; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc08g0227271 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc08g0227271
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionZinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like
Genome locationCMiso1.1chr08:20171385..20172599
RNA-Seq ExpressionCmc08g0227271
SyntenyCmc08g0227271
Gene Ontology termsGO:0000398 - mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
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GO:0008972 - phosphomethylpyrimidine kinase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008906 - HAT, C-terminal dimerisation domain
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily
IPR025525 - hAT-like transposase, RNase-H fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK03730.1 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa]7.3e-20189.77Show/hide
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B9FJG3 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 14.1e-4532.05Show/hide
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Query:  KIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIAS-KSAFS--TGGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWINSDP
        +++ YL E+      +FDIL WWK+N+ ++  L +M RDIL I +S ++S  S FS  TG R++D  R S  P+IVE L+C ++W+   P
Subjt:  KIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIAS-KSAFS--TGGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWINSDP

P03010 Putative AC9 transposase1.8e-4030.71Show/hide
Query:  HILNLIATDAFKEHNDCINRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIVCKSYVCLDVPTRWNSTYMMIEAIVKFEKAFDRLEDED----------ASYRH
        HILNL+A D        I +I+ +V  ++SSP ++ +  KC     +     +  DV TRWNSTY+M+   + ++ A  RL+  D            + +
Subjt:  HILNLIATDAFKEHNDCINRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIVCKSYVCLDVPTRWNSTYMMIEAIVKFEKAFDRLEDED----------ASYRH

Query:  DMSPNKEDWTNARM--------------LIWFLKVFYDVTLKISDSLYTTSNLVFHQITVVQNCIHLNAGSSNALLVEMANNIKEKFEKYWGNNEKNNLL
          S N+       M              L   LK F+D+T  +S + Y+T+NL +     +++ I         ++  MA  + EKFEKYW   + +N+ 
Subjt:  DMSPNKEDWTNARM--------------LIWFLKVFYDVTLKISDSLYTTSNLVFHQITVVQNCIHLNAGSSNALLVEMANNIKEKFEKYWGNNEKNNLL

Query:  LYVTIVLDPRKKLRFVSFCLKFFFGAEVAESMENVVEQCCRRLFHVYSITQSGSKQGCSSTSTTSTQIILGLDANIDFDSNENVGEDLVYDTIVEEFEDD
        L V   LDPR K   + F +K F G      +++ V +  R+L+  Y    S        T TT+         N   D      ED  +   + E +D 
Subjt:  LYVTIVLDPRKKLRFVSFCLKFFFGAEVAESMENVVEQCCRRLFHVYSITQSGSKQGCSSTSTTSTQIILGLDANIDFDSNENVGEDLVYDTIVEEFEDD

Query:  ATTPFEQ-GSSKIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIASKSAFSTGGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWI
            ++Q  S+++D Y+ E  ++  G FDIL WW+    ++ +L ++ RD+L I VST+AS+SAFS GGRVVD  R  L  +IVE LICT++W+
Subjt:  ATTPFEQ-GSSKIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIASKSAFSTGGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWI

P08770 Putative AC transposase9.7e-4732.97Show/hide
Query:  HILNLIATDAFKEHNDCINRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIVCKSYVCLDVPTRWNSTYMMIEAIVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWT
        HILNL+A D        I +I+ +V  ++SSP ++ +  KC     +     +  DV TRWNSTY+M+   + ++ A  RL+  D      + P  E+W 
Subjt:  HILNLIATDAFKEHNDCINRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIVCKSYVCLDVPTRWNSTYMMIEAIVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWT

Query:  NARMLIWFLKVFYDVTLKISDSLYTTSNLVFHQITVVQNCIHLNAGSSNALLVEMANNIKEKFEKYWGNNEKNNLLLYVTIVLDPRKKLRFVSFCLKFFF
         A  L   LK F+D+T  +S + Y+T+NL +     +++ I         ++  MA  + EKFEKYW   + +N+ L V   LDPR K   + F +K F 
Subjt:  NARMLIWFLKVFYDVTLKISDSLYTTSNLVFHQITVVQNCIHLNAGSSNALLVEMANNIKEKFEKYWGNNEKNNLLLYVTIVLDPRKKLRFVSFCLKFFF

