; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc07g0200571 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc07g0200571
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptionagamous-like MADS-box protein AGL104
Genome locationCMiso1.1chr07:23111058..23114785
RNA-Seq ExpressionCmc07g0200571
SyntenyCmc07g0200571
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044729.1 agamous-like MADS-box protein [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-5367.76Show/hide
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KAG6577275.1 Agamous-like MADS-box protein 104, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.9e-5046.83Show/hide
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        LD  +GI +SFE +VAN LP+N QN +Q+CVA+  SSSIP+S     T+YD+  +A N+NVGSCNI       PN+   +  HHNYTT+ QLLSSF PQ 
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        SF T                                                                             ++ EI   CMNT   QQQV
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        DSISN N Q PPS D SANYD+  LPQ N D
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XP_008453775.1 PREDICTED: agamous-like MADS-box protein AGL104 [Cucumis melo]1.2e-17197.83Show/hide
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        DPNEGIPTSFETNVANRLPQNDQNSSQVCVASHHSSSIP RSTIYDKEASNINVGSCNIVRPNNVDD     WRHHNYTTTDQLLSSFTPQTSFHTSDSE
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        QKPPSTDGSANYDDDNLPQFNLD
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XP_022136666.1 agamous-like MADS-box protein AGL104 [Momordica charantia]7.1e-5047.4Show/hide
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        +K ENDIALQ  NPT S+S N+EELQQEI T+RHELQL E QL++FEPDPLSF S  EI SCEKNLLDTL+RITQR KDLLS+HLSP  YD   N +Q Y
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        LD  EGIPTSFE +VAN LP+N Q+S+Q+C  S  SSSIP+S     T+YD+  +ASN+ N+G C++  PN    +  HH+YTT+ QLLSSF PQTSF  
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        S                                                                            I+ EI  GCM +   QQQVD+IS
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        N N Q PPS DGS NYD   +PQ N+D
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XP_038883364.1 agamous-like MADS-box protein AGL104 [Benincasa hispida]4.0e-6151.53Show/hide
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        +K EN+IALQ +NPT S+S NIEELQQE+ TLRHELQ  E QL+++EPDPLSFTS  EI+SCEKNLLDTL+RITQR KDLLS+HLSP  YDH  N +Q Y
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        LD +EGIPTSFET+VAN LP+N QNSSQ+CVAS  SSSIP+     ST+YD+  +A+NIN+G C+I  PN+   +   HNYTTT QLLSSF PQTSFHT 
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                                                                                    ++ EIEE CMNT   QQQVDSISN
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         N Q PPS DGSANYD+  LPQ N+D
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L153 Uncharacterized protein4.6e-4745.45Show/hide
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        +K ENDIA Q  NPT S+S N+EELQQE+ TLRHELQL E QL++FEPD LSFTS  EINSCEKNLLDTL+RITQR KDLLS HLSP  Y+   N +Q Y
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        LD  +GIPTSFE++V + LP+++   N +Q+CVAS  SSSIP+S      T+YD+  S      NIN        VG  +I   N+   +  HHNYTTT 
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        QLLSSF PQTSF                                                                               +++EI E C
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        MNT   QQQVDSISN N Q PPS DGSANYD+  L Q N+D
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A0A1S3B5T1 agamous-like MADS-box protein AGL662.2e-4946.9Show/hide
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        +K ENDIA Q  NPT S+S N+EELQQE+ TLRHELQL E QL++FEPD LSFTS  EINSCEKNLLDTL+RITQR KDLLS HLSP  Y+   N +Q Y
