| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0036309.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 4.7e-152 | 95.19 | Show/hide |
Query: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVF CQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYF SLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Subjt: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Query: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTL SGVFS SSKKQEIVAQSTAEAEFIAATA NQALW
Subjt: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
Query: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
LRKILLDLDLEQ+++T+IL+DNKAAIAISHNP+FY KTKHFNIKLFFLREVQKS EVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
Subjt: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
|
|
| TYJ95793.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 4.7e-152 | 95.19 | Show/hide |
Query: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVF CQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYF SLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Subjt: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Query: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTL SGVFS SSKKQEIVAQSTAEAEFIAATA NQALW
Subjt: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
Query: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
LRKILLDLDLEQ+++T+IL+DNKAAIAISHNP+FY KTKHFNIKLFFLREVQKS EVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
Subjt: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
|
|
| TYK12368.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 6.1e-152 | 95.19 | Show/hide |
Query: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVF CQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYF SLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Subjt: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Query: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTL SGVFS S KKQEIVAQSTAEAEFIAATA NQALW
Subjt: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
Query: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
LRKILLDLDLEQ++NT+IL+DNKAAIAISHNP+FY KTKHFNIKLFFLREVQKS EVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
Subjt: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
|
|
| TYK21117.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 4.7e-152 | 95.19 | Show/hide |
Query: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVF CQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYF SLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Subjt: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Query: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTL SGVFS SSKKQEIVAQSTAEAEFIAATA NQALW
Subjt: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
Query: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
LRKILLDLDLEQ+++T+IL+DNKAAIAISHNP+FY KTKHFNIKLFFLREVQKS EVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
Subjt: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
|
|
| TYK27376.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 4.7e-152 | 95.19 | Show/hide |
Query: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVF CQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYF SLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Subjt: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Query: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTL SGVFS SSKKQEIVAQSTAEAEFIAATA NQALW
Subjt: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
Query: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
LRKILLDLDLEQ+++T+IL+DNKAAIAISHNP+FY KTKHFNIKLFFLREVQKS EVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
Subjt: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5D3CMK4 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 3.0e-152 | 95.19 | Show/hide |
Query: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVF CQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYF SLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Subjt: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Query: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTL SGVFS S KKQEIVAQSTAEAEFIAATA NQALW
Subjt: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
Query: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
LRKILLDLDLEQ++NT+IL+DNKAAIAISHNP+FY KTKHFNIKLFFLREVQKS EVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
Subjt: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
|
|
| A0A5D3DBU0 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 2.3e-152 | 95.19 | Show/hide |
Query: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVF CQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYF SLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Subjt: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Query: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTL SGVFS SSKKQEIVAQSTAEAEFIAATA NQALW
Subjt: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
Query: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
LRKILLDLDLEQ+++T+IL+DNKAAIAISHNP+FY KTKHFNIKLFFLREVQKS EVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
Subjt: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
|
|
| A0A5D3DMJ1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 2.3e-152 | 95.19 | Show/hide |
Query: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVF CQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYF SLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Subjt: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Query: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTL SGVFS SSKKQEIVAQSTAEAEFIAATA NQALW
Subjt: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
Query: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
LRKILLDLDLEQ+++T+IL+DNKAAIAISHNP+FY KTKHFNIKLFFLREVQKS EVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
Subjt: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
|
|
| A0A5D3DUI8 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 2.3e-152 | 95.19 | Show/hide |
Query: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVF CQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYF SLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Subjt: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Query: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTL SGVFS SSKKQEIVAQSTAEAEFIAATA NQALW
Subjt: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
Query: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
LRKILLDLDLEQ+++T+IL+DNKAAIAISHNP+FY KTKHFNIKLFFLREVQKS EVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
Subjt: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