Query:  GAEVAESMENVVEQCCRRLFHVYSITQSGSKQGCSSTSTTSTQIILGLDANIDFDSNENVGEDLVYDTIVEEFEDDATTPFEQ-GSSKIDIYLLEANVRT
        G      +++ V +  R+L+  Y    S        T TT+         N   D      ED  +   + E +D     ++Q  S+++D Y+ E  ++ 
Subjt:  GAEVAESMENVVEQCCRRLFHVYSITQSGSKQGCSSTSTTSTQIILGLDANIDFDSNENVGEDLVYDTIVEEFEDDATTPFEQ-GSSKIDIYLLEANVRT

Query:  EGDFDILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIASKSAFSTGGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWI
         G FDIL WW+    ++ +L ++ RD+L I VST+AS+SAFS GGRVVD  R  L  +IVE LICT++W+
Subjt:  EGDFDILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIASKSAFSTGGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWI

Q6AVI0 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 22.5e-4733.33Show/hide
Query:  MFVV--VPHILNLIATDAFKEHNDCINRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIVCKSYVCLDVPTRWNSTYMMIEAIVKFEKAFDRLEDEDASYRHDM
        +FVV    HILN +A D     +  I  IR  ++FI++SP+R  KF +     +I     +CLDV T+WN+TY+M+ A + +++AF  LE  D +Y    
Subjt:  MFVV--VPHILNLIATDAFKEHNDCINRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIVCKSYVCLDVPTRWNSTYMMIEAIVKFEKAFDRLEDEDASYRHDM

Query:  SPNKEDWTNARMLIWFLKVFYDVTLKISDSLYTTSNLVFHQITVVQNCIHLNAGSSNALLVEMANNIKEKFEKYWGNNEKNNLLLYVTIVLDPRKKLRFV
        +P+ EDW        +LK+ YD    I  +   TSNL FH+   +Q  +    G  + +   +A ++ E+F+KYW   +  NL+L + +V+DPR K++ V
Subjt:  SPNKEDWTNARMLIWFLKVFYDVTLKISDSLYTTSNLVFHQITVVQNCIHLNAGSSNALLVEMANNIKEKFEKYWGNNEKNNLLLYVTIVLDPRKKLRFV

Query:  SFCLKFFFGAEVAESMENVVEQCCRRLFHVY-----SITQSGSKQGCSSTSTTSTQIILGLDANIDFDSNENVGEDLV-YDTIVEEFEDDATTPFEQGSS
         F     +G E A+ ++ VV+     L+  Y      +T +  +QG  + +  S     G  A     +  + G+ LV +D  + E      T      S
Subjt:  SFCLKFFFGAEVAESMENVVEQCCRRLFHVY-----SITQSGSKQGCSSTSTTSTQIILGLDANIDFDSNENVGEDLV-YDTIVEEFEDDATTPFEQGSS

Query:  KIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIAS-KSAFS--TGGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWINSDP
        +++ YL E+      +FDIL WWK+N+ +F  L RM RDIL I +S ++S  S FS  TG R++D  R SL P+IVE L+C ++W+   P
Subjt:  KIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIAS-KSAFS--TGGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWINSDP

Q75HY5 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 34.2e-4230.39Show/hide
Query:  MFVV--VPHILNLIATDAFKEHNDCINRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIVCKSYVCLDVPTRWNSTYMMIEAIVKFEKAFDRLEDEDASYRHDM
        +FVV    HILN +A D     +  I  IR  ++FI++S     KF +     +I     +CLDV T+WN+TY+M+ A + +++ F  LE  D  Y    
Subjt:  MFVV--VPHILNLIATDAFKEHNDCINRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIVCKSYVCLDVPTRWNSTYMMIEAIVKFEKAFDRLEDEDASYRHDM

