| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0025807.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 1.9e-84 | 100 | Show/hide |
Query: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLTVRNKYPFPIITYLFDRLHGA
MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLTVRNKYPFPIITYLFDRLHGA
Subjt: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLTVRNKYPFPIITYLFDRLHGA
Query: KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQ
KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQ
Subjt: KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQ
|
|
| KAA0032849.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 2.1e-83 | 81.19 | Show/hide |
Query: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
MRVLEKYRDVM DSLPKSLPP+RMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR FI+PAKAPYGAPVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLT
Subjt: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
Query: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
VRNKYP PIIT LFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDE KTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTN PATFC LMNQVFHEYLDKFV VVYSTTM
Subjt: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
Query: KE
+E
Subjt: KE
|
|
| KAA0037220.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 2.1e-83 | 81.19 | Show/hide |
Query: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
MRVLEKYRDVM DSLPKSLPP+RMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR FI+PAKAPYGAPVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLT
Subjt: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
Query: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
VRNKYP PIIT LFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDE KTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTN PATFC LMNQVFHEYLDKFV VVYSTTM
Subjt: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
Query: KE
+E
Subjt: KE
|
|
| KAA0063412.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 2.1e-83 | 81.19 | Show/hide |
Query: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
MRVLEKYRDVM DSLPKSLPP+RMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR FI+PAKAPYGAPVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLT
Subjt: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
Query: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
VRNKYP PIIT LFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDE KTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTN PATFC LMNQVFHEYLDKFV VVYSTTM
Subjt: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
Query: KE
+E
Subjt: KE
|
|
| KAA0067557.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 2.1e-83 | 81.19 | Show/hide |
Query: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
MRVLEKYRDVM DSLPKSLPP+RMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR FI+PAKAPYGAPVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLT
Subjt: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
Query: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
VRNKYP PIIT LFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDE KTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTN PATFC LMNQVFHEYLDKFV VVYSTTM
Subjt: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
Query: KE
+E
Subjt: KE
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SM68 Reverse transcriptase | 9.2e-85 | 100 | Show/hide |
Query: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLTVRNKYPFPIITYLFDRLHGA
MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLTVRNKYPFPIITYLFDRLHGA
Subjt: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYRFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLTVRNKYPFPIITYLFDRLHGA
Query: KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQ
KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQ
Subjt: KYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQ
|
|
| A0A5A7T0E2 Reverse transcriptase | 1.0e-83 | 81.19 | Show/hide |
Query: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
MRVLEKYRDVM DSLPKSLPP+RMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR FI+PAKAPYGAPVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLT
Subjt: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
Query: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
VRNKYP PIIT LFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDE KTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTN PATFC LMNQVFHEYLDKFV VVYSTTM
Subjt: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
Query: KE
+E
Subjt: KE
|
|
| A0A5A7UXR6 Reverse transcriptase | 1.0e-83 | 81.19 | Show/hide |
Query: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
MRVLEKYRDVM DSLPKSLPP+RMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR FI+PAKAPYGAPVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLT
