| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
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| ADJ18449.1 gag/pol protein, partial [Bryonia dioica] | 1.6e-101 | 82.67 | Show/hide |
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+LEH+Y ISFE+NE FI K I +CS+I ENNLYKLRPTRAN VLNTEMFRT ETQNK+QKVSSNA LWHLRLGHINLN I RLVKSG+LNQLEDNSLPP
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C+SCLEGK+TKR FTGKGLRAK PLEL+H DLC PMNVKA+GGYEYFISFIDD+SRYGHVYL+ +KS+SFEKFKEYKAEVENE GKTI TLRSDRGG+Y
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MD +FQDYLIE GIQSQLSAPSTPQ
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| KAA0025945.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.2e-89 | 72.25 | Show/hide |
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++EHMY I+F +NEAFI++ +H+CS+ LENNLY LRP A VLN EMFRT TQNKRQ++S +N LWHLRLGHINL+ IGRLVK+GLLN+L+D SL
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PPC+SCLEGK+TKR FTGKG RAK PLELIH DLC PMNVKA+GG+EYFISFIDDYSRYG++YL+++KS++ EKFKEYK EVEN K I LRSDRGG
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| KAA0035907.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 6.7e-87 | 70.93 | Show/hide |
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++EHMY I+F +NEAFI++ +H+CS+ LENNLY LRP A VLN EMFRT TQNKRQ++S +N LWHLRLGHINL+ IGRLVK GLLN+L+D SL
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PPC+SCLEGK+TKR FTGKG RAK PLELIH DLC PMNVKA+G +EYFISFIDDYSRYG++YL+++KS++ EKFKEYK EVEN K I RSDRGG
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| KAA0060534.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.3e-87 | 72.25 | Show/hide |
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++EHMY ISF +NEAFI + +H+CS LE+NLY L+P VLN EMFRT TQNKRQ++SS N LWHLRLGHINL+ IGRLVK+GLLN+LED+SL
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PPC+SCLEGK+TKR FTGKG RAK PLELIH DLC PMNVKA GG+EYFISFIDDYS YG++YLI++KS++ EKFKEYK EVEN K I LRSDRGG
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+YMDLRFQDY+IEHGIQSQLSAP TPQ
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| KAA0067938.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.2e-81 | 69.16 | Show/hide |
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++EHMY I+F +NEAFI + + LE+NLY LRP A VLN EMFRT TQNKRQ++S +N LWHLRL HINL+ IGRLVK+GLLN+L+D+SL
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PPC+SCLEGK+TKR FTGK RAK PLELIH DLC PMNVKA+GG+EYFISFIDDYSRYG++YL+++K ++ EKFKEYK EVEN K I LRSDRGG
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
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| A0A5A7T2V9 Gag/pol protein | 3.2e-87 | 70.93 | Show/hide |
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++EHMY I+F +NEAFI++ +H+CS+ LENNLY LRP A VLN EMFRT TQNKRQ++S +N LWHLRLGHINL+ IGRLVK GLLN+L+D SL
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PPC+SCLEGK+TKR FTGKG RAK PLELIH DLC PMNVKA+G +EYFISFIDDYSRYG++YL+++KS++ EKFKEYK EVEN K I RSDRGG
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| A0A5A7TZD0 Gag/pol protein | 2.0e-89 | 72.25 | Show/hide |
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PPC+SCLEGK+TKR FTGKG RAK PLELIH DLC PMNVKA+GG+EYFISFIDDYSRYG++YL+++KS++ EKFKEYK EVEN K I LRSDRGG
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| A0A5A7VJG3 Gag/pol protein | 1.6e-81 | 69.16 | Show/hide |
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Subjt: MLEHMYRISFEINEAFIFRKDIHVCSSILENNLYKLRPTRANFVLNTEMFRTTETQNKRQKVS--SNALLWHLRLGHINLNTIGRLVKSGLLNQLEDNSL
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PPC+SCLEGK+TKR FTGK RAK PLELIH DLC PMNVKA+GG+EYFISFIDDYSRYG++YL+++K ++ EKFKEYK EVEN K I LRSDRGG
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| A0A5D3BNE1 Gag/pol protein | 6.5e-88 | 72.25 | Show/hide |
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++EHMY ISF +NEAFI + +H+CS LE+NLY L+P VLN EMFRT TQNKRQ++SS N LWHLRLGHINL+ IGRLVK+GLLN+LED+SL
Subjt: MLEHMYRISFEINEAFIFRKDIHVCSSILENNLYKLRPTRANFVLNTEMFRTTETQNKRQKVSS--NALLWHLRLGHINLNTIGRLVKSGLLNQLEDNSL
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Query: KYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQ
+YMDLRFQDY+IEHGIQSQLSAP TPQ
