| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| ADJ18449.1 gag/pol protein, partial [Bryonia dioica] | 7.7e-57 | 83.82 | Show/hide |
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EVENE GKTIKT RSDRG EYMD +FQDYLIE GIQSQLSAPSTPQQNGVSERRN TLLDMVRSMMS+++L DSFWGYALE I+ILNNVPSKS+ ET Y
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ELWKGRK SL +FRIWGCPAHVLVQN KKLE RSKL
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|
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| KAA0025945.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.2e-52 | 77.21 | Show/hide |
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EVEN K IK RSDRG EYMDLRFQDY+IEHGIQSQLSAP TPQQNGVSERRN TLLDMVRSMMS+++L SFWGYA+E ++ILNNVPSKS+ ET +
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ELW+GRK SL HFRIWGCPAHVLV N KKLE RS+L
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| KAA0037569.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.1e-58 | 86.76 | Show/hide |
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EVENESGKTIKTFRSDRG EYMDLRFQDYLI+HGIQSQLSAPSTPQQNGVSERRN TLLDMVRSMMSF++L DSF GYALE TIYILNNVP KS+ ET Y
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ELWK RK SL HFRIWGCPAHVLVQN K LERR KL
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| KAA0063836.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.8e-53 | 77.94 | Show/hide |
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EVEN K IK RS+RGEEYMDLRFQDY+IEHGIQSQLSAP TPQQNGVSERRN TLLDMVRSMMS+++L SFWGYA+E T++ILNNVPSKS+ ET +
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ELW+GRK SL HFRIWGCPAHVLV N KKLE RS+L
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| TYK30724.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 7.5e-60 | 86.76 | Show/hide |
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EVENESGKTIKT RSDRGEEYMDLRFQDYLIEH IQSQLSAP+TPQQNGVSERRN LLDMVRSM SF++L DSFWGYALE TIYILNNVPSKS+ ET Y
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ELWKGRKGSL HFRIWGCP+HVLVQN KLE RSKL
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7T8E8 Gag/pol protein | 1.5e-58 | 86.76 | Show/hide |
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EVENESGKTIKTFRSDRG EYMDLRFQDYLI+HGIQSQLSAPSTPQQNGVSERRN TLLDMVRSMMSF++L DSF GYALE TIYILNNVP KS+ ET Y
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ELWK RK SL HFRIWGCPAHVLVQN K LERR KL
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|
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| A0A5A7TZD0 Gag/pol protein | 5.6e-53 | 77.21 | Show/hide |
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EVEN K IK RSDRG EYMDLRFQDY+IEHGIQSQLSAP TPQQNGVSERRN TLLDMVRSMMS+++L SFWGYA+E ++ILNNVPSKS+ ET +
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ELW+GRK SL HFRIWGCPAHVLV N KKLE RS+L
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| A0A5A7VBN3 Gag/pol protein | 8.6e-54 | 77.94 | Show/hide |
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EVEN K IK RS+RGEEYMDLRFQDY+IEHGIQSQLSAP TPQQNGVSERRN TLLDMVRSMMS+++L SFWGYA+E T++ILNNVPSKS+ ET +
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Query: ELWKGRKGSLCHFRIWGCPAHVLVQNLKKLERRSKL
ELW+GRK SL HFRIWGCPAHVLV N KKLE RS+L
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| A0A5D3E496 Gag/pol protein | 3.6e-60 | 86.76 | Show/hide |
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EVENESGKTIKT RSDRGEEYMDLRFQDYLIEH IQSQLSAP+TPQQNGVSERRN LLDMVRSM SF++L DSFWGYALE TIYILNNVPSKS+ ET Y
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ELWKGRKGSL HFRIWGCP+HVLVQN KLE RSKL
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| E2GK51 Gag/pol protein (Fragment) | 3.7e-57 | 83.82 | Show/hide |
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EVENE GKTIKT RSDRG EYMD +FQDYLIE GIQSQLSAPSTPQQNGVSERRN TLLDMVRSMMS+++L DSFWGYALE I+ILNNVPSKS+ ET Y
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Query: ELWKGRKGSLCHFRIWGCPAHVLVQNLKKLERRSKL
ELWKGRK SL +FRIWGCPAHVLVQN KKLE RSKL
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04146 Copia protein | 3.3e-18 | 36.84 | Show/hide |
Query: DRGEEYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQQNGVSERRNLTLLDMVRSMMSFSRLSDSFWGYALEITIYILNNVPSKSIFE---TLYELWKGRKGSLCH
D G EY+ + + ++ GI L+ P TPQ NGVSER T+ + R+M+S ++L SFWG A+ Y++N +PS+++ + T YE+W +K L H
Subjt: DRGEEYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQQNGVSERRNLTLLDMVRSMMSFSRLSDSFWGYALEITIYILNNVPSKSIFE---TLYELWKGRKGSLCH
Query: FRIWGCPAHVLVQN
R++G +V ++N
Subjt: FRIWGCPAHVLVQN
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| P10978 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 5.2e-24 | 39.71 | Show/hide |
Query: VENESGKTIKTFRSDRGEEYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQQNGVSERRNLTLLDMVRSMMSFSRLSDSFWGYALEITIYILNNVPSKSI-FETLY
VE E+G+ +K RSD G EY F++Y HGI+ + + P TPQ NGV+ER N T+++ VRSM+ ++L SFWG A++ Y++N PS + FE
Subjt: VENESGKTIKTFRSDRGEEYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQQNGVSERRNLTLLDMVRSMMSFSRLSDSFWGYALEITIYILNNVPSKSI-FETLY
Query: ELWKGRKGSLCHFRIWGCP--AHVLVQNLKKLERRS
+W ++ S H +++GC AHV + KL+ +S
Subjt: ELWKGRKGSLCHFRIWGCP--AHVLVQNLKKLERRS
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| Q12491 Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein | 1.2e-04 | 27.47 | Show/hide |
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++N+ + + DRG EY + + GI + + + + +GV+ER N TLL+ R+++ S L + W A+E + I N++ S
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| Q94HW2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 | 1.2e-12 | 28.47 | Show/hide |
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+EN I TF SD G E++ L +Y +HGI S P TP+ NG+SER++ +++ +++S + + ++W YA + +Y++N +P+ + E+ +
Subjt: VENESGKTIKTFRSDRGEEYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQQNGVSERRNLTLLDMVRSMMSFSRLSDSFWGYALEITIYILNNVPSKSI-FETLY
Query: ELWKGRKGSLCHFRIWGCPAHVLVQ--NLKKLERRSK
+ G + R++GC + ++ N KL+ +S+
Subjt: ELWKGRKGSLCHFRIWGCPAHVLVQ--NLKKLERRSK
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| Q9ZT94 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 | 1.3e-14 | 31.39 | Show/hide |
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VEN I T SD G E++ LR DYL +HGI S P TP+ NG+SER++ +++M +++S + + ++W YA + +Y++N +P+ + ++ +
Subjt: VENESGKTIKTFRSDRGEEYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQQNGVSERRNLTLLDMVRSMMSFSRLSDSFWGYALEITIYILNNVPSKSI-FETLY
Query: ELWKGRKGSLCHFRIWGCPAHVLVQ--NLKKLERRSK
+ G+ + +++GC + ++ N KLE +SK
Subjt: ELWKGRKGSLCHFRIWGCPAHVLVQ--NLKKLERRSK
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