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        LD  +GIPTSFE++V N LP+N QN+ +Q+CVAS  SSSIP+S      T+YD+  S     NIN        VG  +I  PN+   +  HHNYTTT QL
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Query:  LSSFTPQTSFHTSDSEELQQEVDTLTHELQLAEEQLRLFEPHHLSFTLEDEIDSCEKNLLDTLSRITQMKKDLLSDHLSLAYDHLSLNDIQDEIEEGCMN
        LSSF PQTSF                                                                               +++EI E CMN
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        T   QQQVDSISN N Q PPS DGSANYD+  L Q N+D
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A0A1S3BWJ8 agamous-like MADS-box protein AGL1046.0e-17297.83Show/hide
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        DPNEGIPTSFETNVANRLPQNDQNSSQVCVASHHSSSIP RSTIYDKEASNINVGSCNIVRPNNVDD     WRHHNYTTTDQLLSSFTPQTSFHTSDSE
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        ELQQEVDTLTHELQLAEEQLRLFEPHHLSFTLEDEIDSCEKNLLDTLSRITQ KKDLLSDHLSLAYDHLSLNDIQDEIEEGCMNTTTLQQQVDSISNVNP
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        QKPPSTDGSANYDDDNLPQFNLD
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A0A5A7TU15 Agamous-like MADS-box protein1.1e-5367.76Show/hide
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A0A6J1C454 agamous-like MADS-box protein AGL1043.4e-5047.4Show/hide
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        +K ENDIALQ  NPT S+S N+EELQQEI T+RHELQL E QL++FEPDPLSF S  EI SCEKNLLDTL+RITQR KDLLS+HLSP  YD   N +Q Y
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Query:  LDPNEGIPTSFETNVANRLPQNDQNSSQVCVASHHSSSIPRS-----TIYDK--EASNI-NVGSCNIVRPNNVDDAWRHHNYTTTDQLLSSFTPQTSFHT
        LD  EGIPTSFE +VAN LP+N Q+S+Q+C  S  SSSIP+S     T+YD+  +ASN+ N+G C++  PN    +  HH+YTT+ QLLSSF PQTSF  
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Query:  SDSEELQQEVDTLTHELQLAEEQLRLFEPHHLSFTLEDEIDSCEKNLLDTLSRITQMKKDLLSDHLSLAYDHLSLNDIQDEIEEGCMNTTTLQQQVDSIS
        S                                                                            I+ EI  GCM +   QQQVD+IS
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        N N Q PPS DGS NYD   +PQ N+D
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q1PFC2 Agamous-like MADS-box protein AGL662.6e-1532.47Show/hide
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        +K ENDIALQ  NPT  +S ++EEL+ E+  L+ +L + E++L+ +EPDP+ FT+ +E  +CEK L+DTL+R+ QR++ + +     +Y+    + QQ +
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Query:  DPNEGIPTSFETNVANRLPQNDQNSSQVCVASHHSSSIPRSTIYDKEASNIN--VGSCNIVRPN-NVDDAW-RHHNYTTTDQLLSSFTPQTSFH
            G P   +  V   L +N  N + +  AS HS+           +SN N  +G  N+   N ++   W + +N TT     + F P    H
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Q9LM46 Agamous-like MADS-box protein AGL1048.2e-1736.05Show/hide
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        +K ENDIALQ  NP   +S ++EEL+ E+  L+ +LQ+ E++L+ +EPDP+ FT+ +E    EK LLDTL+ + QR+D L+SNHLS     ++ + +Q  
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Query:  LDPNEGIPTSFETNVANRLPQNDQNSSQVCVASHHSSSIPR--STIYD-------KEASNINVGSCNIVRPN
          PN G P   +  V   LP+N  N + +  AS HS+ +    S +Y+         ++  N+  C++   N
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22130.1 AGAMOUS-like 1045.8e-1836.05Show/hide
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        +K ENDIALQ  NP   +S ++EEL+ E+  L+ +LQ+ E++L+ +EPDP+ FT+ +E    EK LLDTL+ + QR+D L+SNHLS     ++ + +Q  
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Query:  LDPNEGIPTSFETNVANRLPQNDQNSSQVCVASHHSSSIPR--STIYD-------KEASNINVGSCNIVRPN
          PN G P   +  V   LP+N  N + +  AS HS+ +    S +Y+         ++  N+  C++   N
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AT1G77950.1 AGAMOUS-like 677.1e-1649.38Show/hide