Query:  SPNKEDWTNARMLIWFLKVFYDVTLKISDSLYTTSNLVFHQITVVQNCIHLNAGSSNALLVEMANNIKEKFEKYWGNNEKNNLLLYVTIVLDPRKKLRFV
        +P+ EDW        +L + YD    I  +   TSN+ FH+   +Q+ +       + +    A  + E+F+KYW   +  NL+L + +V+DPR K++ V
Subjt:  SPNKEDWTNARMLIWFLKVFYDVTLKISDSLYTTSNLVFHQITVVQNCIHLNAGSSNALLVEMANNIKEKFEKYWGNNEKNNLLLYVTIVLDPRKKLRFV

Query:  SFCLKFFFGAEVAESMENVVEQCCRRLFHVYSITQSGSKQGCSSTSTTSTQIILGLDANIDFDSNENVGEDLVYDTIVEEFEDDATTPFEQGSSKIDIYL
         F        E A+ ++ VV+     L+  Y+ TQ  + +    T  ++       D  +DFD         +Y        + AT+  +   S+++ YL
Subjt:  SFCLKFFFGAEVAESMENVVEQCCRRLFHVYSITQSGSKQGCSSTSTTSTQIILGLDANIDFDSNENVGEDLVYDTIVEEFEDDATTPFEQGSSKIDIYL

Query:  LEANVRTEGDFDILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIASK----SAFSTGGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWINSDP
         EA +    DF+IL+WWK+N+ +F  L +M RD+L I +S ++S     SA +TG +++D  R SL P+ VE L C ++W+   P
Subjt:  LEANVRTEGDFDILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIASK----SAFSTGGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWINSDP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18560.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain5.1e-1122.8Show/hide
Query:  LDVPTRWNSTYMMIEAIVKFEKAFDRL--EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLI---WFLKVFYDVTLKISDSLYTTSNL-------VFHQITVVQNCIH
        +D  +RW+  Y M+  + K  K+ D +  ++EDA     M  + E   NA  ++     L  F+  T  +  +   T  L       +   IT  Q   H
Subjt:  LDVPTRWNSTYMMIEAIVKFEKAFDRL--EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLI---WFLKVFYDVTLKISDSLYTTSNL-------VFHQITVVQNCIH

Query:  LNAGSSNALLVEMANNIKEKFEKYWGNNEKNNLLLYVTIVLDPRKKLRFVSFCLKFFFGAEVAESMENVVEQCCRRLFHVYSITQSGSKQGCSSTSTTST
             +   L   A ++ +K   Y  N +  N+  Y+T +LDPR K  ++   +          ++E+ +++        YS +   S    S TS    
Subjt:  LNAGSSNALLVEMANNIKEKFEKYWGNNEKNNLLLYVTIVLDPRKKLRFVSFCLKFFFGAEVAESMENVVEQCCRRLFHVYSITQSGSKQGCSSTSTTST

Query:  QIILGLDANIDFDSNENVGEDLVYDTIVEEFEDDATTPFEQGSSKIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIASKSAFST
        Q +     NI F   E +       ++     D+ T            YL E+ V  +   D+L WWK+NS ++  L  M RD L +  ++ A +  F  
Subjt:  QIILGLDANIDFDSNENVGEDLVYDTIVEEFEDDATTPFEQGSSKIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIASKSAFST

Query:  GGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWINS
         G  +D  +  +     +++IC ++WI +
Subjt:  GGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWINS

AT3G42170.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain3.9e-3527.32Show/hide
Query:  IATDAFKEHNDCINRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIVCKSYVCLDVPTRWNSTYMMIEAIVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWTNARML
        +A D  ++  D I  IR  V+ +++S +   +F +  E  ++  +  + LD  T+WN+TYMM+ A  + ++ F  L+  D  Y+    P+ EDW +   L
Subjt:  IATDAFKEHNDCINRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIVCKSYVCLDVPTRWNSTYMMIEAIVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWTNARML

