter 8, vacuolar [Cucumis melo var. makuwa]2.6e-108100Show/hide
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KAE8649241.1 hypothetical protein Csa_014566 [Cucumis sativus]1.4e-10395Show/hide
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XP_004137314.1 cationic amino acid transporter 8, vacuolar [Cucumis sativus]1.4e-10395Show/hide
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XP_008451786.1 PREDICTED: cationic amino acid transporter 8, vacuolar [Cucumis melo]2.6e-108100Show/hide
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XP_038874912.1 cationic amino acid transporter 8, vacuolar-like [Benincasa hispida]8.8e-10191.04Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVH5 AA_permease_C domain-containing protein7.0e-10495Show/hide
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A0A1S3BTF3 cationic amino acid transporter 8, vacuolar1.2e-108100Show/hide
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A0A5A7V4N6 Cationic amino acid transporter 8, vacuolar1.2e-108100Show/hide
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A0A5D3CWS7 Cationic amino acid transporter 8, vacuolar1.2e-108100Show/hide
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A0A6J1ETC2 cationic amino acid transporter 8, vacuolar-like4.7e-10087.02Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64759 Cationic amino acid transporter 58.6e-6765.95Show/hide
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Q84MA5 Cationic amino acid transporter 11.2e-5559.88Show/hide
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Q9LZ20 Cationic amino acid transporter 6, chloroplastic4.9e-3042.86Show/hide
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Q9SHH0 Cationic amino acid transporter 8, vacuolar2.5e-6667.74Show/hide
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Q9SQZ0 Cationic amino acid transporter 7, chloroplastic1.2e-2841.03Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17120.1 cationic amino acid transporter 81.8e-6767.74Show/hide
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AT2G34960.1 cationic amino acid transporter 56.1e-6865.95Show/hide
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AT3G10600.1 cationic amino acid transporter 78.7e-3041.03Show/hide
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AT4G21120.1 amino acid transporter 18.3e-5759.88Show/hide
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AT5G04770.1 cationic amino acid transporter 63.5e-3142.86Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AAATCGTGATGAAGAAATGCCTTACTTGGTGGGATTTGATGTGGCTGGCTTTCGGTTCTGTGGTTGGTTCCGGGATTTTCACGATCACCGGCTTAGAAGCTCGCGACGAT
GCTGGACCCTCAATTGTGATCTCTTACGTTGTTTCGGGCCTCTCTGCCTTGCTCTCTGTCTTCTGTTATTCTGAATTTGCCATCGAAGTTCCTGTCGCCGGAGGCTCCTT
CTCTTTTCTTCGAATCGAACTGGGGGATTTTGTTGCGTTCATCGCTGCGGGGAATATATTCTTGGAGGCCATTGTTGGTGCGGCTGGACTGGGTCGTTCTTGGTCTTCCT
ATTTTGCGAGTATGATCAACTCTGATAACCCCGATTTTCTTCGGTTTAAGTCTGTTGTTGTGAACTATGTTACGGTCTCGCTTAAAGACTGGACCCGGCTCGACCATTTT
CGTTTTCAACTTGAAACTGTGCGCACAAGGGCCAGGCATGCTCTTTCTGCTCTCAGCTTTTATAACATATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTCTAATAAAAAAGTTGTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTGAAATATACAACAAATTCAATTATTTTTATTTTATTTTTAATCACCAATCACCACTCGATATCCTC
ATCGCTCTAATTCAATTAATTAATTAATTATTTTTTTTTTTTTTTTTATCACCATTCAGCGATCACTATCGTCATCAGTCAAATCAAAAACTTCCCCTCCCTCCTCACCG
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