; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc08g0230331 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc08g0230331
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionZinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Genome locationCMiso1.1chr08:25872774..25873671
RNA-Seq ExpressionCmc08g0230331
SyntenyCmc08g0230331
Gene Ontology termsGO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0009791 - post-embryonic development (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0004177 - aminopeptidase activity (molecular function)
GO:0008237 - metallopeptidase activity (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008906 - HAT, C-terminal dimerisation domain
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058067.1 putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]6.3e-9496.22Show/hide
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KAA0064124.1 putative aspartyl aminopeptidase [Cucumis melo var. makuwa]3.0e-9696.3Show/hide
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TYK16245.1 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X3 [Cucumis melo var. makuwa]5.0e-9194.02Show/hide
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TYK20956.1 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X3 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-9092.93Show/hide
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XP_016899473.1 PREDICTED: zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X2 [Cucumis melo]2.4e-8588.48Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4DU44 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X21.2e-8588.48Show/hide
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A0A5A7UTL3 Putative transposase3.0e-9496.22Show/hide
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A0A5A7VA60 Putative aspartyl aminopeptidase1.5e-9696.3Show/hide
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A0A5D3CXP7 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X32.4e-9194.02Show/hide
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A0A5D3DBL3 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X35.4e-9192.93Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B9FJG3 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 12.1e-1544.68Show/hide
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P03010 Putative AC9 transposase6.0e-1542.35Show/hide
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P08770 Putative AC transposase6.0e-1542.35Show/hide
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Q6AVI0 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 21.9e-1646.81Show/hide
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Q75HY5 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 33.2e-1643.62Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18560.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain1.1e-0830.23Show/hide
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AT3G42170.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain1.4e-1438.3Show/hide
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        +T   + K+E+ +YLDE  +  +  +  D+L WWK N  ++  +S++ARDI SIP+S    +  F    R +D +++SL P+T EALICA+ W+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAATGTCAAAAGAAAAATATTCACAAACACAATCATGTATACCTATCGAAGGATTTGGCTTTCAAAGTCAAAGTGAAATACCTTCTATCTCATCTAGTGGATTTTA
TAAGGCACGTGCTACTGTTCATGATAGATTTAAACAAAGTAACAAAACATGTCTAGATGATGCTAAAACAGAGGTGACTCGTTATCTGGATGAGGCTCGTATAGATTGTA
TGGGCGATGAATATTTAGATTTGCTAACTTGGTGGAAGGTGAATTCCTCTCGATTTAAGATCATTAGCCAAGTAGCTAGGGACATCCACAGTATTCCTATATCAACTGTG
CCTTCTGAGTCCGCCTTTAGCACTGGAGGACGGGTGTTAGATTCTTTTCGAAGTTCTTTAACTCCTCAAACTGCAGAGGCACTCATTTGTGCTCAGAATTGGATTCAGTT
TAAACCTTTGGATGACATGACTGAAGAAATTGACGGGGCTAAAGAAATTGATGAAGAATTCATAAACATAGGAAAGGAGATGGAAGCTGCATTTGAGAATTTGAATAATG
ACTCTATGAGTCTTGAAGCTCAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTCGATTGTGTGATGATTATTATATGAGAATGTCAAAAGAAAAATATTCACAAACACAATCATGTATACCTATCGAAGGATTTGGCTTTCAAAGTCAAAGTGAAATACCT
TCTATCTCATCTAGTGGATTTTATAAGGCACGTGCTACTGTTCATGATAGATTTAAACAAAGTAACAAAACATGTCTAGATGATGCTAAAACAGAGGTGACTCGTTATCT
GGATGAGGCTCGTATAGATTGTATGGGCGATGAATATTTAGATTTGCTAACTTGGTGGAAGGTGAATTCCTCTCGATTTAAGATCATTAGCCAAGTAGCTAGGGACATCC
ACAGTATTCCTATATCAACTGTGCCTTCTGAGTCCGCCTTTAGCACTGGAGGACGGGTGTTAGATTCTTTTCGAAGTTCTTTAACTCCTCAAACTGCAGAGGCACTCATT
TGTGCTCAGAATTGGATTCAGTTTAAACCTTTGGATGACATGACTGAAGAAATTGACGGGGCTAAAGAAATTGATGAAGAATTCATAAACATAGGAAAGGAGATGGAAGC
TGCATTTGAGAATTTGAATAATGACTCTATGAGTCTTGAAGCTCAGTGATGGAAGCACTTTGGGTTATACGAACAAGGTGGTCTCGTGAAGATGTTCATTAATTCATACC
TTCACAATTGTAAACTCTGTTCATTTTAAGATAATAGTTGGATCTTTGTGATTGATTCTAATGTTGCAGGATTATTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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