; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc11g0294151 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc11g0294151
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Descriptionzinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Genome locationCMiso1.1chr11:10532261..10532785
RNA-Seq ExpressionCmc11g0294151
SyntenyCmc11g0294151
Gene Ontology termsGO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008906 - HAT, C-terminal dimerisation domain
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ACX85638.1 putative transposase [Cucumis melo]6.1e-8895.98Show/hide
Query:  MRTSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVAR
        MR SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQS KTCLDDAKTEVTRYLDEARIDC+GDEYL+LLTWWKVN+SRFKIISQVAR
Subjt:  MRTSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVAR

Query:  DIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFEVRI
        DIY IPISTVPS+SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFEVRI
Subjt:  DIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFEVRI

ADN33674.1 transposase [Cucumis melo subsp. melo]6.1e-8895.98Show/hide
Query:  MRTSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVAR
        MR SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQS KTCLDDAKTEVTRYLDEARIDC+GDEYL+LLTWWKVN+SRFKIISQVAR
Subjt:  MRTSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVAR

Query:  DIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFEVRI
        DIY IPISTVPS+SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFEVRI
Subjt:  DIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFEVRI

KAA0058067.1 putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]4.2e-8195.12Show/hide
Query:  RTSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARD
        R SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQS KTCLDDAKTEVTRYLDEARIDC+G EYL+LLTWWKVN+SRFKIISQVARD
Subjt:  RTSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARD

Query:  IYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE
        IY IPISTVPS+SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE
Subjt:  IYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE

KAA0064124.1 putative aspartyl aminopeptidase [Cucumis melo var. makuwa]4.2e-8195.68Show/hide
Query:  SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIY
        SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQS KTCLDDAKTEVTRYLDEARIDC+GDEYL+LLTWWKVN+SRFKIISQVARDIY
Subjt:  SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIY

Query:  GIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE
         IPISTVPS+SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDM EEIDGAEEIDE
Subjt:  GIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE

TYK20956.1 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X3 [Cucumis melo var. makuwa]6.8e-7993.21Show/hide
Query:  SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIY
        SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQS KTCLDDAKTEV RYLDEARIDC GDEYL+LLTWWKVNSSRFKIISQ+A+DIY
Subjt:  SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIY

Query:  GIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE
         IPISTVPS+SAFS GGRVLDSFRSSLTPQTAE LICA NWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE
Subjt:  GIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UTL3 Putative transposase2.1e-8195.12Show/hide
Query:  RTSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARD
        R SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQS KTCLDDAKTEVTRYLDEARIDC+G EYL+LLTWWKVN+SRFKIISQVARD
Subjt:  RTSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARD

Query:  IYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE
        IY IPISTVPS+SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE
Subjt:  IYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE

A0A5A7VA60 Putative aspartyl aminopeptidase2.1e-8195.68Show/hide
Query:  SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIY
        SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQS KTCLDDAKTEVTRYLDEARIDC+GDEYL+LLTWWKVN+SRFKIISQVARDIY
Subjt:  SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIY

Query:  GIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE
         IPISTVPS+SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDM EEIDGAEEIDE
Subjt:  GIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE

A0A5D3DBL3 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X33.3e-7993.21Show/hide
Query:  SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIY
        SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQS KTCLDDAKTEV RYLDEARIDC GDEYL+LLTWWKVNSSRFKIISQ+A+DIY
Subjt:  SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIY

Query:  GIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE
         IPISTVPS+SAFS GGRVLDSFRSSLTPQTAE LICA NWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE
Subjt:  GIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDE

D0UIX2 Putative transposase3.0e-8895.98Show/hide
Query:  MRTSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVAR
        MR SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQS KTCLDDAKTEVTRYLDEARIDC+GDEYL+LLTWWKVN+SRFKIISQVAR
Subjt:  MRTSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVAR

Query:  DIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFEVRI
        DIY IPISTVPS+SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFEVRI
Subjt:  DIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFEVRI

E5GB32 Transposase3.0e-8895.98Show/hide
Query:  MRTSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVAR
        MR SKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQS KTCLDDAKTEVTRYLDEARIDC+GDEYL+LLTWWKVN+SRFKIISQVAR
Subjt:  MRTSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVAR

