; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc09g0251641 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc09g0251641
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationCMiso1.1chr09:17697866..17698387
RNA-Seq ExpressionCmc09g0251641
SyntenyCmc09g0251641
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR027806 - Harbinger transposase-derived nuclease domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TYK19867.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-6493.23Show/hide
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A0A5A7U6C1 Retrotransposon protein1.3e-6497.67Show/hide
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A0A5A7V6J9 Retrotransposon protein1.3e-6497.67Show/hide
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A0A5A7VJQ1 Retrotransposon protein4.6e-6589.66Show/hide
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A0A5D3D8H2 Retrotransposon protein7.8e-6593.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9M2U3 Protein ALP1-like2.6e-0435.29Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43722.1 unknown protein6.0e-0928.57Show/hide
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         G  GS  D+R+L  AIS +    VP
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AT5G28950.1 unknown protein5.6e-1547.37Show/hide
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AT5G41980.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)8.1e-2239.01Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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