| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
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| CAN67403.1 hypothetical protein VITISV_025614 [Vitis vinifera] | 3.9e-29 | 47.29 | Show/hide |
Query: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
++L+ +S+P +FW YAF TT+FLINR+P+ L+ SPF+ FG +P+ K+FG CYP ++ Y K+KL +++Q +FLGY N KGY+C NP T +
Subjt: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
Query: IVSRHVIFHETIFPFAQSSPSSPSHPLSL
V+RHV+FHET+FPF QS+P S +++
Subjt: IVSRHVIFHETIFPFAQSSPSSPSHPLSL
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| PKU81706.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Dendrobium catenatum] | 2.7e-30 | 50.4 | Show/hide |
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+L+ SS P +FWP A T +LINR+PSP+LH LSPFEKF P+ +L+ FG +CYPL+ S +HKL+PK + H+FLGY +KGY C + +T + I
Subjt: SLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQTI
Query: VSRHVIFHETIFPFAQSSPSSPSHP
SRHV FHE+ FPF+ + S P P
Subjt: VSRHVIFHETIFPFAQSSPSSPSHP
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| RVW70497.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 [Vitis vinifera] | 3.0e-29 | 49.59 | Show/hide |
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++L+ H+S+P+ +W AF+T V+LINRMP+P+L++ SP+EK FG P+ LK+FG CYP L Y+ HKL+ + IFLGY Y CY+PST +
Subjt: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
Query: IVSRHVIFHETIFPFAQSSPSSP
VSRHV F E+IFPF S P +P
Subjt: IVSRHVIFHETIFPFAQSSPSSP
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| RVX06084.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Vitis vinifera] | 3.9e-29 | 47.29 | Show/hide |
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++L+ +S+P +FW YAF TT+FLINR+P+ L+ SPF+ FG +P+ K+FG CYP ++ Y K+KL +++Q +FLGY N KGY+C NP T +
Subjt: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
Query: IVSRHVIFHETIFPFAQSSPSSPSHPLSL
V+RHV+FHET+FPF QS+P S +++
Subjt: IVSRHVIFHETIFPFAQSSPSSPSHPLSL
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| TKR89925.1 hypothetical protein D5086_0000238180 [Populus alba] | 5.5e-31 | 52.94 | Show/hide |
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++L+ H+S+P+ FWP+AF+T V+LINRMP+P+LH+ SP+EK FG+ P+ LKVF CYP L+ YT HKLEP++ IF GY YLCY+PST +
Subjt: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
Query: IVSRHVIFHETIFPFAQSS
VS HV F E+I+PF +S
Subjt: IVSRHVIFHETIFPFAQSS
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A2N9FMC6 Integrase catalytic domain-containing protein | 7.5e-34 | 54.33 | Show/hide |
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++LI SS+P+++WPYAFST ++LINRMP+P+L SP++ F PD +LK FG C+PLL+ Y KHKLEP+++ +FLGY N KGYLC N T +
Subjt: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
Query: IVSRHVIFHETIFPF-AQSSPSSPSHP
++SRHV FHE FPF +Q+SPSS S P
Subjt: IVSRHVIFHETIFPF-AQSSPSSPSHP
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| A0A2N9GRJ0 Uncharacterized protein | 7.5e-34 | 54.33 | Show/hide |
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++LI SS+P+++WPYAFST ++LINRMP+P+L SP++ F PD +LK FG C+PLL+ Y KHKLEP+++ +FLGY N KGYLC N T +
Subjt: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
Query: IVSRHVIFHETIFPF-AQSSPSSPSHP
++SRHV FHE FPF +Q+SPSS S P
Subjt: IVSRHVIFHETIFPF-AQSSPSSPSHP
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| A0A2N9H1I5 Integrase catalytic domain-containing protein | 5.2e-35 | 56.69 | Show/hide |
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++LI +S+P+ FWPYAFST VFLINR+PS +SP++ FG++PD ++ FG +CYPLL+ Y+ HKL P++TQ +FLGYP N KG+LCY PS+K+
Subjt: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
Query: IVSRHVIFHETIFPFAQ--SSPSSPSH
VSRHV F E+ FPF+ SSPSSPSH
Subjt: IVSRHVIFHETIFPFAQ--SSPSSPSH
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| A0A2N9HPM6 Integrase catalytic domain-containing protein | 5.2e-35 | 56.69 | Show/hide |
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++LI +S+P+ FWPYAFST VFLINR+PS +SP++ FG++PD ++ FG +CYPLL+ Y+ HKL P++TQ +FLGYP N KG+LCY PS+K+
Subjt: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
Query: IVSRHVIFHETIFPFAQ--SSPSSPSH
VSRHV F E+ FPF+ SSPSSPSH
Subjt: IVSRHVIFHETIFPFAQ--SSPSSPSH
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| A0A2N9I1C1 Integrase catalytic domain-containing protein | 5.2e-35 | 56.69 | Show/hide |
Query: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
++LI +S+P+ FWPYAFST VFLINR+PS +SP++ FG++PD ++ FG +CYPLL+ Y+ HKL P++TQ +FLGYP N KG+LCY PS+K+
Subjt: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
Query: IVSRHVIFHETIFPFAQ--SSPSSPSH
VSRHV F E+ FPF+ SSPSSPSH
Subjt: IVSRHVIFHETIFPFAQ--SSPSSPSH
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04146 Copia protein | 1.8e-08 | 31.25 | Show/hide |
Query: SLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSL--HMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQ
+++ + + FW A T +LINR+PS +L +P+E + P L++L+VFG + Y +K+ + K + K+ + IF+GY N G+ ++ ++
Subjt: SLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSL--HMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQ
Query: TIVSRHVIFHET
IV+R V+ ET
Subjt: TIVSRHVIFHET
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| P10978 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 1.6e-09 | 32.73 | Show/hide |
Query: SLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQTI
S++ + +P FW A T +LINR PS L P + +LKVFG + + + KL+ K+ IF+GY GY ++P K+ I
Subjt: SLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQTI
Query: VSRHVIFHET
SR V+F E+
Subjt: VSRHVIFHET
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| Q94HW2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 | 4.1e-29 | 47.41 | Show/hide |
Query: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
++L+ H+S+P +WPYAF+ V+LINR+P+P L + SPF+K FG +P+ L+VFG +CYP L+ Y +HKL+ K+ Q +FLGY YLC + T +
Subjt: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
Query: IVSRHVIFHETIFPFA
+SRHV F E FPF+
Subjt: IVSRHVIFHETIFPFA
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| Q9ZT94 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 | 1.8e-29 | 45.32 | Show/hide |
Query: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
++L+ H+SVP +WPYAFS V+LINR+P+P L + SPF+K FG P+ LKVFG +CYP L+ Y +HKLE K+ Q F+GY YLC + T +
Subjt: MSLIFHSSVPVEFWPYAFSTTVFLINRMPSPSLHMLSPFEKFFGNTPDLRYLKVFGLSCYPLLKSYTKHKLEPKTTQHIFLGYPHNFKGYLCYNPSTKQT
Query: IVSRHVIFHETIFPF--------------AQSSPSSPSH
SRHV F E FPF + S+P+ PSH
Subjt: IVSRHVIFHETIFPF--------------AQSSPSSPSH
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