; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc08g0217251 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc08g0217251
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationCMiso1.1chr08:6081407..6083235
RNA-Seq ExpressionCmc08g0217251
SyntenyCmc08g0217251
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0025673.1 RING-H2 finger protein ATL72-like [Cucumis melo var. makuwa]2.1e-10599.47Show/hide
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KAG6603909.1 RING-H2 finger protein ATL72, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-7274.09Show/hide
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XP_008440820.1 PREDICTED: RING-H2 finger protein ATL72-like [Cucumis melo]2.1e-10599.47Show/hide
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XP_011658497.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHA2B [Cucumis sativus]3.6e-10297.37Show/hide
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XP_038881295.1 RING-H2 finger protein ATL79-like [Benincasa hispida]9.0e-8585.34Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KKP7 RING-type domain-containing protein1.8e-10297.37Show/hide
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A0A1S3B2S4 RING-H2 finger protein ATL72-like1.0e-10599.47Show/hide
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A0A5D3CLV8 RING-H2 finger protein ATL72-like1.0e-10599.47Show/hide
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A0A6J1GEN4 RING-H2 finger protein ATL74-like8.5e-7374.09Show/hide
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A0A6J1IJG4 RING-H2 finger protein ATL74-like1.6e-7173.44Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22255 RING-H2 finger protein ATL642.4e-1140.86Show/hide
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Q8H7N9 E3 ubiquitin-protein ligase Os03g01882002.0e-1032.59Show/hide
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        T+    A+   FV+    S+      Q  +P  +   ST S Q                  ++   P  +YGD  + M +           C +CLAEF 
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          DELRVLP C HVFH  CID WL   ++ CPLCR
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Q9LZJ6 RING-H2 finger protein ATL51.5e-1041.57Show/hide
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        +S S  PL  T    +L  +P+++Y   +   P            C +CL+EFE  DE RVLP C HVFH  CID W   RS  CPLCR
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Q9SG96 RING-H2 finger protein ATL722.0e-1033.59Show/hide
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        ICA S  +AL  +      FT   +  N+ ++         ++    Q L  +PV +YG    +M         ++  C+ICL +FE G+++RVLP C H
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Query:  VFHKGCIDQWLPLRSLLCPLCREHTIKE
         FH  CID WL  RS  CP CR+  + E
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Q9SJJ7 RING-H2 finger protein ATL571.2e-1037.5Show/hide
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        SQ + ++PVY Y  ++             + +CVICL++FE G+ ++V+P+C HVFH  C+D WL    + CPLCR + +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G63840.1 RING/U-box superfamily protein4.9e-1240.26Show/hide
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        +PV  + D   N P S C        C +CL +FE  DE+R L NC+H+FH+GC+D+W +    + CPLCR   I +
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AT2G27940.1 RING/U-box superfamily protein8.3e-1237.5Show/hide
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        SQ + ++PVY Y  ++             + +CVICL++FE G+ ++V+P+C HVFH  C+D WL    + CPLCR + +
