; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc09g0240161 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc09g0240161
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptionmini zinc finger protein 2
Genome locationCMiso1.1chr09:2246325..2247075
RNA-Seq ExpressionCmc09g0240161
SyntenyCmc09g0240161
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022134197.1 mini zinc finger protein 2-like [Momordica charantia]6.2e-4291.67Show/hide
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XP_022939280.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita moschata]3.7e-4291.67Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]5.1e-4492.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVJ7 Transcription factor7.2e-4496.74Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 21.4e-4798.96Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 21.4e-4798.96Show/hide
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A0A6J1BYZ4 mini zinc finger protein 2-like3.0e-4291.67Show/hide
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A0A6J1FM92 mini zinc finger protein 2-like1.8e-4291.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 18.8e-2370Show/hide
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 31.0e-2360.64Show/hide
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        M+KRQVV+++ +     T +SS    +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGC+EFMASG +     LTCAACGCHRNFHRR+V TEVVC+ S   +N
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Q2RB28 Mini zinc finger protein 18.8e-2370Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 11.2e-2456.7Show/hide
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        M+KRQ+V+++    S          + +SS  + +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGC+EFMA+G EGT   L CAACGCHRNFHR++V TEVVC+ S
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 23.1e-3677.78Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18835.1 mini zinc finger7.4e-2560.64Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 18.7e-2656.7Show/hide
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AT2G18350.1 homeobox protein 244.3e-1767.31Show/hide
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        RY ECQKNHAA  GG+ VDGC EFM+SG+EGT   L CAAC CHR+FHR+++
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AT3G28917.1 mini zinc finger 22.2e-3777.78Show/hide
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AT4G24660.1 homeobox protein 222.5e-1767.31Show/hide
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        +RY EC KNHA  +GG+AVDGC EFM SG++GT   L CAACGCHRNFHR++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAAGAACCCTCAAGGGACACTGTGGCTTCTTCTTTCACAGTTAGAAGTGTAAGATATGGGGAGTGTCAAAAGAACCA
CGCTGCCGGGGTCGGAGGGTATGCCGTTGATGGGTGTAAAGAATTCATGGCAAGTGGTGACGAAGGGACGACTGCTGGACTGACTTGCGCCGCTTGCGGTTGCCATCGGA
ATTTTCATAGAAGGCAAGTTGGAACTGAGGTAGTGTGTGATTGCTCTTCATCACCCTCAAATGGAACTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGGGTTAGGGTTTCAGCCAAGAACCCCATTTCAATTTGTAAAATCTCTCCCTAACTCCTACATTAAATTTATTATTCCATTACCAAAACTTGAAGATTTTTTTTTTCTT
CTTTTTTGTAGAACAAGACCTAGCTAATTACCCTAAAAAGGATCTTTTGTTACAATTTTTTTTCTTTGGTTCAAATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAA
GAACCCTCAAGGGACACTGTGGCTTCTTCTTTCACAGTTAGAAGTGTAAGATATGGGGAGTGTCAAAAGAACCACGCTGCCGGGGTCGGAGGGTATGCCGTTGATGGGTG
TAAAGAATTCATGGCAAGTGGTGACGAAGGGACGACTGCTGGACTGACTTGCGCCGCTTGCGGTTGCCATCGGAATTTTCATAGAAGGCAAGTTGGAACTGAGGTAGTGT
GTGATTGCTCTTCATCACCCTCAAATGGAACTTAATTAAAAGACTATACATATAATAATACTATAACTTCAGTGTGTATGGGGTGAGGATTTTTTTTCTTTTTCTTTTTC
GGGGTGCTGAATAAACAAAATTTCTCAACATGGGATTGAGAGTTGAGAGTTGAGATTCAGCTCTGTTGTTCTGTTGCTTGAATTATTATTATTATTTAAAAAAAAATTCT
TGTGTTGGATTGGAATCAACTTGACTTCAACTAAGAAATATGTGCTTTGTGTAATTTTGAATTTTTTTCCCTTTAATTTCAGGTTCATTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRKRQVVLRRSEEPSRDTVASSFTVRSVRYGECQKNHAAGVGGYAVDGCKEFMASGDEGTTAGLTCAACGCHRNFHRRQVGTEVVCDCSSSPSNGT