; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc08g0230681 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc08g0230681
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionKH domain-containing protein
Genome locationCMiso1.1chr08:26388651..26394802
RNA-Seq ExpressionCmc08g0230681
SyntenyCmc08g0230681
Gene Ontology termsGO:0048024 - regulation of mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0016740 - transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004087 - K Homology domain
IPR004088 - K Homology domain, type 1
IPR032377 - STAR protein, homodimerisation region
IPR036612 - K Homology domain, type 1 superfamily
IPR045071 - KH domain-containing BBP-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK06218.1 KH domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]5.5e-155100Show/hide
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XP_008463293.1 PREDICTED: KH domain-containing protein At2g38610 [Cucumis melo]1.3e-156100Show/hide
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XP_011653733.1 KH domain-containing protein At2g38610 isoform X1 [Cucumis sativus]7.2e-15599.29Show/hide
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XP_038882688.1 KH domain-containing protein At2g38610 isoform X2 [Benincasa hispida]2.1e-15498.93Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXW7 KH domain-containing protein1.4e-15699.64Show/hide
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A0A1S3CIV3 KH domain-containing protein At2g386106.3e-157100Show/hide
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A0A5D3C4T5 KH domain-containing protein2.7e-155100Show/hide
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A0A6J1EEN1 KH domain-containing protein At3g08620-like isoform X21.5e-15397.51Show/hide
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A0A6J1HRK9 KH domain-containing protein At3g08620-like isoform X25.5e-15397.15Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0WLR1 KH domain-containing protein At4g264804.8e-7755.56Show/hide
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Q75GR5 KH domain-containing protein SPIN13.7e-11472.7Show/hide
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        MSG+YS  FSPAR  SP IR+ P DVDSQYL+ELLAEHQK GPFMQVLPIC +LL+QEI+RVS ++ N GF D DR R RSPSPM+S N  SN S  G S
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         WNGL QERL    G +MDWQ AP SPSS  VK+ILRL++PVD+YPNFNFVGR+LGPRGNSLKRVE +TGCRV+IRGKGSIKDP KE+KLRG+PGYEHL+
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        +PLHILIEA+ PA+++D RLR AQE+IEELLKPVDES D+ KRQQLRELAMLNS+ RE+SP P GSVSPF++ GMKRAKTG+
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Q8GYR4 KH domain-containing protein At3g086207.8e-12880.21Show/hide
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        MSG+Y+  NFSP+R ASP IRT + DVDSQY+S+LLAEHQK GPFMQVLPIC RLLNQEI R++GMM NQGF D DRLRHRSPSPMAS NLMSNVS  GL
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         GWNGLP ER+    GM M+WQ APASPSS  VKRILRL++PVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRVYIRGKGSIKDP+KEEKL+G+PGYEHL
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        NE LHILIEADLP ++VDI+LRQAQEIIEEL+KPVDES DYIKRQQLRELA+LNS+ RE SPGP GSVSPFNS+ MKR KTGR
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Q9FKT4 KH domain-containing protein At5g561403.1e-7655.24Show/hide
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        YS++ S  P+   SP+    +R+   V     +YLSELLAE  K  PF+ VLP   RLLNQEILRV+ ++ N        L H  PSP+AS  +  N + 
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          ++GW +  P ER +  +PG   +W ++P S S L  KR +R++IPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KEE +RG+P
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Q9ZVI3 KH domain-containing protein At2g386103.2e-12983.92Show/hide
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        MSG+Y  S+ FSPAR ASP IR+TP++D SQYL+ELLAEHQK  PFMQVLPIC RLLNQE+ RVSGMMSNQGF D DRLRHRSPSPMASSNLMSNVS+TG
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        L GWNGL QERLS  PGMTMDWQ AP SPSS TVKRILRLEIPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRV+IRGKGSIKDP+KE+KLRGRPGYEH
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Query:  LNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG
        LNE LHILIEADLPA++V+IRLRQAQEIIEELLKPVDES D+IKRQQLRELA+LNS + REESPGP  GGSVSPFNSSG KR KTG
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G38610.1 RNA-binding KH domain-containing protein2.2e-13083.92Show/hide
Query:  MSGMY--STNFSPARTASPHIRTTPDVD-SQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTG
        MSG+Y  S+ FSPAR ASP IR+TP++D SQYL+ELLAEHQK  PFMQVLPIC RLLNQE+ RVSGMMSNQGF D DRLRHRSPSPMASSNLMSNVS+TG
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Query:  LSGWNGLPQERLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEH
        L GWNGL QERLS  PGMTMDWQ AP SPSS TVKRILRLEIPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRV+IRGKGSIKDP+KE+KLRGRPGYEH
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Query:  LNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG
        LNE LHILIEADLPA++V+IRLRQAQEIIEELLKPVDES D+IKRQQLRELA+LNS + REESPGP  GGSVSPFNSSG KR KTG
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AT2G38610.2 RNA-binding KH domain-containing protein2.2e-13083.92Show/hide
Query:  MSGMY--STNFSPARTASPHIRTTPDVD-SQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTG
        MSG+Y  S+ FSPAR ASP IR+TP++D SQYL+ELLAEHQK  PFMQVLPIC RLLNQE+ RVSGMMSNQGF D DRLRHRSPSPMASSNLMSNVS+TG
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Query:  LSGWNGLPQERLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEH
        L GWNGL QERLS  PGMTMDWQ AP SPSS TVKRILRLEIPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRV+IRGKGSIKDP+KE+KLRGRPGYEH
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Query:  LNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG
        LNE LHILIEADLPA++V+IRLRQAQEIIEELLKPVDES D+IKRQQLRELA+LNS + REESPGP  GGSVSPFNSSG KR KTG
Subjt:  LNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG

