; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc08g0226631 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc08g0226631
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationCMiso1.1chr08:18928595..18932237
RNA-Seq ExpressionCmc08g0226631
SyntenyCmc08g0226631
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ADN33754.1 retrotransposon protein [Cucumis melo subsp. melo]8.4e-7547.54Show/hide
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ADN34114.1 retrotransposon protein [Cucumis melo subsp. melo]3.0e-7248.1Show/hide
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KAA0060069.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]3.0e-8872.8Show/hide
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TYK03086.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-6945.35Show/hide
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TYK29878.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]7.2e-13598.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7V2R5 Retrotransposon protein1.4e-8872.8Show/hide
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A0A5D3BY22 Retrotransposon protein5.1e-7045.35Show/hide
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A0A5D3E267 Retrotransposon protein3.5e-13598.33Show/hide
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E5GBB2 Retrotransposon protein4.0e-7547.54Show/hide
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E5GCB5 Retrotransposon protein1.4e-7248.1Show/hide
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        +  +  R   SGSKRKR G   ++ D+ R A+   ++QL  IA
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATGCCAGGTTGCACTTTGACGTCCATAACTGTAATCGAAAGCAAGACCAAGCTATTGAAAAGAACGATCATGGCCATTGTCGAAATTCAGGGACCGACGTGTAGT
GGCTTTGGATGGAACTATGAGCTTAAGTGCATCATTGCAGCAAAGGACGTCTTCGATAGTTGGGCCAGAACGCATCTTGCATGCAAAGGCCTGCTTAACAAGCCC
TTCCCCCATTACGATGAGTTGTCGTATGTCTTTGAGAAAGACTGCACCACGGGGGCCAGTGTAGAGATGTTCACTGATATAGGGTCAAATGTGCCAGGCGAAAGT
GATGGAGTTCAAGCAGAAGATGGGTTGGATATGGAGTTCCCTACTATGTGCAGCCTGAGAATGAATGTGTCACTCGAGGACAGGATGGGTGCACGACCTAGTATG
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CTCAGGGACATCGCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTGCTTGTTTATGAGTCTTCAATGCTTAATTACTACTCCCATTTCCCATGTATATATTCTTCGTATGCCATTCTTTAATTTGTGTCTTCTATCCGATTTTCATC
TACACAGCAACGGTTGGTTCCTCATTTTTTTGGGTATCCAAAGCAAAGGGATTTCTTTCTCCTTATAGAGGACAACGATATCACGTCCAAGAGTGACGAGGAGCT
GAAAACGCTCCAAAGACACTGAAGGAGTTCTTCAACATGAAACATTCATCCGTACGTAATGTTATTGAATGTGCGTTCAATATTTTGAAGGGTCGGTGGGCAATC
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TACCTACCCCAGTTGGTGAGAATGATGGGCGAGAGGATGCCAGGTTGCACTTTGACGTCCATAACTGTAATCGAAAGCAAGACCAAGCTATTGAAAAGAACGATC
ATGGCCATTGTCGAAATTCAGGGACCGACGTGTAGTGGCTTTGGATGGAACTATGAGCTTAAGTGCATCATTGCAGCAAAGGACGTCTTCGATAGTTGGGCCAGA
ACGCATCTTGCATGCAAAGGCCTGCTTAACAAGCCCTTCCCCCATTACGATGAGTTGTCGTATGTCTTTGAGAAAGACTGCACCACGGGGGCCAGTGTAGAGATG
TTCACTGATATAGGGTCAAATGTGCCAGGCGAAAGTGATGGAGTTCAAGCAGAAGATGGGTTGGATATGGAGTTCCCTACTATGTGCAGCCTGAGAATGAATGTG
TCACTCGAGGACAGGATGGGTGCACGACCTAGTATGTCCACTGTCGATAGGATGGGTTTGAGTGGATCAAAGAGGAAGCGCAGAGGGCAGTTTGAGACTGTGGAT
GTTTTTCGCGATGCCATGCACATTTCCGATGACCAGCTCAGGGACATCGCATAATGGATAATGATAGCTAGGAAGGAGGAAGACTCTGTGCGGCGGGCCATCATT
TACACATTTGCAGGTTATCCCTTAGCTCAATGTGGAGGACAGTGCACGCTGTATGATGGTCATAACCAAGAACTCCCTATCATGAAAGCTAGCCTTCTTGGACCT
ACCGGATGCGATGAAGCTCGCCTTTGCAACGTCAATTGGCACGATAACTCATAATTGGTCTACCACATCCACCGCATGACCCGTAGTTGTTTTGGCCTTCTGAAC
ACTTTTTACTCTGAATTACTTTTTATGATCGCATTGACTTCACGTTTACCGTTATTTATAAGAATGACTTTTATTTTGTAACTCATGTTGTTTCAATGAATTTAT
GTTTGCACT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKHSSVRNVIECAFNILKGRWAILHRKSYYSVQVQCRTRMASCLLHNLINREMMNVETEASNEWTQWRDSLAEAMFSEWQLLWPTRRGTQSIYGRRQWSHVSLIA
SWTWLTWREGGRWRSDNVTFRPGYLPQLVRMMGERMPGCTLTSITVIESKTKLLKRTIMAIVEIQGPTCSGFGWNYELKCIIAAKDVFDSWARTHLACKGLLNKP
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LRDIA