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AT2G47560.1 RING/U-box superfamily protein1.7e-1240.86Show/hide
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        R  L + S+ P        +L  +P+++Y  SS N P        E   C +CL+EFE  DE R+LP C H FH  CID W   RS  CPLCR
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AT3G10910.1 RING/U-box superfamily protein1.4e-1133.59Show/hide
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        ICA S  +AL  +      FT   +  N+ ++         ++    Q L  +PV +YG    +M         ++  C+ICL +FE G+++RVLP C H
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Query:  VFHKGCIDQWLPLRSLLCPLCREHTIKE
         FH  CID WL  RS  CP CR+  + E
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AT3G62690.1 AtL51.1e-1141.57Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTCTGCCATTGCAGCCCTGTTTGTAATCTCTTTGTTCATCTCCCTTTTCACCTGCTTTCGGCGCCAACTCAACTCTCCTTCCTCTAAACCTCTCTCATCCACATGTAGCA
GCCAGTTACTCACTACCATGCCTGTATATATCTATGGCGATTCGTCTTCAAATATGCCGTCGTCTTATTGTTTTACATCGTTTGAATCCAGGAACTGTGTCATATGTTTG
GCGGAGTTTGAGTATGGAGATGAACTCCGTGTTCTGCCTAACTGCAAGCATGTGTTTCATAAAGGTTGCATTGATCAGTGGCTTCCATTGAGGTCGTTGCTTTGCCCACT
TTGTCGAGAACATACAATCAAGGAGCTTGAGACCATGAGGAGACCCCTTTGTTCAAACTATTGGGCCCGAAATCCTGCGTTCATATTGGCCTTCGGCCTCGGTAGTAATG
CCCCACTGCCCTCTCAATTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCAGACCATCAATTCTGTAAGAGTTATTGCCCTTTCTCTCTCACTTTTAGCGCCTGCATATATGAACTCCAATCATTTAGCTAGTTGGAATCAGCTCATGTAGTAGCGTC
ACATGCACATAAAATTATAATTTCTTTTTCTTAATGGCAAGATGAATGAGAAACCACTGTTGTTTTTTAAAACATACATACACAAAACCAACTTTTTGCTTAGAGGGAAA
AGAAAGATTACCTGAATCTTGATCCAACTATCCTGGCTTTTTAATGGTTTGATAAAAAACGGTGATTTAACTTATCTGCAATTAGCATGGTGATTATTTGCAATATGGGA
TCCTTCCTAAGATCTTCCCACAAAGTTGCAGGATAGTTTGCCGATAAAAAGTGTCAAGGAAAGCTAAAAAGGTATGACAACGAACTGCCATTTCGCCATTAACTATACTG
CTGAGCTTCATTTTTTAACAAAAAAAAATCTAAGCATGATTCACAACCCTTCAAGGCTCTGATATTTCTTTTTGTTTGCATGTAAACTTGCTGCACTAAATTAGGGATCT
TTTGCATATATATTCTATTCAAAACCTAAATGAAGAGATAACCCTTCAAACATTCCTCCTCTTCTTCCCCCAGAAACATGAATTCAGTGGATGATCTCGGTTACAGCAAT
AGACGCCTTCTTAAAGATTCTTCCTTATTTGAACAACCATTTGGAAACCGAGAAAGAATTGTTACTATATGTGCGACTTCTGCCATTGCAGCCCTGTTTGTAATCTCTTT
GTTCATCTCCCTTTTCACCTGCTTTCGGCGCCAACTCAACTCTCCTTCCTCTAAACCTCTCTCATCCACATGTAGCAGCCAGTTACTCACTACCATGCCTGTATATATCT
ATGGCGATTCGTCTTCAAATATGCCGTCGTCTTATTGTTTTACATCGTTTGAATCCAGGAACTGTGTCATATGTTTGGCGGAGTTTGAGTATGGAGATGAACTCCGTGTT
CTGCCTAACTGCAAGCATGTGTTTCATAAAGGTTGCATTGATCAGTGGCTTCCATTGAGGTCGTTGCTTTGCCCACTTTGTCGAGAACATACAATCAAGGAGCTTGAGAC
CATGAGGAGACCCCTTTGTTCAAACTATTGGGCCCGAAATCCTGCGTTCATATTGGCCTTCGGCCTCGGTAGTAATGCCCCACTGCCCTCTCAATTGTAATTTGGATATC
GAGTAATTACAAATCTACCCTAATTTATCTAAACAAGATTAGCAGCTAAAAAGGTTACAACTAGACGAACTCAGAACACACCAATAGCCAGCTAAAATAGTTACAACTAC
ACAAACTCAGAAAATACATCTGAACTAATATAATATTGGTTAGTAAGTATTTAGTATAGTTATTGTTAGTCAATCTATACTTTAATCAAGTGATATACTAAGAATATAGT
TGATTGTTATATATAAGTTAATCTTGGATATATCAAGACTTATTCATTTGATATAATTTAGATAGATAATACATAGTTTATTCATAAGAATTGGTAAACGTTGGTGAGGT
TGCCAACGATTTGAAGTACTGCATTTGATATGTGTTTATGTGATGTATTACATGTTTGGTTTAAATTTATGAGCCACAATTCCAAGACAGGTAATTTTGGCATATCTATA
CGTTTCTGTAATTTCGTGTGGGGTAGTCCACTTGATTTTTTTTTTTTAAAAAAAAGGGCCTAAATGATTAGAAAAGATCTTTTATATTCCTTTAACCTTTGAAAGTTTTC
AATAATGCTTTTAAAGTTAAAACAAAAAGTTCTAAATATCCTTAGGAAACATAATATTTTGTATAAAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNSVDDLGYSNRRLLKDSSLFEQPFGNRERIVTICATSAIAALFVISLFISLFTCFRRQLNSPSSKPLSSTCSSQLLTTMPVYIYGDSSSNMPSSYCFTSFESRNCVICL
AEFEYGDELRVLPNCKHVFHKGCIDQWLPLRSLLCPLCREHTIKELETMRRPLCSNYWARNPAFILAFGLGSNAPLPSQL