CuGenDBv2

Gene ID	Cmc09g0241841
Organism	Cucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Description	30S ribosomal protein S11, chloroplastic
Genome location	CMiso1.1chr09:4052816..4053085
RNA-Seq Expression	Cmc09g0241841
Synteny	Cmc09g0241841
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0005840 - ribosome (cellular component) GO:0009507 - chloroplast (cellular component) GO:1990904 - ribonucleoprotein complex (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR001971 - Ribosomal protein S11 IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily

Homology

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GenBank top hits

e value

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QWK46945.1 ribosomal protein S11 [Ampelocera longissima]

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YP_009346516.1 ribosomal protein S11 [Cucumis x hytivus]

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YP_009445690.1 ribosomal protein S11 [Dasiphora fruticosa]

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YP_009770951.1 ribosomal protein S11 [Mezoneuron cucullatum]

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YP_009772119.1 ribosomal protein S11 [Chamaecrista mimosoides]

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TrEMBL top hits

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A0A1B2CY75 Ribosomal protein S11

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A0A1V0IRA5 Ribosomal protein S11

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A0A1V0J3V7 Ribosomal protein S11

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A0A1V0J7S6 Ribosomal protein S11

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A0A6H0EMK4 Ribosomal protein S11

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SwissProt top hits

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A0ZZ68 30S ribosomal protein S11, chloroplastic

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Q09WY4 30S ribosomal protein S11, chloroplastic

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Q0G9I6 30S ribosomal protein S11, chloroplastic

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Q2L937 30S ribosomal protein S11, chloroplastic

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Q4VZK2 30S ribosomal protein S11, chloroplastic

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Arabidopsis top hits

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ATCG00750.1 ribosomal protein S11

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Sequences

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CDS sequence

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AGTTGATCAAAGGATGCAACGAGCTGAAGTTATGATAAAGGGCCTCGGTCTCGGAAGAGATGCAACATTAAGAGCTATTTGGACGAGCGGTATACTATTCAGTTTCATAC
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mRNA sequence

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Protein sequence

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MGQSISWSSAGTCGFKGTRRGTPFAAQTATGNAIQVVVDQRMQRAEVMIKGLGLGRDATLRAIWTSGILFSFIRDVTLMPHNGCSPLKK

Cmc09g0241841 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome