; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc08g0222021 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc08g0222021
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationCMiso1.1chr08:10278958..10279608
RNA-Seq ExpressionCmc08g0222021
SyntenyCmc08g0222021
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR027806 - Harbinger transposase-derived nuclease domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A5A7TLQ0 Retrotransposon protein1.1e-8595.93Show/hide
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A0A5A7U6C1 Retrotransposon protein1.1e-8797.67Show/hide
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A0A5A7V4C6 Retrotransposon protein8.1e-8695.93Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43722.1 unknown protein1.4e-1330.99Show/hide
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AT5G28730.1 unknown protein3.5e-1231.68Show/hide
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        L     ++   T   P      G  + NVL +CD    F Y   G  GS  D+R+L  AIS
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AT5G28950.1 unknown protein5.7e-1547.83Show/hide
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        +C+GA+D T+I   V     P+FR RKG+I+ N+L  C+   +F+YVL+GWEGSA DS++L DA++R +
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AT5G41980.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)4.6e-2536.57Show/hide
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        C+G +D  +I V V   ++  FR   G +  NVL        F YVLAGWEGSA+D ++L  A++R N LQV +G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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