Query:  DIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFEVRI
        DIY IPISTVPS+SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFEVRI
Subjt:  DIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFEVRI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B9FJG3 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 11.2e-1444.68Show/hide
Query:  KTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPS-KSAFS--TGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKP
        K+E+ +YLDE+    I  +  ++L WWK+N+ ++  +S++ARDI  IP+S V S  S FS  TG R+LD +RSS  P+  EAL+CA++W+Q  P
Subjt:  KTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPS-KSAFS--TGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKP

P03010 Putative AC9 transposase6.1e-1440Show/hide
Query:  EVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWI
        E+ +Y+ E  +   G    ++L+WW+   + + I++Q+ARD+  I +STV S+SAFS GGRV+D +R+ L  +  EALIC ++W+
Subjt:  EVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWI

P08770 Putative AC transposase6.1e-1440Show/hide
Query:  EVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWI
        E+ +Y+ E  +   G    ++L+WW+   + + I++Q+ARD+  I +STV S+SAFS GGRV+D +R+ L  +  EALIC ++W+
Subjt:  EVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWI

Q6AVI0 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 21.1e-1546.81Show/hide
Query:  KTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPS-KSAFS--TGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKP
        K+E+ +YLDE+    I  +  ++L WWK+N+ +F  +S++ARDI  IP+S V S  S FS  TG R+LD +RSSL P+  EAL+CA++W+Q  P
Subjt:  KTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPS-KSAFS--TGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKP

Q75HY5 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 36.5e-1644.68Show/hide
Query:  TEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPSK----SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKP
        +E+ +YL+EA +  I D    +L WWK+N+ +F  +S++ARD+  IP+S V S     SA +TG ++LD +RSSL P+T EAL CA++W+Q  P
Subjt:  TEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPSK----SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18560.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain5.1e-0828.74Show/hide
Query:  EVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQS
        E+T+YL E+ +    D    +L WWKVNS R+  +S +ARD   +  ++   +  F   G  +D  +  +   + +++IC ++WI++
Subjt:  EVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQS

AT3G42170.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain8.1e-1436.17Show/hide
Query:  KTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWI
        +T   + K+E+ +YLDE  +  +  +  ++L WWK N  ++  +S++ARDI  IP+S       F    R +D +++SL P+T EALICA+ W+
Subjt:  KTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTVPSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAACGTCAAAAGAAAAATATTCACAAACACAATCATGTACACCTATCGAAGGATTTGGCTTTCAAAGTCAAAGTGAAATACCTTCTATCTCATCTAGTGGATCTTA
TAAGGCACGTGCTACTGTTCATGATAGATTTAAGCAAAGTTACAAAACATGTCTAGATGATGCTAAAACAGAGGTGACTCGTTATCTGGATGAGGCTCGTATAGATTGTA
TTGGCGATGAATATTTAAATTTGCTAACTTGGTGGAAGGTGAATTCCTCTCGATTTAAGATCATTAGCCAAGTAGCTAGGGACATCTACGGTATTCCTATATCAACTGTG
CCTTCTAAGTCCGCCTTTAGCACTGGAGGACGGGTGTTAGATTCTTTTCGAAGTTCTTTAACTCCTCAAACTGCAGAGGCACTCATTTGTGCTCAGAATTGGATTCAGTC
TAAACCTTTGGATGACATGACTGAAGAAATTGACGGGGCTGAAGAAATTGATGAAGGTAATATTCTTTTTGAAGTACGCATTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGAACGTCAAAAGAAAAATATTCACAAACACAATCATGTACACCTATCGAAGGATTTGGCTTTCAAAGTCAAAGTGAAATACCTTCTATCTCATCTAGTGGATCTTA
TAAGGCACGTGCTACTGTTCATGATAGATTTAAGCAAAGTTACAAAACATGTCTAGATGATGCTAAAACAGAGGTGACTCGTTATCTGGATGAGGCTCGTATAGATTGTA
TTGGCGATGAATATTTAAATTTGCTAACTTGGTGGAAGGTGAATTCCTCTCGATTTAAGATCATTAGCCAAGTAGCTAGGGACATCTACGGTATTCCTATATCAACTGTG
CCTTCTAAGTCCGCCTTTAGCACTGGAGGACGGGTGTTAGATTCTTTTCGAAGTTCTTTAACTCCTCAAACTGCAGAGGCACTCATTTGTGCTCAGAATTGGATTCAGTC
TAAACCTTTGGATGACATGACTGAAGAAATTGACGGGGCTGAAGAAATTGATGAAGGTAATATTCTTTTTGAAGTACGCATTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRTSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSYKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCIGDEYLNLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYGIPISTV
PSKSAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFEVRI