; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc09g0247221 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc09g0247221
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationCMiso1.1chr09:11628512..11629144
RNA-Seq ExpressionCmc09g0247221
SyntenyCmc09g0247221
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR027806 - Harbinger transposase-derived nuclease domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SVS9 Retrotransposon protein2.1e-8695.88Show/hide
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A0A5A7T1V5 Retrotransposon protein3.2e-8796.47Show/hide
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A0A5A7TLQ0 Retrotransposon protein1.4e-8797.06Show/hide
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A0A5A7U6C1 Retrotransposon protein7.1e-8796.47Show/hide
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A0A5A7V6J9 Retrotransposon protein1.4e-8797.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43722.1 unknown protein9.4e-1527.89Show/hide
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AT5G28730.1 unknown protein2.1e-1430.77Show/hide
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AT5G28950.1 unknown protein2.5e-1548Show/hide
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AT5G35695.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)9.7e-0466.67Show/hide
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AT5G41980.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)5.9e-2536.57Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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