| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0035890.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.0e-179 | 91.07 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
+EAVTNWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFVEDFSRIAS T LTRKGTPFV SPACESSFQELKQKLVTAPVLTV DGSG+FVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
GK+VA ASRQLK HEQNYPTHDLELAAVVF LKIWRHYLY EKIQI+ DHKSLKYFFTQ ELNMR+RRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVAD LSRKVAH
Subjt: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
Query: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
SAALITKQ PLLRDFE+ EIAVSVGEVT+QLAQLSVQPTLRQ+II AQLNDPYL EKRR+VETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPED+ VK ELLTEAH
Subjt: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
Query: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWR MKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
Subjt: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
|
|
| KAA0036948.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.2e-189 | 100 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
Subjt: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
Query: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
Subjt: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
Query: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSR
SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSR
Subjt: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSR
|
|
| KAA0045309.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 8.8e-179 | 90.78 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
+EAVTNWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFVED SRIAS T LTRKGTPFV SPACE SFQELKQKLVTAPVLTV DGSG+FVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
GK+VA ASRQLK HEQNYPTHDLELAAVVF LKIWRHYLY EKIQI+ DHKSLKYFFTQ ELNMR+RRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVAD+LSRKVAH
Subjt: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
Query: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
SAALITKQ PLLRDFE+ EIAVSVGEVT+QLAQLSVQPTLRQ+II AQLNDPYL EKRR+VETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPED+ VKTELLTEAH
Subjt: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
Query: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWR MKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
Subjt: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
|
|
| KAA0056047.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 6.7e-179 | 91.93 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
+EAVTNWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFVEDFSRIAS T LTRKGTPFV SPACESSFQELKQKLVTAPVLT+ DGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
GK+VA ASRQLKSHEQNY HDLELAAVVF LKIW HYLY EKIQI+ +HKSLKYFFTQ +LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVAD LSRKVAH
Subjt: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
Query: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
SAALITKQAPLLRDFE+ EIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSI SDDGLMFE RLCVPED+ VKTELLTEAH
Subjt: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
Query: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
Subjt: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
|
|
| TYK08868.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.8e-179 | 91.64 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
+EAVTNWPRPSTV++I SFLGLAGYYRRFVEDFSRIAS T LTRKGTPFV SP CESSF ELKQKLVTAPVLTV DGSGSFVIYSD SKKGLGCVLMQQ
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
GK+VA ASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLY E+IQI+ DHKSLKYFFTQ ELNMR+RRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVAD LSRKVAH
Subjt: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
Query: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
SAALITKQ PLLRDFE+ EIAVSVGEVTSQLAQL VQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVET QGEDFSISS+DGLMFEGRLCVPED+ VKTELLTEAH
Subjt: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
Query: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
Subjt: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SXW6 Reverse transcriptase | 1.5e-179 | 91.07 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
+EAVTNWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFVEDFSRIAS T LTRKGTPFV SPACESSFQELKQKLVTAPVLTV DGSG+FVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
GK+VA ASRQLK HEQNYPTHDLELAAVVF LKIWRHYLY EKIQI+ DHKSLKYFFTQ ELNMR+RRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVAD LSRKVAH
Subjt: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
Query: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
SAALITKQ PLLRDFE+ EIAVSVGEVT+QLAQLSVQPTLRQ+II AQLNDPYL EKRR+VETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPED+ VK ELLTEAH
Subjt: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
Query: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWR MKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
Subjt: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
|
|
| A0A5A7T2D9 Pol protein | 2.0e-189 | 100 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
Subjt: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
Query: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
Subjt: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
Query: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSR
SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSR
Subjt: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSR
|
|
| A0A5A7TG62 Reverse transcriptase | 4.3e-179 | 90.78 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
+EAVTNWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFVEDFSRIAS T LTRKGTPFV SPACESSFQELKQKLVTAPVLTV DGSG+FVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
GK+VA ASRQLK +EQNYPTHDLEL AVVF LKIWRHYLY EKIQI+ DHKSLKYFFTQ ELNMR+RRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVAD LSRKVAH
Subjt: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
Query: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
SA LITKQ PLLRDFE+ EIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQ+II AQLNDPYLVEKRR+VETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPED+ V+TELLTEAH
Subjt: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
Query: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWR MKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
Subjt: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
|
|
| A0A5A7UN68 Reverse transcriptase | 3.3e-179 | 91.93 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
+EAVTNWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFVEDFSRIAS T LTRKGTPFV SPACESSFQELKQKLVTAPVLT+ DGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
GK+VA ASRQLKSHEQNY HDLELAAVVF LKIW HYLY EKIQI+ +HKSLKYFFTQ +LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVAD LSRKVAH
Subjt: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
Query: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
SAALITKQAPLLRDFE+ EIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSI SDDGLMFE RLCVPED+ VKTELLTEAH
Subjt: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
Query: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
Subjt: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
|
|
| A0A5D3CCF0 Pol protein | 8.6e-180 | 91.64 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
+EAVTNWPRPSTV++I SFLGLAGYYRRFVEDFSRIAS T LTRKGTPFV SP CESSF ELKQKLVTAPVLTV DGSGSFVIYSD SKKGLGCVLMQQ
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
GK+VA ASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLY E+IQI+ DHKSLKYFFTQ ELNMR+RRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVAD LSRKVAH
Subjt: GKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSRKVAH
Query: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
SAALITKQ PLLRDFE+ EIAVSVGEVTSQLAQL VQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVET QGEDFSISS+DGLMFEGRLCVPED+ VKTELLTEAH
Subjt: SAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGRLCVPEDNVVKTELLTEAH
Query: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
Subjt: SSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQQVKAPR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 3.4e-32 | 37.56 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPF-VSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQ
+EA+ +P P+ +I +FLGL GYYR+F+ +F+ IA T +K ++P +S+F++LK + P+L V D + F + +DAS LG VL Q
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPF-VSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQ
Query: QGKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSR
G ++ SR L HE NY T + EL A+V+ K +RHYL +I DH+ L + + + N + RW + ++D +I Y GK N VAD LSR
Subjt: QGKIVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYSEKIQIFMDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADTLSR
|
|
| P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein | 4.4e-32 | 26.33 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
++ V W +P ++ FLG Y R+F+ S++ L +K + +P + + +KQ LV+ PVL D S ++ +DAS +G VL Q+
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GK-----IVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYS--EKIQIFMDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVA
V S ++ + NY D E+ A++ +LK WRHYL S E +I DH++L T N R RW ++D++ EI Y PG AN +A
Subjt: GK-----IVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYS--EKIQIFMDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVA
Query: DTLSRKVAHSAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGR--LC
D LSR ++ + P+ +D E + I + + Q+S+ + +++ ND L+ E +R+ E +I DGL+ + +
Subjt: DTLSRKVAHSAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGR--LC
Query: VPEDNVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQ
+P D + ++ + H +HPG + + + W+ +++++ ++V C CQ
Subjt: VPEDNVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQ
|
|
| P0CT35 Transposon Tf2-2 polyprotein | 4.4e-32 | 26.33 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
++ V W +P ++ FLG Y R+F+ S++ L +K + +P + + +KQ LV+ PVL D S ++ +DAS +G VL Q+
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GK-----IVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYS--EKIQIFMDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVA
V S ++ + NY D E+ A++ +LK WRHYL S E +I DH++L T N R RW ++D++ EI Y PG AN +A
Subjt: GK-----IVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYS--EKIQIFMDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVA
Query: DTLSRKVAHSAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGR--LC
D LSR ++ + P+ +D E + I + + Q+S+ + +++ ND L+ E +R+ E +I DGL+ + +
Subjt: DTLSRKVAHSAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGR--LC
Query: VPEDNVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQ
+P D + ++ + H +HPG + + + W+ +++++ ++V C CQ
Subjt: VPEDNVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQ
|
|
| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 4.4e-32 | 26.33 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
++ V W +P ++ FLG Y R+F+ S++ L +K + +P + + +KQ LV+ PVL D S ++ +DAS +G VL Q+
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GK-----IVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYS--EKIQIFMDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVA
V S ++ + NY D E+ A++ +LK WRHYL S E +I DH++L T N R RW ++D++ EI Y PG AN +A
Subjt: GK-----IVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYS--EKIQIFMDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVA
Query: DTLSRKVAHSAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGR--LC
D LSR ++ + P+ +D E + I + + Q+S+ + +++ ND L+ E +R+ E +I DGL+ + +
Subjt: DTLSRKVAHSAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGR--LC
Query: VPEDNVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQ
+P D + ++ + H +HPG + + + W+ +++++ ++V C CQ
Subjt: VPEDNVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQ
|
|
| Q9UR07 Transposon Tf2-11 polyprotein | 4.4e-32 | 26.33 | Show/hide |
Query: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
++ V W +P ++ FLG Y R+F+ S++ L +K + +P + + +KQ LV+ PVL D S ++ +DAS +G VL Q+
Subjt: MEAVTNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEDFSRIASSFTLLTRKGTPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVADGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQ
Query: GK-----IVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYS--EKIQIFMDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVA
V S ++ + NY D E+ A++ +LK WRHYL S E +I DH++L T N R RW ++D++ EI Y PG AN +A
Subjt: GK-----IVASASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYS--EKIQIFMDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVA
Query: DTLSRKVAHSAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGR--LC
D LSR ++ + P+ +D E + I + + Q+S+ + +++ ND L+ E +R+ E +I DGL+ + +
Subjt: DTLSRKVAHSAALITKQAPLLRDFEKDEIAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGEDFSISSDDGLMFEGR--LC
Query: VPEDNVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQ
+P D + ++ + H +HPG + + + W+ +++++ ++V C CQ
Subjt: VPEDNVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYWWRNMKREVADFVSRCLVCQ
|
|