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| E2GK51 Gag/pol protein (Fragment) | 7.9e-102 | 82.67 | Show/hide |
Query: MLEHMYRISFEINEAFIFRKDIHVCSSILENNLYKLRPTRANFVLNTEMFRTTETQNKRQKVSSNALLWHLRLGHINLNTIGRLVKSGLLNQLEDNSLPP
+LEH+Y ISFE+NE FI K I +CS+I ENNLYKLRPTRAN VLNTEMFRT ETQNK+QKVSSNA LWHLRLGHINLN I RLVKSG+LNQLEDNSLPP
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Query: CDSCLEGKITKRCFTGKGLRAKTPLELIHLDLCEPMNVKAQGGYEYFISFIDDYSRYGHVYLIQNKSDSFEKFKEYKAEVENESGKTINSTLRSDRGGKY
C+SCLEGK+TKR FTGKGLRAK PLEL+H DLC PMNVKA+GGYEYFISFIDD+SRYGHVYL+ +KS+SFEKFKEYKAEVENE GKTI TLRSDRGG+Y
Subjt: CDSCLEGKITKRCFTGKGLRAKTPLELIHLDLCEPMNVKAQGGYEYFISFIDDYSRYGHVYLIQNKSDSFEKFKEYKAEVENESGKTINSTLRSDRGGKY
Query: MDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQ
MD +FQDYLIE GIQSQLSAPSTPQ
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04146 Copia protein | 2.9e-16 | 32.2 | Show/hide |
Query: KVSSNALLWHLRLGHINLNTIGRLVKSGLLNQLEDNSL--------PPCDSCLEGKITKRCFTGKGLRAKT----PLELIHLDLCEPMNVKAQGGYEYFI
K +N LWH R GHI + G+L++ N D SL C+ CL GK + F K L+ KT PL ++H D+C P+ YF+
Subjt: KVSSNALLWHLRLGHINLNTIGRLVKSGLLNQLEDNSL--------PPCDSCLEGKITKRCFTGKGLRAKT----PLELIHLDLCEPMNVKAQGGYEYFI
Query: SFIDDYSRYGHVYLIQNKSDSFEKFKEYKAEVENESGKTINSTLRSDRGGKYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQ
F+D ++ Y YLI+ KSD F F+++ A+ E + L D G +Y+ + + ++ GI L+ P TPQ
Subjt: SFIDDYSRYGHVYLIQNKSDSFEKFKEYKAEVENESGKTINSTLRSDRGGKYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQ
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| P10978 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 1.9e-28 | 37.97 | Show/hide |
Query: LWHLRLGHINLNTIGRLVKSGLLNQLEDNSLPPCDSCLEGKITKRCFTGKGLRAKTPLELIHLDLCEPMNVKAQGGYEYFISFIDDYSRYGHVYLIQNKS
LWH R+GH++ + L K L++ + ++ PCD CL GK + F R L+L++ D+C PM +++ GG +YF++FIDD SR VY+++ K
Subjt: LWHLRLGHINLNTIGRLVKSGLLNQLEDNSLPPCDSCLEGKITKRCFTGKGLRAKTPLELIHLDLCEPMNVKAQGGYEYFISFIDDYSRYGHVYLIQNKS
Query: DSFEKFKEYKAEVENESGKTINSTLRSDRGGKYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQ
F+ F+++ A VE E+G+ + LRSD GG+Y F++Y HGI+ + + P TPQ
Subjt: DSFEKFKEYKAEVENESGKTINSTLRSDRGGKYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQ
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| Q12491 Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein | 3.8e-08 | 25.84 | Show/hide |
Query: TTETQNKRQKVSSNAL-LWHLRLGHINLNTIGRLVKSGLLNQLEDNSLP-------PCDSCLEGKITKRCFTGKGLRAK-----TPLELIHLDLCEPMNV
T NK + V+ L H LGH N +I + +K + L+++ + C CL GK TK KG R K P + +H D+ P++
Subjt: TTETQNKRQKVSSNAL-LWHLRLGHINLNTIGRLVKSGLLNQLEDNSLP-------PCDSCLEGKITKRCFTGKGLRAK-----TPLELIHLDLCEPMNV
Query: KAQGGYEYFISFIDDYSRYGHVYLIQNKSDS--FEKFKEYKAEVENESGKTINSTLRSDRGGKYMDLRFQDYLIEHGI
+ YFISF D+ +R+ VY + ++ + F A ++N+ + ++ DRG +Y + + GI
Subjt: KAQGGYEYFISFIDDYSRYGHVYLIQNKSDS--FEKFKEYKAEVENESGKTINSTLRSDRGGKYMDLRFQDYLIEHGI
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| Q94HW2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 | 3.0e-13 | 30.38 | Show/hide |
Query: WHLRLGHINLNTIGRLVKSGLLNQLE-DNSLPPCDSCLEGKITKRCFTGKGLRAKTPLELIHLDLCEPMNVKAQGGYEYFISFIDDYSRYGHVYLIQNKS
WH RLGH + + ++ + L+ L + C CL K K F+ + + PLE I+ D+ + + Y Y++ F+D ++RY +Y ++ KS
Subjt: WHLRLGHINLNTIGRLVKSGLLNQLE-DNSLPPCDSCLEGKITKRCFTGKGLRAKTPLELIHLDLCEPMNVKAQGGYEYFISFIDDYSRYGHVYLIQNKS
Query: DSFEKFKEYKAEVENESGKTINSTLRSDRGGKYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQ
E F +K +EN +T T SD GG+++ L +Y +HGI S P TP+
Subjt: DSFEKFKEYKAEVENESGKTINSTLRSDRGGKYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQ
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| Q9ZT94 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 | 1.9e-15 | 33.54 | Show/hide |
Query: WHLRLGHINLNTIGRLVKSGLLNQLE-DNSLPPCDSCLEGKITKRCFTGKGLRAKTPLELIHLDLCEPMNVKAQGGYEYFISFIDDYSRYGHVYLIQNKS
WH RLGH +L + ++ + L L + L C C K K F+ + + PLE I+ D+ + + Y Y++ F+D ++RY +Y ++ KS
Subjt: WHLRLGHINLNTIGRLVKSGLLNQLE-DNSLPPCDSCLEGKITKRCFTGKGLRAKTPLELIHLDLCEPMNVKAQGGYEYFISFIDDYSRYGHVYLIQNKS
Query: DSFEKFKEYKAEVENESGKTINSTLRSDRGGKYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQ
+ F +K+ VEN +T TL SD GG+++ LR DYL +HGI S P TP+
Subjt: DSFEKFKEYKAEVENESGKTINSTLRSDRGGKYMDLRFQDYLIEHGIQSQLSAPSTPQ
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