|
|
| A0A5D3E2V7 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 2.3e-152 | 95.19 | Show/hide |
Query: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVF CQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYF SLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Subjt: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Query: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTL SGVFS SSKKQEIVAQSTAEAEFIAATA NQALW
Subjt: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
Query: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
LRKILLDLDLEQ+++T+IL+DNKAAIAISHNP+FY KTKHFNIKLFFLREVQKS EVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
Subjt: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGVC
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04146 Copia protein | 2.9e-51 | 40.4 | Show/hide |
Query: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQK---EKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMY-LTATRPDILNAV
+M+ F MTDL + +F+GI I+ + +++ Q Y K+IL KF M+ C AVSTP+ K E L ++ + SLIGCLMY + TRPD+ AV
Subjt: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQK---EKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMY-LTATRPDILNAV
Query: SILSRFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEF--KLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTL-GSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATA
+ILSR+ + + KRV+RY+KGT D + F + F K+IG+ DSDW GS D +ST GY F + + ++K+Q VA S+ EAE++A
Subjt: SILSRFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEF--KLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTL-GSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATA
Query: IVNQALWLRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGV
V +ALWL+ +L ++++ KI DN+ I+I++NP + + KH +IK F RE ++ + L Y TE+Q+ADI TKPLP +F LR KLG+
Subjt: IVNQALWLRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGV
|
|
| P10978 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 3.7e-43 | 35.79 | Show/hide |
Query: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEI--KQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEG------YFMSLIGCLMY-LTATRPD
+ K F+M DLG LG++I ++ +++ Q+KY + +L++F M K VSTP+ KL K+ V+E + S +G LMY + TRPD
Subjt: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEI--KQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEG------YFMSLIGCLMY-LTATRPD
Query: ILNAVSILSRFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAA
I +AV ++SRF+ + H +A K ++RY++GT+ + F G + L G++D+D G ID+ +S+ GY FT G S SK Q+ VA ST EAE+IAA
Subjt: ILNAVSILSRFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAA
Query: TAIVNQALWLRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGV
T + +WL++ L +L L Q+E + D+++AI +S N M++ +TKH +++ ++RE+ E + ++ T + AD+LTK +P KFE + +G+
Subjt: TAIVNQALWLRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGV
|
|
| P92519 Uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810 | 8.1e-30 | 39.8 | Show/hide |
Query: FEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILSRFMH
F M DLG + YFLGI+IK +F Q KYA++IL M +CK +STP+ K A D F S++G L YLT TRPDI AV+I+ + MH
Subjt: FEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILSRFMH
Query: CASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
+ KRV+RYVKGT G+ + + + F DSDW G RST G+C LG + S S+K+Q V++S+ E E+ A + W
Subjt: CASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
|
|
| Q94HW2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 | 1.8e-45 | 36.9 | Show/hide |
Query: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
+ + F + D + YFLGIE K+ + Q++Y ++L + M K V+TPM KL G D + ++G L YL TRPDI AV+ LS
Subjt: MMKMFEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILS
Query: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
+FMH +E HL+A KR++RY+ GT + G+ +G L +SD+DW G DD ST GY LG S SSKKQ+ V +S+ EAE+ + ++ W
Subjt: RFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
Query: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGV
+ +L +L + I DN A + NP+F+++ KH I F+R +S + +V+ T DQ+AD LTKPL F+ SK+GV
Subjt: LRKILLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGV
|
|
| Q9ZT94 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 | 9.8e-44 | 36.33 | Show/hide |
Query: MSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILSRFMHCASELHLK
+ YFLGIE K+ + Q++Y ++L + M K V+TPM KL G D + ++G L YL TRPD+ AV+ LS++MH ++ H
Subjt: MSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILSRFMHCASELHLK
Query: AAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALWLRKILLDLDLEQ
A KRV+RY+ GT D G+ +G L +SD+DW G DD ST GY LG S SSKKQ+ V +S+ EAE+ + ++ W+ +L +L ++
Subjt: AAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALWLRKILLDLDLEQ
Query: RENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGV
I DN A + NP+F+++ KH + F+R +S + +V+ T DQ+AD LTKPL F+ K+GV
Subjt: RENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLREVQKSEEVILVYCKTEDQVADILTKPLPTCKFEFLRSKLGV
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT4G23160.1 cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 | 1.5e-39 | 37.4 | Show/hide |
Query: FEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILSRFMH
F++ DLG + YFLG+EI + + CQ+KYA ++L + + CK S PM+ G D VD + LIG LMYL TR DI AV+ LS+F
Subjt: FEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILSRFMH
Query: CASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALWLRKI
H +A +++ Y+KGT G+ ++ E +L FSD+ + D RST GYC LG+ + S SKKQ++V++S+AEAE+ A + ++ +WL +
Subjt: CASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALWLRKI
Query: LLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLRE
+L L + T + DN AAI I+ N +F+ +TKH +RE
Subjt: LLDLDLEQRENTKILIDNKAAIAISHNPMFYNKTKHFNIKLFFLRE
|
|
| ATMG00240.1 Gag-Pol-related retrotransposon family protein | 5.1e-11 | 40.51 | Show/hide |
Query: MYLTATRPDILNAVSILSRFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYC
MYLT TRPD+ AV+ LS+F + ++A +V+ YVKGT G+ ++ + +L F+DSDW D RS G+C
Subjt: MYLTATRPDILNAVSILSRFMHCASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYC
|
|
| ATMG00810.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein | 5.7e-31 | 39.8 | Show/hide |
Query: FEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILSRFMH
F M DLG + YFLGI+IK +F Q KYA++IL M +CK +STP+ K A D F S++G L YLT TRPDI AV+I+ + MH
Subjt: FEMTDLGLMSYFLGIEIKQGQGEVFTCQKKYAKEILKKFKMDECKAVSTPMNQKEKLCKEDGADKVDEGYFMSLIGCLMYLTATRPDILNAVSILSRFMH
Query: CASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
+ KRV+RYVKGT G+ + + + F DSDW G RST G+C LG + S S+K+Q V++S+ E E+ A + W
Subjt: CASELHLKAAKRVIRYVKGTSDFGVKFTRGKEFKLIGFSDSDWGGSIDDMRSTLGYCFTLGSGVFSSSSKKQEIVAQSTAEAEFIAATAIVNQALW
|
|
