; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc09g0241201 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc09g0241201
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionCASP-like protein
Genome locationCMiso1.1chr09:3239877..3241921
RNA-Seq ExpressionCmc09g0241201
SyntenyCmc09g0241201
Gene Ontology termsGO:0018343 - protein farnesylation (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0005965 - protein farnesyltransferase complex (cellular component)
GO:0004660 - protein farnesyltransferase activity (molecular function)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006702 - Casparian strip membrane protein domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142358.1 CASP-like protein 4A3 [Cucumis sativus]3.0e-2386.11Show/hide
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XP_008458753.1 PREDICTED: CASP-like protein 4A1 [Cucumis melo]1.6e-2490.28Show/hide
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XP_022938613.1 CASP-like protein 4A1 [Cucurbita moschata]2.8e-2180.56Show/hide
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XP_023550770.1 CASP-like protein 4A1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-2180.56Show/hide
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XP_038890250.1 CASP-like protein 4A1 [Benincasa hispida]5.1e-2386.11Show/hide
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A0A0A0KS01 CASP-like protein1.4e-2386.11Show/hide
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A0A1S3C844 CASP-like protein7.6e-2590.28Show/hide
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A0A5A7T7H8 CASP-like protein7.6e-2590.28Show/hide
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A0A6J1FJD7 CASP-like protein1.3e-2180.56Show/hide
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A0A6J1JTE4 CASP-like protein1.8e-2180.56Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
D7LIR2 CASP-like protein 4A32.2e-1356.9Show/hide
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D7MMW4 CASP-like protein 4A22.6e-1458.46Show/hide
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Q501G6 CASP-like protein 4A22.6e-1458.46Show/hide
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Q84WP5 CASP-like protein 4A31.2e-1460.34Show/hide
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Q9FNE8 CASP-like protein 4A12.4e-1560.87Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36330.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)8.3e-1660.34Show/hide
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AT2G38480.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)1.1e-0444.07Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGGAAGGGACAAGTTTCCTGACATGGCTACCGGGTCGTTGGCATTGTCCATTGTTGCATTTGTTGCTTTTGCCTTGAGTTGTATAATCTCTGGTTATACCCTATGTAAAT
CTGCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GATTATGATAGCTTATAGGACCCACTGAAGATAGAAAAGTTATGCATAATTCCCAATAGTCATTAGATAGATGGTTCTCTTTCTGTATTCCTTTACTGAAAATTTTTCCA
TTCATCATGACGCTTTTTCTTACCTTTTTCATACCGAAGAAATCTATAATAGCATATCTTCTTCTATCAGCTTCGTCTTCGGCTGCCACCCGAATCGATGATTGGCAATC
CAATTGGGGAAGGGACAAGTTTCCTGACATGGCTACCGGGTCGTTGGCATTGTCCATTGTTGCATTTGTTGCTTTTGCCTTGAGTTGTATAATCTCTGGTTATACCCTAT
GTAAATCTGCTTAGGTAACCTTTGCTGGACTTGCTTGTTGGCGAACTTGATTCAATGATGATGATAGCAACAAACAAACACAATGGTGATGAGGATATGCAAGAAGATTT
GTTTCAACATTGTGCTGTGAATTAGGCATGCTTTCACTTGGAAAATATATTTGGGAGTTTACTTAATTCTTTGTAAATAGGATGAAGAACACTTGTTGTGCACTTTACAT
GCACTTTGAATCATTACAAGTTGAAGGGAAAGAGTGAATAGGGAAAAGTTAGAGGAAGTTATTCAATGTTTTTATAAATTGCTAAAATGGGAGAAAACCATGACTCAATT
ACATGATAAAACAATAGTATCTAAGTCAAGGTAAAGTTAATAAGAGGGATGTTTTTGGTTGACGATCCAATAAGTTTAAGATTCATCGAGTTTAGAATTCTATTATCCAA
AGAATGTACATTGTGAAAACTACAATTTTACCATTTTACTGTGTATAGATTTTGAATTTTAACTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTLFLTFFIPKKSIIAYLLLSASSSAATRIDDWQSNWGRDKFPDMATGSLALSIVAFVAFALSCIISGYTLCKSA