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        +KIE+D+ALQ   P P  +N N+EEL+QE+  L+ +LQ+ E++L+ FEPDP+  TS +EI +CE NL++TL+R+ QR++ L
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AT1G77950.2 AGAMOUS-like 677.1e-1649.38Show/hide
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        +KIE+D+ALQ   P P  +N N+EEL+QE+  L+ +LQ+ E++L+ FEPDP+  TS +EI +CE NL++TL+R+ QR++ L
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AT1G77980.1 AGAMOUS-like 661.9e-1632.47Show/hide
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        +K ENDIALQ  NPT  +S ++EEL+ E+  L+ +L + E++L+ +EPDP+ FT+ +E  +CEK L+DTL+R+ QR++ + +     +Y+    + QQ +
Subjt:  MKIENDIALQHLNPTPSHSNNIEELQQEIDTLRHELQLLEDQLKMFEPDPLSFTSKDEINSCEKNLLDTLSRITQRKDLLSNHLSPPNYDHDLNELQQYL

Query:  DPNEGIPTSFETNVANRLPQNDQNSSQVCVASHHSSSIPRSTIYDKEASNIN--VGSCNIVRPN-NVDDAW-RHHNYTTTDQLLSSFTPQTSFH
            G P   +  V   L +N  N + +  AS HS+           +SN N  +G  N+   N ++   W + +N TT     + F P    H
Subjt:  DPNEGIPTSFETNVANRLPQNDQNSSQVCVASHHSSSIPRSTIYDKEASNIN--VGSCNIVRPN-NVDDAW-RHHNYTTTDQLLSSFTPQTSFH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGATCGAGAATGACATTGCACTCCAACATCTGAATCCTACACCAAGCCACTCCAATAATATTGAGGAGCTTCAACAAGAGATCGATACATTAAGACATGAGCTTCA
ACTTCTTGAAGACCAACTAAAGATGTTTGAACCTGATCCTCTATCGTTCACATCCAAGGATGAAATAAATTCTTGTGAAAAGAATTTGTTGGACACATTGTCAAGAATCA
CCCAAAGGAAGGACTTATTAAGTAACCACTTATCTCCACCTAATTATGATCATGATCTGAATGAGCTTCAGCAATATTTGGATCCAAATGAGGGAATACCAACATCCTTT
GAGACCAATGTTGCTAATCGGTTGCCTCAAAATGACCAAAATTCATCTCAAGTTTGTGTTGCATCTCATCACTCATCTTCCATTCCTCGAAGCACAATTTATGATAAGGA
AGCATCAAACATTAATGTTGGGTCATGCAACATTGTAAGACCCAATAATGTTGATGATGCATGGCGTCATCACAACTACACCACAACTGATCAACTTCTCTCTTCCTTCA
CCCCACAAACTTCATTTCATACTTCGGATTCAGAGGAGCTTCAACAAGAGGTGGATACATTAACACATGAGCTTCAACTTGCTGAAGAGCAACTAAGGTTATTTGAGCCC
CATCATCTATCATTCACATTAGAGGATGAAATAGATTCTTGTGAGAAGAACCTGTTGGACACATTGTCAAGAATCACCCAGATGAAGAAAGATTTATTAAGTGACCACTT
ATCTCTAGCTTATGATCATCTCAGTCTCAATGACATTCAGGATGAGATTGAAGAGGGTTGTATGAATACAACGACGTTGCAACAACAAGTTGATAGCATTTCAAATGTGA
ATCCTCAAAAGCCTCCAAGTACTGATGGAAGTGCCAATTACGATGATGACAATTTGCCTCAATTCAATCTCGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGAATCGACAACTCAGTTTTTACAAACGCAAAAGTGGGAACTCATCAAGAAAGCTTATGAGCTCTCTCCTTCTTGGTGATATTGACATTGCTCTTATTATCTTCTCCCCT
TCCGGTCACCTCACCCACTTCTCCGGCCGCCGCAGATCGATTGAGGACGTTCTTGCTCGTTACATATAAATCTTCCTGATCATTATAGAAGAAGTTTTTACTTGGGACAC
TACGTAATATGAAGATCGAGAATGACATTGCACTCCAACATCTGAATCCTACACCAAGCCACTCCAATAATATTGAGGAGCTTCAACAAGAGATCGATACATTAAGACAT
GAGCTTCAACTTCTTGAAGACCAACTAAAGATGTTTGAACCTGATCCTCTATCGTTCACATCCAAGGATGAAATAAATTCTTGTGAAAAGAATTTGTTGGACACATTGTC
AAGAATCACCCAAAGGAAGGACTTATTAAGTAACCACTTATCTCCACCTAATTATGATCATGATCTGAATGAGCTTCAGCAATATTTGGATCCAAATGAGGGAATACCAA
CATCCTTTGAGACCAATGTTGCTAATCGGTTGCCTCAAAATGACCAAAATTCATCTCAAGTTTGTGTTGCATCTCATCACTCATCTTCCATTCCTCGAAGCACAATTTAT
GATAAGGAAGCATCAAACATTAATGTTGGGTCATGCAACATTGTAAGACCCAATAATGTTGATGATGCATGGCGTCATCACAACTACACCACAACTGATCAACTTCTCTC
TTCCTTCACCCCACAAACTTCATTTCATACTTCGGATTCAGAGGAGCTTCAACAAGAGGTGGATACATTAACACATGAGCTTCAACTTGCTGAAGAGCAACTAAGGTTAT
TTGAGCCCCATCATCTATCATTCACATTAGAGGATGAAATAGATTCTTGTGAGAAGAACCTGTTGGACACATTGTCAAGAATCACCCAGATGAAGAAAGATTTATTAAGT
GACCACTTATCTCTAGCTTATGATCATCTCAGTCTCAATGACATTCAGGATGAGATTGAAGAGGGTTGTATGAATACAACGACGTTGCAACAACAAGTTGATAGCATTTC
AAATGTGAATCCTCAAAAGCCTCCAAGTACTGATGGAAGTGCCAATTACGATGATGACAATTTGCCTCAATTCAATCTCGATTAATTTTTTTATGTTTTGTTTGTGTAAA
TTGAGGAAGTTTAAGACTTGAATGAAGAACTTAAATCGGAACTTAACCTCTCTATTCCCATTGAAATTTGTTGCAGCAGGCTCTCCTTCCAAACCCACAAAAAAGAAGAA
AACCTATGATTTATGGTAGAGACTTTCCTCTATATTTTTTTATATAATCACAATTCATTGATTGTCTAATTTTATTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKIENDIALQHLNPTPSHSNNIEELQQEIDTLRHELQLLEDQLKMFEPDPLSFTSKDEINSCEKNLLDTLSRITQRKDLLSNHLSPPNYDHDLNELQQYLDPNEGIPTSF
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HHLSFTLEDEIDSCEKNLLDTLSRITQMKKDLLSDHLSLAYDHLSLNDIQDEIEEGCMNTTTLQQQVDSISNVNPQKPPSTDGSANYDDDNLPQFNLD