Subjt: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
Query: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
VRNKYP PIIT LFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDE KTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTN PATFC LMNQVFHEYLDKFV VVYSTTM
Subjt: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
Query: KE
+E
Subjt: KE
|
|
| A0A5D3BRZ6 Reverse transcriptase | 1.0e-83 | 81.19 | Show/hide |
Query: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
MRVLEKYRDVM DSLPKSLPP+RMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR FI+PAKAPYGAPVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLT
Subjt: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
Query: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
VRNKYP PIIT LFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDE KTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTN PATFC LMNQVFHEYLDKFV VVYSTTM
Subjt: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
Query: KE
+E
Subjt: KE
|
|
| A0A5D3C4R1 Reverse transcriptase | 1.0e-83 | 81.19 | Show/hide |
Query: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
MRVLEKYRDVM DSLPKSLPP+RMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR FI+PAKAPYGAPVLFQ+KKDGSLRLCIDYR LNKLT
Subjt: MRVLEKYRDVMLDSLPKSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAYR--------------------FIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLT
Query: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
VRNKYP PIIT LFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDE KTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTN PATFC LMNQVFHEYLDKFV VVYSTTM
Subjt: VRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFV-------VVYSTTM
Query: KE
+E
Subjt: KE
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein | 4.3e-23 | 32.98 | Show/hide |
Query: VLEKYRDVMLDSLPKSLP-PQRMIDHEIEL-------------VPGAKPPAKN-------AYRFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLTV
+ ++++D+ ++ + LP P + ++ E+EL +P K A N I+ +KA PV+F KK+G+LR+ +DY+ LNK
Subjt: VLEKYRDVMLDSLPKSLP-PQRMIDHEIEL-------------VPGAKPPAKN-------AYRFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLTV
Query: RNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFVVVY
N YP P+I L ++ G+ F+KLDL+S Y+ +R+ +GDE K G FE+LVMP+G++ PA F +N + E + VV Y
Subjt: RNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFVVVY
|
|
| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 4.3e-23 | 32.98 | Show/hide |
Query: VLEKYRDVMLDSLPKSLP-PQRMIDHEIEL-------------VPGAKPPAKN-------AYRFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLTV
+ ++++D+ ++ + LP P + ++ E+EL +P K A N I+ +KA PV+F KK+G+LR+ +DY+ LNK
Subjt: VLEKYRDVMLDSLPKSLP-PQRMIDHEIEL-------------VPGAKPPAKN-------AYRFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNKLTV
Query: RNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFVVVY
N YP P+I L ++ G+ F+KLDL+S Y+ +R+ +GDE K G FE+LVMP+G++ PA F +N + E + VV Y
Subjt: RNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFVVVY
|
|
| P31843 RNA-directed DNA polymerase homolog | 1.6e-38 | 73.08 | Show/hide |
Query: SLRLCIDYRILNKLTVRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKF
SLR+CIDYR L K+T++NKYP P + LFDRL A +F+KLDLRSGY+QVRIA+GDE KTTCVTRYG+FEF VMPFGLTN ATFC LMN V +EYLD F
Subjt: SLRLCIDYRILNKLTVRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKF
Query: VVVY
VVVY
Subjt: VVVY
|
|
| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 5.3e-29 | 37.7 | Show/hide |
Query: EKYRDVMLDSLP------KSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAY--------------------RFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNK
+KYR+++ + LP ++P + H+IE+ PGA+ P Y +FI P+K+P +PV+ KKDG+ RLC+DYR LNK
Subjt: EKYRDVMLDSLP------KSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAY--------------------RFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNK
Query: LTVRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFVVVY
T+ + +P P I L R+ A+ F+ LDL SGY+Q+ + D KT VT G +E+ VMPFGL N P+TF M F + +FV VY
Subjt: LTVRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFVVVY
|
|
| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 5.3e-29 | 37.7 | Show/hide |
Query: EKYRDVMLDSLP------KSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAY--------------------RFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNK
+KYR+++ + LP ++P + H+IE+ PGA+ P Y +FI P+K+P +PV+ KKDG+ RLC+DYR LNK
Subjt: EKYRDVMLDSLP------KSLPPQRMIDHEIELVPGAKPPAKNAY--------------------RFIKPAKAPYGAPVLFQKKKDGSLRLCIDYRILNK
Query: LTVRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFVVVY
T+ + +P P I L R+ A+ F+ LDL SGY+Q+ + D KT VT G +E+ VMPFGL N P+TF M F + +FV VY
Subjt: LTVRNKYPFPIITYLFDRLHGAKYFSKLDLRSGYYQVRIAEGDESKTTCVTRYGAFEFLVMPFGLTNTPATFCMLMNQVFHEYLDKFVVVY
|
|