AT3G08620.1 RNA-binding KH domain-containing protein5.5e-12980.21Show/hide
Query:  MSGMYS-TNFSPARTASPHIRT-TPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTGL
        MSG+Y+  NFSP+R ASP IRT + DVDSQY+S+LLAEHQK GPFMQVLPIC RLLNQEI R++GMM NQGF D DRLRHRSPSPMAS NLMSNVS  GL
Subjt:  MSGMYS-TNFSPARTASPHIRT-TPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTGL

Query:  SGWNGLPQERLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHL
         GWNGLP ER+    GM M+WQ APASPSS  VKRILRL++PVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRVYIRGKGSIKDP+KEEKL+G+PGYEHL
Subjt:  SGWNGLPQERLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHL

Query:  NEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        NE LHILIEADLP ++VDI+LRQAQEIIEEL+KPVDES DYIKRQQLRELA+LNS+ RE SPGP GSVSPFNS+ MKR KTGR
Subjt:  NEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

AT4G26480.1 RNA-binding KH domain-containing protein3.4e-7855.56Show/hide
Query:  SGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTGLSGW
        S   S NFS    + P      +   +YLSELLAE  K  PF+ VLP   RL+NQEILRV+ ++ N     L + R   PSP+AS  +  N S   ++GW
Subjt:  SGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTGLSGW

Query:  -NGLPQERLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLNE
         +  P ER S +     +W ++P S S L VKR +R++IPVD YPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KE+ +RG+PGYEHLNE
Subjt:  -NGLPQERLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLNE

Query:  PLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT
        PLHIL+EA+LP  +VD RL QA+EI+++LL PV+E+HD+ K+QQLRELA+LN S REE     GS+SP+NS GMKRAKT
Subjt:  PLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT

AT5G56140.1 RNA-binding KH domain-containing protein2.2e-7755.24Show/hide
Query:  YSTNFS--PARTASPH----IRTTPDV---DSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSS
        YS++ S  P+   SP+    +R+   V     +YLSELLAE  K  PF+ VLP   RLLNQEILRV+ ++ N        L H  PSP+AS  +  N + 
Subjt:  YSTNFS--PARTASPH----IRTTPDV---DSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSS

Query:  TGLSGW-NGLPQER-LSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRP
          ++GW +  P ER +  +PG   +W ++P S S L  KR +R++IPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KEE +RG+P
Subjt:  TGLSGW-NGLPQER-LSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRP

