| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0035365.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.5e-113 | 79.34 | Show/hide |
Query: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF--FLD-------------------------HVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRI
MSFGLTNAP VFM+LMN+VF FLD HVVSK GV VDPAKIEA+TSWPRPSTVSEVRSF+GLAGYY RF+E+FSRI
Subjt: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF--FLD-------------------------HVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRI
Query: ATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWR
ATP TQLTRKGAPFVWSKAC+DSFQNLKQKLVTA +L +PD SGSFVIYSDASKKGL VLMQQGKVVTYASRQLKSHE+NY THDLELA VVF LKIWR
Subjt: ATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWR
Query: HYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
HYLYGEKIQIF HKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP KAN+V DALSRKVSHSAALIT+
Subjt: HYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
|
|
| KAA0036553.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.2e-112 | 76.9 | Show/hide |
Query: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------------------------------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFM
MSFGLTNAP VFM+LMN+VF FL HVVSK GV VDPAKIEA+T W RPSTVSE RSFLGLAGYY RF+
Subjt: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------------------------------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFM
Query: EDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVF
E+FS IATP TQLTRKGAPFVWSKAC+DSFQNLKQKLVTA +LT+PD SGSFVIYSDASKKGL VLMQQGKVV YASRQLKSHE+NY THDLELAAVVF
Subjt: EDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVF
Query: VLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
LKIWRHYLYGEKIQIF DHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP KAN+V DALSRKVSHSAALIT+
Subjt: VLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
|
|
| KAA0051368.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.6e-113 | 77.62 | Show/hide |
Query: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------------------------------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFM
MSFGLTNAP VFM+LMN+VF FL HVVSK GV VDPAKIEA+T W RPSTVSEVRSFLGLAGYY RF+
Subjt: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------------------------------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFM
Query: EDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVF
E+FSRIATP TQLTRKGAPFVWSKAC+DSFQNLKQKLVTA +LT+PD SGSFVIYSDASKKGL VLMQQGKVV YASRQLKSHE+NY THDLELAAVVF
Subjt: EDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVF
Query: VLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
LKIWRHYLYGEKIQIF DHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP KAN+V DALSRKVSHSAALIT+
Subjt: VLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
|
|
| KAA0067180.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.8e-114 | 84.19 | Show/hide |
Query: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSK
MSFGLTNAP VFM+LMN+VF FL HVVSK GV VD AKIEA+TSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYY RF+E+FSRIATP TQLTRKGAPFVWSK
Subjt: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSK
Query: ACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLK
AC+DSFQNLKQKLVTA +PD SGSFVIYSDASKKGL VLMQQGKVV YASRQLKSHE+NY THDLELAAVVF LK WRHYLYGEKIQIF DHKSLK
Subjt: ACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLK
Query: YFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
YFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP KAN+V DALSRKVSHSAALIT+
Subjt: YFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
|
|
| TYK26028.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.8e-115 | 84.58 | Show/hide |
Query: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSK
MSFGLTNAP VFM+LMN+VF FL HVVSK GV VD AKIEA+TSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYY RF+E+FSRIATP TQLTRKGAPFVWSK
Subjt: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSK
Query: ACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLK
AC+DSFQNLKQKLVTA +PD SGSFVIYSDASKKGL VLMQQGKVV YASRQLKSHE+NYLTHDLELAAVVF LK WRHYLYGEKIQIF DHKSLK
Subjt: ACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLK
Query: YFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
YFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP KAN+V DALSRKVSHSAALIT+
Subjt: YFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7T0Y9 Reverse transcriptase | 1.1e-112 | 76.9 | Show/hide |
Query: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------------------------------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFM
MSFGLTNAP VFM+LMN+VF FL HVVSK GV VDPAKIEA+T W RPSTVSE RSFLGLAGYY RF+
Subjt: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------------------------------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFM
Query: EDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVF
E+FS IATP TQLTRKGAPFVWSKAC+DSFQNLKQKLVTA +LT+PD SGSFVIYSDASKKGL VLMQQGKVV YASRQLKSHE+NY THDLELAAVVF
Subjt: EDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVF
Query: VLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
LKIWRHYLYGEKIQIF DHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP KAN+V DALSRKVSHSAALIT+
Subjt: VLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
|
|
| A0A5A7T1P4 Reverse transcriptase | 2.2e-113 | 79.34 | Show/hide |
Query: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF--FLD-------------------------HVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRI
MSFGLTNAP VFM+LMN+VF FLD HVVSK GV VDPAKIEA+TSWPRPSTVSEVRSF+GLAGYY RF+E+FSRI
Subjt: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF--FLD-------------------------HVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRI
Query: ATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWR
ATP TQLTRKGAPFVWSKAC+DSFQNLKQKLVTA +L +PD SGSFVIYSDASKKGL VLMQQGKVVTYASRQLKSHE+NY THDLELA VVF LKIWR
Subjt: ATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWR
Query: HYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
HYLYGEKIQIF HKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP KAN+V DALSRKVSHSAALIT+
Subjt: HYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
|
|
| A0A5A7U7V9 Reverse transcriptase | 7.5e-114 | 77.62 | Show/hide |
Query: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------------------------------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFM
MSFGLTNAP VFM+LMN+VF FL HVVSK GV VDPAKIEA+T W RPSTVSEVRSFLGLAGYY RF+
Subjt: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------------------------------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFM
Query: EDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVF
E+FSRIATP TQLTRKGAPFVWSKAC+DSFQNLKQKLVTA +LT+PD SGSFVIYSDASKKGL VLMQQGKVV YASRQLKSHE+NY THDLELAAVVF
Subjt: EDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVF
Query: VLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
LKIWRHYLYGEKIQIF DHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP KAN+V DALSRKVSHSAALIT+
Subjt: VLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
|
|
| A0A5A7VIZ4 Pol protein | 8.9e-115 | 84.19 | Show/hide |
Query: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSK
MSFGLTNAP VFM+LMN+VF FL HVVSK GV VD AKIEA+TSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYY RF+E+FSRIATP TQLTRKGAPFVWSK
Subjt: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSK
Query: ACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLK
AC+DSFQNLKQKLVTA +PD SGSFVIYSDASKKGL VLMQQGKVV YASRQLKSHE+NY THDLELAAVVF LK WRHYLYGEKIQIF DHKSLK
Subjt: ACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLK
Query: YFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
YFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP KAN+V DALSRKVSHSAALIT+
Subjt: YFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
|
|
| A0A5D3DR46 Pol protein | 1.4e-115 | 84.58 | Show/hide |
Query: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSK
MSFGLTNAP VFM+LMN+VF FL HVVSK GV VD AKIEA+TSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYY RF+E+FSRIATP TQLTRKGAPFVWSK
Subjt: MSFGLTNAPTVFMNLMNKVF---------FLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSK
Query: ACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLK
AC+DSFQNLKQKLVTA +PD SGSFVIYSDASKKGL VLMQQGKVV YASRQLKSHE+NYLTHDLELAAVVF LK WRHYLYGEKIQIF DHKSLK
Subjt: ACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLK
Query: YFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
YFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHP KAN+V DALSRKVSHSAALIT+
Subjt: YFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRKVSHSAALITK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 2.2e-38 | 39.09 | Show/hide |
Query: LMNKVFFLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDS-FQNLKQKLVTASILTIP
L + FL HV++ DG+ +P KIEAI +P P+ E+++FLGL GYY +F+ +F+ IA P T+ +K + DS F+ LK + IL +P
Subjt: LMNKVFFLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDS-FQNLKQKLVTASILTIP
Query: DCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDY
D + F + +DAS L VL Q G ++Y SR L HE NY T + EL A+V+ K +RHYL G +I DH+ L + + K+ N + RW + ++
Subjt: DCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDY
Query: DCEILYHPSKANIVVDALSR
D +I Y K N V DALSR
Subjt: DCEILYHPSKANIVVDALSR
|
|
| P10394 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 412 | 2.2e-30 | 33.78 | Show/hide |
Query: MNKVFFLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDC
M++V FL H + G+L D K + I ++P P R F+ YY RF+++F+ + T+L +K PF W+ C+ +F +LK +L+ ++L PD
Subjt: MNKVFFLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTASILTIPDC
Query: SGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGK----VVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVK
S F I +DASK+ VL Q V YASR E N T + ELAA+ + + +R Y+YG+ + DH+ L Y F+ + + R ++
Subjt: SGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGK----VVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVK
Query: DYDCEILYHPSKANIVVDALSR
+Y+ + Y K N V DALSR
Subjt: DYDCEILYHPSKANIVVDALSR
|
|
| P10401 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon gypsy | 3.8e-38 | 37.99 | Show/hide |
Query: VFFLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTR-----------KGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTA
V +L +VSKDG DP K++AI +P P V +VRSFLGLA YY F++DF+ IA P T + + K P +++ +++FQ L+ L +
Subjt: VFFLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTR-----------KGAPFVWSKACKDSFQNLKQKLVTA
Query: S-ILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEK-IQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRR
IL PD F + +DAS G+ VL Q+G+ +T SR LK E+NY T++ EL A+V+ L +++LYG + I IF DH+ L + + N + +R
Subjt: S-ILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEK-IQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRR
Query: WLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRK
W + ++ ++ Y P K N V DALSR+
Subjt: WLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSRK
|
|
| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 1.2e-36 | 37.73 | Show/hide |
Query: LMNKVFFLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSK-ACKDSFQNLKQKLVTASILTIP
L + FL H+V+ DG+ +P K++AI S+P P+ E+R+FLGL GYY +F+ +++ IA P T +K K ++F+ LK ++ IL +P
Subjt: LMNKVFFLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTRKGAPFVWSK-ACKDSFQNLKQKLVTASILTIP
Query: DCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDY
D FV+ +DAS L VL Q G +++ SR L HE NY + EL A+V+ K +RHYL G + I DH+ L++ KE + RW + +Y
Subjt: DCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQQGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGEKIQIFMDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDY
Query: DCEILYHPSKANIVVDALSR
+I Y K N V DALSR
Subjt: DCEILYHPSKANIVVDALSR
|
|
| Q8I7P9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus | 8.4e-38 | 34.89 | Show/hide |
Query: LMNKVFFLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTR-----------KGAPFVWSKACKDSFQNLKQK
L +V FL ++V+ DG+ DP K+ AI+ P P++V E++ FLG+ YY +F++D++++A P T LTR P + SF +LK
Subjt: LMNKVFFLDHVVSKDGVLVDPAKIEAITSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYHRFMEDFSRIATPFTQLTR-----------KGAPFVWSKACKDSFQNLKQK
Query: LVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQ----QGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGE-KIQIFMDHKSLKYFFTQKE
L ++ IL P + F + +DAS + VL Q + + + Y SR L EENY T + E+ A+++ L R YLYG I+++ DH+ L + +
Subjt: LVTASILTIPDCSGSFVIYSDASKKGLSYVLMQ----QGKVVTYASRQLKSHEENYLTHDLELAAVVFVLKIWRHYLYGE-KIQIFMDHKSLKYFFTQKE
Query: LNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSR
N + +RW +++Y+CE++Y P K+N+V DALSR
Subjt: LNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPSKANIVVDALSR
|
|