Query:  IWFLKVFYDVTLKISDSLYTTSNLVFHQITVVQNCIHLNAGSSNALLVEMANNIKEKFEKYWGNNEKNNLLLYVTIVLDPRKKLRFVSFCLKFFFGAEVA
          FLK  ++    +  +   ++   FH++   Q+ +       +  +  +A  ++EK +KYW      +L+L + +V+DPR K++ V F     FG +  
Subjt:  IWFLKVFYDVTLKISDSLYTTSNLVFHQITVVQNCIHLNAGSSNALLVEMANNIKEKFEKYWGNNEKNNLLLYVTIVLDPRKKLRFVSFCLKFFFGAEVA

Query:  ESMENVVEQCCRRLFHVYSITQSGSKQGCSSTSTTSTQIILGLDANIDFDS--NENVGEDLVYDTIVEEFEDDATTPFEQGSSKIDIYLLEANVRTEGDF
        ++++  V+     LF  Y      S Q  +S    +       D   DFD+   E  G++L                     S++D YL E  +    +F
Subjt:  ESMENVVEQCCRRLFHVYSITQSGSKQGCSSTSTTSTQIILGLDANIDFDS--NENVGEDLVYDTIVEEFEDDATTPFEQGSSKIDIYLLEANVRTEGDF

Query:  DILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIASKSAFSTGGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWI
        D+L WWK N  ++  L +M RDIL+I VS  A    F    R +D  + SL P+ VE LIC + W+
Subjt:  DILQWWKMNSDQFEVLGRMTRDILTISVSTIASKSAFSTGGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAATTTCTACATGTTCGTTGTTGTGCCCCATATATTGAATCTTATAGCAACTGATGCTTTTAAGGAACATAATGATTGTATTAATAGGATTCGATATGTTGTGCG
ATTTATAAGGTCTTCTCCTGCTCGTTTTTTGAAATTTAAAAAGTGCATTGAACTTGAAAAAATAGTTTGTAAGAGTTATGTGTGTCTTGATGTTCCCACAAGATGGAACT
CCACATATATGATGATTGAAGCTATCGTTAAGTTTGAAAAAGCTTTTGATAGATTAGAAGATGAAGATGCCTCTTATAGACATGATATGTCACCGAATAAGGAAGATTGG
ACAAATGCTAGGATGTTAATATGGTTTTTAAAAGTATTTTATGATGTGACATTGAAGATTTCAGACTCTTTGTATACTACTTCAAACTTGGTTTTCCATCAAATTACAGT
GGTTCAGAATTGTATACATTTGAATGCGGGTAGTTCAAATGCATTGTTAGTTGAAATGGCTAATAACATAAAGGAAAAATTTGAGAAATATTGGGGGAACAATGAAAAGA
ATAATTTGTTGTTGTATGTTACTATTGTGTTGGATCCTCGAAAGAAATTAAGATTTGTATCTTTTTGTTTGAAATTTTTTTTTGGTGCCGAGGTTGCTGAATCCATGGAA
AATGTAGTGGAACAATGTTGTAGACGTCTCTTTCATGTGTATAGTATTACTCAAAGTGGGAGTAAACAAGGATGTAGTAGTACTAGTACAACTAGTACACAAATTATTTT
AGGCTTGGATGCTAATATTGATTTTGATTCAAATGAAAATGTAGGTGAAGATCTTGTCTACGACACGATTGTTGAGGAATTTGAAGATGATGCTACTACACCTTTCGAAC
AGGGGTCTTCGAAGATTGATATCTATTTGTTGGAAGCTAATGTTAGGACCGAAGGTGATTTTGACATACTACAGTGGTGGAAGATGAACAGTGATCAATTTGAGGTTCTT
GGTCGTATGACTAGAGATATTTTGACTATTTCAGTTTCTACTATAGCGTCTAAGTCAGCTTTTAGTACTGGAGGGCGTGTTGTTGACTCATCACGCTGCTCATTGGCTCC
TAAAATAGTTGAGACTCTCATATGTACTCAAAATTGGATAAATTCTGATCCAATAGATCTTCAAATTCAGCATGAATTGGAAGAAGCTTCAAAATTTGAAGAAGGTATTA
TTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGAATTTCTACATGTTCGTTGTTGTGCCCCATATATTGAATCTTATAGCAACTGATGCTTTTAAGGAACATAATGATTGTATTAATAGGATTCGATATGTTGTGCG
ATTTATAAGGTCTTCTCCTGCTCGTTTTTTGAAATTTAAAAAGTGCATTGAACTTGAAAAAATAGTTTGTAAGAGTTATGTGTGTCTTGATGTTCCCACAAGATGGAACT
CCACATATATGATGATTGAAGCTATCGTTAAGTTTGAAAAAGCTTTTGATAGATTAGAAGATGAAGATGCCTCTTATAGACATGATATGTCACCGAATAAGGAAGATTGG
ACAAATGCTAGGATGTTAATATGGTTTTTAAAAGTATTTTATGATGTGACATTGAAGATTTCAGACTCTTTGTATACTACTTCAAACTTGGTTTTCCATCAAATTACAGT
GGTTCAGAATTGTATACATTTGAATGCGGGTAGTTCAAATGCATTGTTAGTTGAAATGGCTAATAACATAAAGGAAAAATTTGAGAAATATTGGGGGAACAATGAAAAGA
ATAATTTGTTGTTGTATGTTACTATTGTGTTGGATCCTCGAAAGAAATTAAGATTTGTATCTTTTTGTTTGAAATTTTTTTTTGGTGCCGAGGTTGCTGAATCCATGGAA
AATGTAGTGGAACAATGTTGTAGACGTCTCTTTCATGTGTATAGTATTACTCAAAGTGGGAGTAAACAAGGATGTAGTAGTACTAGTACAACTAGTACACAAATTATTTT
AGGCTTGGATGCTAATATTGATTTTGATTCAAATGAAAATGTAGGTGAAGATCTTGTCTACGACACGATTGTTGAGGAATTTGAAGATGATGCTACTACACCTTTCGAAC
AGGGGTCTTCGAAGATTGATATCTATTTGTTGGAAGCTAATGTTAGGACCGAAGGTGATTTTGACATACTACAGTGGTGGAAGATGAACAGTGATCAATTTGAGGTTCTT
GGTCGTATGACTAGAGATATTTTGACTATTTCAGTTTCTACTATAGCGTCTAAGTCAGCTTTTAGTACTGGAGGGCGTGTTGTTGACTCATCACGCTGCTCATTGGCTCC
TAAAATAGTTGAGACTCTCATATGTACTCAAAATTGGATAAATTCTGATCCAATAGATCTTCAAATTCAGCATGAATTGGAAGAAGCTTCAAAATTTGAAGAAGGTATTA
TTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MENFYMFVVVPHILNLIATDAFKEHNDCINRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIVCKSYVCLDVPTRWNSTYMMIEAIVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDW
TNARMLIWFLKVFYDVTLKISDSLYTTSNLVFHQITVVQNCIHLNAGSSNALLVEMANNIKEKFEKYWGNNEKNNLLLYVTIVLDPRKKLRFVSFCLKFFFGAEVAESME
NVVEQCCRRLFHVYSITQSGSKQGCSSTSTTSTQIILGLDANIDFDSNENVGEDLVYDTIVEEFEDDATTPFEQGSSKIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDQFEVL
GRMTRDILTISVSTIASKSAFSTGGRVVDSSRCSLAPKIVETLICTQNWINSDPIDLQIQHELEEASKFEEGII