; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc08g0222911 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc08g0222911
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCMiso1.1chr08:12023856..12033428
RNA-Seq ExpressionCmc08g0222911
SyntenyCmc08g0222911
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0045989.1 hypothetical protein E6C27_scaffold243G005450 [Cucumis melo var. makuwa]3.1e-0451.32Show/hide
Query:  MSPSSASRLCLISSVLSLS----RFVHRRRSPAVSIDHCKRPSFSSLSLHQAIFVTCQ----RLRCKSPIIRLPSR
        MSPSS     +  SV S       F+H RRSP  SID  KR SFSS SLH+AIFV  Q    RLR K  ++ LPSR
Subjt:  MSPSSASRLCLISSVLSLS----RFVHRRRSPAVSIDHCKRPSFSSLSLHQAIFVTCQ----RLRCKSPIIRLPSR
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TXM7 Uncharacterized protein1.5e-0451.32Show/hide
Query:  MSPSSASRLCLISSVLSLS----RFVHRRRSPAVSIDHCKRPSFSSLSLHQAIFVTCQ----RLRCKSPIIRLPSR
        MSPSS     +  SV S       F+H RRSP  SID  KR SFSS SLH+AIFV  Q    RLR K  ++ LPSR
Subjt:  MSPSSASRLCLISSVLSLS----RFVHRRRSPAVSIDHCKRPSFSSLSLHQAIFVTCQ----RLRCKSPIIRLPSR
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCACCGTCGTCTGCAAGCCGTCTCTGTTTGATCTCCTCCGTCCTCTCCTTAAGTCGTTTCGTGCATCGCCGTCGAAGCCCAGCCGTGTCAATCGACCACTGTAAACG
CCCAAGCTTCTCTTCGCTGAGCCTTCACCAAGCCATCTTCGTCACCTGTCAGCGTCTCCGTTGCAAGTCGCCAATCATCCGCTTGCCGTCACGGTCCATCGTTCGTCGTC
GTAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTAGGGTCTTGGGATTCGTGGTGACTTTTCATCATCTTCTTTCTTAAGCAACCCTCAAAAAACCCTAGCCGCTAACAAGGTTCAGTCGCCGTTGCCGTCACGTTCATCTC
TTCCATCGCAACCCGTCGACCACCGCTGCTACTTCATCGCAAACCACAAGCCGATATACCATTCCCAAGCCTTCCATCCGCAGATCCAAGCCGAATGTCACCGTCGTCTG
CAAGCCGTCTCTGTTTGATCTCCTCCGTCCTCTCCTTAAGTCGTTTCGTGCATCGCCGTCGAAGCCCAGCCGTGTCAATCGACCACTGTAAACGCCCAAGCTTCTCTTCG
CTGAGCCTTCACCAAGCCATCTTCGTCACCTGTCAGCGTCTCCGTTGCAAGTCGCCAATCATCCGCTTGCCGTCACGGTCCATCGTTCGTCGTCGTAATTGATCGCCTCA
CAATCGCGTCCTCAGCCATCCGAGTTGGGTGCGTGTTTGCGAGTTGCGTCCCCAGTTGTCCGAGCCGCACACGTGTATGCGATCTGCGTTTCCCAACTGCTCGAGCTGCC
CTTTCCTTTCAACCGCACGCCAGCCGTCTGAGCCGCTTCTAGTTTTAGCTTGAGTTGAGCCGAGCCACCTAACAATTTTTTAGCCACCAAGCCTATTTTGGTCTTTTCAC
CTATATTTTTTTGTAAGTTTGAGTTGAGTTTTGGTTAATGCCTAAGAAAGAATCAGTTGGACCCTAAATAATTTAATTTTAGATTAAATTGAATTATTTTTCTTAAAGGA
TTGAAAGTGAGCTGTGGAGCATCGTCCTAAATTAAGGTTGAGTTGGTTCCGACATTAACTTTGGATAAGTTGAGTTAACTAGATTTTTGGATCCTAAATCAACTACAAAT
TATCATATTAGTATTTTACCCTTATTGTTTAGGATTATTCCTTGGAAGCTTGACCTTGCTGTTAGGATTACATTTGGTTAAGTTAATCTCCAAGTAAGAGATTTTCCTAC
TAGACCTTCGTATTGAAGTGAGAGCTTGCATGAAATTCTTCTACTATGCTTTGATGTAGTTGGTATGCATAATATGATTATGTGCATAGTGATTGGTAGTCAAGATTATT
CCATGATTATGATGACTGATAGATCCGATTGAGATATGTTTATGATGATAATATTTGAATATCAATGTTATGATTGATACTTATGCCATGTTTATGATGATGTGATAATA
TGTTCATGTTACAGATAGGGTGTACTGCTATCTTTACCTATTAGAGTTGTACCCACATGGGTGTCCCTTGGGATGACCCACCTTTTTATGACTGTATAGTCCGACAGGAT
CACTAGTCCAGTATGACATAGACATGATTATGAGTGATTCGACGGGGTCACTCGCAGCTCGATTGTCTTAATATTTCCCCCAGATATTGTAATGCCCCAAAATTTAAGTA
GTATATTAAAGACCAGTTTGTCTTAGGTGTTCCTTTAAGTTCACCGAAGACCAGAGATGTTCCTACGGGATCACAGATCGCACGTGTTCGGGAATGTGCCAATTTAGGGG
CAGAGGTAGAGGTAAAGACAGAGGAAAGCTCGCGAAGGATAAGAAGTGACCGTGGAAAGTCATAGGGAACATTTTTGCTTTTGCCTTATGTTATTTGTTCAGTTTTAAGT
ATTTATGTATTTATTTTTATTAATTTTCTCCTTTTAAAACTAGATAGGGCCCGAGTTAGGATTTTATTTTATTTATTTCTTATTCATTTTTATATACATTTGTTTTCAAA
ATTTTAATGAGTAATTTGAGGTTTTATTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSPSSASRLCLISSVLSLSRFVHRRRSPAVSIDHCKRPSFSSLSLHQAIFVTCQRLRCKSPIIRLPSRSIVRRRN