; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc08g0214071 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc08g0214071
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionVQ domain-containing protein
Genome locationCMiso1.1chr08:4320390..4321250
RNA-Seq ExpressionCmc08g0214071
SyntenyCmc08g0214071
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039610 - VQ motif-containing protein 29


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604115.1 VQ motif-containing protein 29, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.7e-6276.61Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KJR2 VQ domain-containing protein2.6e-8193.57Show/hide
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A0A1S3B142 uncharacterized protein LOC1034848691.1e-8798.25Show/hide
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A0A6J1GE45 uncharacterized protein LOC1114533304.0e-6176.02Show/hide
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A0A6J1IPH4 uncharacterized protein LOC1114776403.5e-5772.51Show/hide
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A0A6J1KTH5 uncharacterized protein LOC1114970904.4e-5269.59Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22880.1 VQ motif-containing protein1.0e-0842.19Show/hide
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AT4G37710.1 VQ motif-containing protein6.6e-0850.94Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GACTTATTCTAATAATAATAACAATATTCATTGTGTTCGGAAGCCGATGGCGAAGCCGTGGAAGAAGCCGGCGATTGCACCACTGCCACCCACTCGGCCCAGGGTTTACA
AAGTCGACCCAATTAACTTCCGGGGTTTGGTTCAGAAGCTTACCGGCTTGGCCGAGCTCCGATCTCCACGGCTCCAAAAAATGGCGCCACCACCGCTTGATATTTCCCGG
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GTCGCCCTTCAACAAGAATTGGTGCTCTTTCCCTGCTTTGAGCCCGGAGACTCTGGCCATTTTGGATGCAATTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTGAATATTTGACTTTTATATTTTTTGGGCAGTTTCAAATTCTTTATATAAATGCTACTTTTTTTTGTTTTTTTTGGGTTATAATTTCACTTGGATTTTAATTTTAGAA
TATGGATGCATTTTGTGCTTATACTTCTTCATCCTCTTCCTCTTCTTCCAGCTTCTTGGCTAAAAAAAATGACCAATCTGAGCATCAAATTGTGAAGAAGCTGGAATTTT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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