; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc08g0213451 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc08g0213451
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionLINE-1 retrotransposable element ORF2 protein
Genome locationCMiso1.1chr08:3950083..3951399
RNA-Seq ExpressionCmc08g0213451
SyntenyCmc08g0213451
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


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No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G02650.1 Ribonuclease H-like superfamily protein3.2e-0423.17Show/hide
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        WS + +L        +  N+S
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CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GAAACAATAGAATCTTCAAGCAACAGGGAAAAGATTCTCAAGAGCTTTGGGAAGACATTCTCGCTCAAACCGGTTTATGGAGCTGCAAATCTAAATTATTTTCAAATTAT
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TCTTCACATAGAGTAAAATTCTTATTATTTCAAAAATGTCGATAAAAATAGTCTTAACAATACTTATGCTCAATATCGAAATAAAACCGTGTACCAAGAGAAAATTCACT
TTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGGGCAGATTTCCTTCTCGTGGAAAATTCAGCAGCAATAATAGCCCTTGGAAAGCAGTGACAGAGTGTATCAGTTGGTT
CCATAAAAACATCAGCTGGAAGGTAAATGATGGAGAAGATATCTCCTTTTGGCTTGACAACTGGAATGGAAATGCTCCTTTATCTTTGGCCGTCCCCCGTCTTTTTGCTC
TATCTACAAACAAAAAGGGGTCTGTTAAAGATTTTTGGAATCCTTCATCTAATGACTGGCATCTCCATATCAATCGGCCCCTTCGTGACCATGAACAAAACTTGTGGCAC
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ATCTGAAGCTTCAGTCTCTCCAGCTAACTTTCATCCAAATCTCTACAAAACTCTGTGGAAGGTGGAGTTTCCAAAAAAGTGTAAATTTTTCATCTGGACGCTCATCCACG
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ATCCATTGCCCCTACAGTCAGAAGTTATGGAGTAAGGCCAAAGCTCTCCTCAATTGGAATAGAACTCCAAATGATGTGCAGTCCCTTGTTCAGAACATTTGCTCCCTCAA
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