| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0037087.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.3e-61 | 90.77 | Show/hide |
Query: MIDELLDELHGASIFSKIDLKSGYHQIRVRDEYVKKTAFQTHEGHYEFMVMPFGLTNAPTTFQALMNQVFRPYLRKFILVFFDDILVYSKDAESHLEHLT
MIDEL+DELHGASIFSKIDLKSGYHQIRVR+E VKKTAF+ HEGHYEF+VMPFGLT+AP TFQALMNQVFRPYLRKFILVFFDDILVYSKDAESHLEHLT
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++F+LLREHSLFANRKKC FGKERIEYLGH
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| KAA0039534.1 Transposon Tf2-6 polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.0e-63 | 94.62 | Show/hide |
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MIDELLDELHGASIFSKIDLKSGYHQIRVRDE VKKTAFQTHEGH EFMVMPFGLTNAP TFQALMNQVFRPYLRKFILVFFDDILVYSKD ESHLEHL+
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I+FTLLREHSLFANRKKC FGKERIEYLGH
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| KAA0045701.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus [Cucumis melo var. makuwa] | 7.6e-67 | 98.46 | Show/hide |
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MIDELLDELHGASIFSKIDLKSGYHQIRVRDEYVKKTAFQTH+GHYEFMVMPFGLTNAPTTFQALMNQVFRPYLRKFILVFFDDILVYSKDAESHLEHL
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ILFTLLREHSLFANRKKCQFGKERIEYLGH
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| KAA0056798.1 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.8e-61 | 91.54 | Show/hide |
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MIDELLDELHGA+IFSKIDLKS YHQIRVRDE VKKTAF+THEGHYEFMVMPF LTNAP TFQALMNQVFRPYLRKFILVFFDDILVYSKD ESHLEHLT
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Query: ILFTLLREHSLFANRKKCQFGKERIEYLGH
I+FTLLREHSLFANRKKC FG+E+IEYLGH
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| TYK21209.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 8.4e-58 | 84.62 | Show/hide |
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MIDELLDEL GASIFSKIDLKSGYHQIRVRDE + KTAF+THEGHYEF+VMPFGLTNAP TFQALMNQVFRPYLRKF+LVFFDDILVYS+D E+HLEHLT
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++F LLR+H LFANR+KC F K+RIEYLGH
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7T6A3 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 6.1e-62 | 90.77 | Show/hide |
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MIDEL+DELHGASIFSKIDLKSGYHQIRVR+E VKKTAF+ HEGHYEF+VMPFGLT+AP TFQALMNQVFRPYLRKFILVFFDDILVYSKDAESHLEHLT
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Query: ILFTLLREHSLFANRKKCQFGKERIEYLGH
++F+LLREHSLFANRKKC FGKERIEYLGH
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| A0A5A7T7U6 Transposon Tf2-6 polyprotein | 1.4e-63 | 94.62 | Show/hide |
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MIDELLDELHGASIFSKIDLKSGYHQIRVRDE VKKTAFQTHEGH EFMVMPFGLTNAP TFQALMNQVFRPYLRKFILVFFDDILVYSKD ESHLEHL+
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Query: ILFTLLREHSLFANRKKCQFGKERIEYLGH
I+FTLLREHSLFANRKKC FGKERIEYLGH
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| A0A5A7UNX8 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 1.4e-61 | 91.54 | Show/hide |
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MIDELLDELHGA+IFSKIDLKS YHQIRVRDE VKKTAF+THEGHYEFMVMPF LTNAP TFQALMNQVFRPYLRKFILVFFDDILVYSKD ESHLEHLT
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Query: ILFTLLREHSLFANRKKCQFGKERIEYLGH
I+FTLLREHSLFANRKKC FG+E+IEYLGH
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| A0A5D3BD16 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 4.1e-58 | 84.62 | Show/hide |
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MIDELLDEL GASIFSKIDLKSGYHQIRVRDE + KTAF+THEGHYEF+VMPFGLTNAP TFQALMNQVFRPYLRKF+LVFFDDILVYS+D E+HLEHLT
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Query: ILFTLLREHSLFANRKKCQFGKERIEYLGH
++F LLR+H LFANR+KC F K+RIEYLGH
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| A0A5D3BLH4 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus | 3.7e-67 | 98.46 | Show/hide |
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MIDELLDELHGASIFSKIDLKSGYHQIRVRDEYVKKTAFQTH+GHYEFMVMPFGLTNAPTTFQALMNQVFRPYLRKFILVFFDDILVYSKDAESHLEHL
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Query: ILFTLLREHSLFANRKKCQFGKERIEYLGH
ILFTLLREHSLFANRKKCQFGKERIEYLGH
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P03555 Enzymatic polyprotein | 1.8e-23 | 43.31 | Show/hide |
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DELL + G IFS D KSG+ Q+ + E TAF +GHYE+ V+PFGL AP+ FQ M++ FR + RKF V+ DDILV+S + E HL H+ ++
Subjt: DELLDELHGASIFSKIDLKSGYHQIRVRDEYVKKTAFQTHEGHYEFMVMPFGLTNAPTTFQALMNQVFRPYLRKFILVFFDDILVYSKDAESHLEHLTIL
Query: FTLLREHSLFANRKKCQFGKERIEYLG
+H + ++KK Q K++I +LG
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| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 3.2e-28 | 46.51 | Show/hide |
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+DE+L +L + F+ IDL G+HQI + E V KTAF T GHYE++ MPFGL NAP TFQ MN + RP L K LV+ DDI+V+S + HL+ L +
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Query: LFTLLREHSLFANRKKCQFGKERIEYLGH
+F L + +L KC+F K+ +LGH
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| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 2.5e-28 | 44.96 | Show/hide |
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+DE+L +L F+ IDL G+HQI + +E + KTAF T GHYE++ MPFGL NAP TFQ MN + RP L K LV+ DDI+++S HL + +
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Query: LFTLLREHSLFANRKKCQFGKERIEYLGH
+FT L + +L KC+F K+ +LGH
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| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 1.2e-25 | 44.96 | Show/hide |
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ID LL + A IF+ +DL SGYHQI + + KTAF T G YE+ VMPFGL NAP+TF M FR +F+ V+ DDIL++S+ E H +HL
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Query: LFTLLREHSLFANRKKCQFGKERIEYLGH
+ L+ +L +KKC+F E E+LG+
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| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 1.2e-25 | 44.96 | Show/hide |
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ID LL + A IF+ +DL SGYHQI + + KTAF T G YE+ VMPFGL NAP+TF M FR +F+ V+ DDIL++S+ E H +HL
Subjt: IDELLDELHGASIFSKIDLKSGYHQIRVRDEYVKKTAFQTHEGHYEFMVMPFGLTNAPTTFQALMNQVFRPYLRKFILVFFDDILVYSKDAESHLEHLTI
Query: LFTLLREHSLFANRKKCQFGKERIEYLGH
+ L+ +L +KKC+F E E+LG+
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