Query:  GYEHLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT
        GYEHLNEPLHIL+EA+LP  +VD RL QA+EI+++LL P++E+HD  K+QQLRELA+LN + REE     GSVSP+NS GMKRAKT
Subjt:  GYEHLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCGGTATGTACAGTACCAACTTCTCCCCTGCAAGAACTGCTTCTCCTCACATCAGAACTACTCCCGATGTCGACAGTCAGTACTTGTCGGAGCTACTAGCGGAGCA
TCAGAAGTTCGGCCCCTTCATGCAAGTTCTTCCGATCTGCGGCCGACTTTTGAATCAAGAAATATTGCGGGTTTCTGGAATGATGTCCAACCAGGGTTTCTGCGACCTTG
ATAGGCTTCGGCATAGGAGCCCTAGTCCAATGGCTTCTTCAAACCTTATGTCTAATGTTAGTAGTACAGGTTTGAGTGGCTGGAATGGTCTTCCTCAGGAGAGATTAAGT
AGAGCACCTGGGATGACAATGGACTGGCAAAGCGCACCTGCAAGTCCTAGTTCACTCACCGTAAAGAGGATTCTACGTTTGGAAATACCCGTTGATACTTATCCCAATTT
CAATTTTGTAGGGCGGCTTTTGGGACCTCGTGGAAATTCCTTGAAACGAGTGGAAGTTACTACAGGTTGTCGTGTATACATTCGAGGGAAAGGGTCAATAAAGGATCCAG
ACAAGGAAGAAAAATTACGGGGACGACCTGGCTATGAGCACTTGAATGAACCGCTGCACATCTTGATTGAGGCAGATTTGCCAGCCAATGTTGTTGATATACGGCTCAGA
CAGGCACAAGAAATTATAGAAGAACTGCTCAAACCTGTGGATGAGAGTCATGATTACATTAAAAGGCAGCAGTTACGTGAACTCGCAATGCTAAATTCAAGTTTCAGAGA
AGAGAGTCCAGGACCTGGTGGCAGCGTCTCTCCTTTCAACTCAAGTGGTATGAAACGTGCCAAAACAGGTCGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAAAAAGAAATAAAATAAAAAAAGAAACTAAAAAGAAAAGAAAACGACGACCATTTACAATCATATATTTTCCTCAATTCAGTTTCCACCCTTTTACTCCTTAGCTCCG
CCTCCGCCTCCCTCGTCGGAGTTGTCCTTATCCACCATCTTCTCCGGCGACATCCTCGCCTTTATCTCCAAAACCCCACTCCAACTTTCCAATCCCCCAATTCTCGGAAC
ATCCATTTCAGCTCATAGTTCAATAGCTTACAGCTATGTCCGGTATGTACAGTACCAACTTCTCCCCTGCAAGAACTGCTTCTCCTCACATCAGAACTACTCCCGATGTC
GACAGTCAGTACTTGTCGGAGCTACTAGCGGAGCATCAGAAGTTCGGCCCCTTCATGCAAGTTCTTCCGATCTGCGGCCGACTTTTGAATCAAGAAATATTGCGGGTTTC
TGGAATGATGTCCAACCAGGGTTTCTGCGACCTTGATAGGCTTCGGCATAGGAGCCCTAGTCCAATGGCTTCTTCAAACCTTATGTCTAATGTTAGTAGTACAGGTTTGA
GTGGCTGGAATGGTCTTCCTCAGGAGAGATTAAGTAGAGCACCTGGGATGACAATGGACTGGCAAAGCGCACCTGCAAGTCCTAGTTCACTCACCGTAAAGAGGATTCTA
CGTTTGGAAATACCCGTTGATACTTATCCCAATTTCAATTTTGTAGGGCGGCTTTTGGGACCTCGTGGAAATTCCTTGAAACGAGTGGAAGTTACTACAGGTTGTCGTGT
ATACATTCGAGGGAAAGGGTCAATAAAGGATCCAGACAAGGAAGAAAAATTACGGGGACGACCTGGCTATGAGCACTTGAATGAACCGCTGCACATCTTGATTGAGGCAG
ATTTGCCAGCCAATGTTGTTGATATACGGCTCAGACAGGCACAAGAAATTATAGAAGAACTGCTCAAACCTGTGGATGAGAGTCATGATTACATTAAAAGGCAGCAGTTA
CGTGAACTCGCAATGCTAAATTCAAGTTTCAGAGAAGAGAGTCCAGGACCTGGTGGCAGCGTCTCTCCTTTCAACTCAAGTGGTATGAAACGTGCCAAAACAGGTCGGTA
GGTGCTCAATATCATTCCGTACCATAAACAATTTCTACCCCAGTCCAAATTTCGGTCACTTATATACTGTGAAGTGAATCATGACCGACCGTGTGACATAGCTACGAGAA
AGGGGAGGCTAACTTCAGTTCCTGGCGAGCCTTCTGTTGGCTTTTTTCTTTGTGTTCCCTTTAATATTCTTGACAGATAGACTGGAAAAAAGTTGAAAAAAAGAAAAAAA
GAAAAAAAAAACAGGGGGTGAAAAGGAAAAAAAATTGTTAGTAATAGTAGGGATGGTTTTTCATGTTGGGTGTAGGTTTGAATAGGTCAGTTTTTCCAACAAAGTTAATA
TATTCATTGGATTTATTCTTGTGTTAGTGACTGCCGAGGAGTGTGTAGTTTTATTGCATTATTGATGCAAAAACCTTAGGAAGTGATGATGATGTAATACTATTTGATAT
TTGTTAGGTGTTGTATGCAATGTCAATGTCAATTATATTTTTGGACTGATATATGAAAGAACAATGCAAAAACTCATACAAAAGTGTTTGCTCAGTTTGTGTTTGCTTTT
CAAGTTTCAGAATATGATTCTCCTTTCTGTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTGLSGWNGLPQERLS
RAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLNEPLHILIEADLPANVVDIRLR
QAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR