| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0036946.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 6.5e-268 | 98.32 | Show/hide |
Query: MRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNRTEAEHEEHLH
MRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPS TEAEHEEHLH
Subjt: MRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNRTEAEHEEHLH
Query: QVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACE
QVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACE
Subjt: QVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACE
Query: SSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFF
SSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFF
Subjt: SSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFF
Query: TQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEK
TQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEK
Subjt: TQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEK
Query: RRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREMADFV
RRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREMADFV
Subjt: RRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREMADFV
|
|
| KAA0040547.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.4e-248 | 85.52 | Show/hide |
Query: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
++D SMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQL GATVFSKIDLRSGYHQLRIRD DIPKTAF SRYG+YEF+V+SFGLTNAP+VFMDLMNR
Subjt: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
Query: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
TEAEHEEHLHQVLETLRAN LY KFSKCEFWL+KV+FLGHVVSS+GVSVDPA++EAV+NWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFV
Subjt: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
Query: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
E FSRIAS LT LTRK TPFV SPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSG+FVIYSDASKKGLG VLMQQ KVVA ASRQLK +E NYPTHDLEL AVVF
Subjt: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
Query: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
LKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFTQ ELNMR+RRWLELVKDYDCEILYHPGKANVV DALSRKVAH A LITKQ PLLRDFERAE AVSVGEVTSQ
Subjt: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
Query: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
LAQLSVQPTLRQ+II AQLNDPYLVEKRR+VETGQGEDFSISSDDGL FEGRLCVPEDS V+TELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVY W MKRE+
Subjt: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
Query: ADFVSRCLVCQ
ADFVSRCLVCQ
Subjt: ADFVSRCLVCQ
|
|
| KAA0045309.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.6e-248 | 85.52 | Show/hide |
Query: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
++D SMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQL GATVFSKIDLRSGYHQLRIRD DIPKTAF SRYG+YEF+VISFGLTNAP+VFMDLMNR
Subjt: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
Query: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
TEAEHEEHLHQVLETLRAN+LY KFSKCEFWL+KV+FLGHVVSS+GVSVDPA++EAV+NWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFV
Subjt: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
Query: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
E SRIAS LT LTRK TPFV SPACE SFQELKQKLVTAPVLTVPDGSG+FVIYSDASKKGLG VLMQQ KVVA ASRQLK HE NYPTHDLELAAVVF
Subjt: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
Query: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
LKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFTQ ELNMR+RRWLELVKDYDCEILYHPGKANVV D+LSRKVAH AALITKQ PLLRDFERAE AVSVGEVT+Q
Subjt: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
Query: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
LAQLSVQPTLRQ+II AQLNDPYL EKRR+VETGQGEDFSISSDDGL FEGRLCVPEDS VKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVY W MKRE+
Subjt: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
Query: ADFVSRCLVCQ
ADFVSRCLVCQ
Subjt: ADFVSRCLVCQ
|
|
| KAA0056047.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 7.5e-248 | 86.3 | Show/hide |
Query: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
++D SMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLP+IDDLFDQL GATVFSKIDL+SGYHQLRIRDSDIPKTAF SRY +YEFIV+SFGLTNAP+VFMDLMNR
Subjt: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
Query: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
TEAEHEEHLHQVLETLRAN+LYVKFSKCEFWLKKV+FLGHVVSS+GVS+DPA++EAV+NWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFV
Subjt: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
Query: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
E FSRIAS LT LTRK TPFV SPACESSFQELKQKLVTAPVLT+PDGSGSFVIYSDASKKGLG VLMQQ KVVA ASRQLKSHE NY HDLELAAVVF
Subjt: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
Query: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
LKIW HYLYGEKIQI+T+HKSLKYFFTQ +LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVV DALSRKVAH AALITKQAPLLRDFERAE AVSVGEVTSQ
Subjt: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
Query: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSI SDDGL FE RLCVPEDS VKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVY W NMKRE+
Subjt: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
Query: ADFVSRCLVCQ
ADFVSRCLVCQ
Subjt: ADFVSRCLVCQ
|
|
| KAA0063098.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 7.5e-248 | 85.13 | Show/hide |
Query: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
++D SMRLCIDYRELNKVT+KNRYPLPRIDDLFDQL GATVFSKIDLRSGYHQLRIRD DIPKTAF SRYG+YEF+V+SFGLTNAP+VFMDLMNR
Subjt: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
Query: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
TEAEHEEHLHQVLETLRAN+LY KFSKCEFWL+KV+FLGHVVSS+GVSVDPA++EAV+NWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFV
Subjt: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
Query: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
E FSRIAS LT LTRK TPFV SPACE SFQELKQKLVTAPVLTVPDGSG+FVIYSDASKK LG VLMQQ KVVA ASRQLK+HE NYPTHDLELAAVVF
Subjt: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
Query: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
LKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFTQ ELNMR+RRWLELVKDYDCEILYHPGKANVV DALSRKVAH AALITKQ PLLRDFERAE VSVGEVT+Q
Subjt: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
Query: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
LAQLSVQPTLRQ+II AQLNDPYL EKRR+VETGQGEDFSISSDDGL FEGRLCVPEDS VKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVY W MKRE+
Subjt: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
Query: ADFVSRCLVCQ
ADFVSRCLVCQ
Subjt: ADFVSRCLVCQ
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7T4A1 Pol protein | 3.2e-268 | 98.32 | Show/hide |
Query: MRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNRTEAEHEEHLH
MRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPS TEAEHEEHLH
Subjt: MRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNRTEAEHEEHLH
Query: QVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACE
QVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACE
Subjt: QVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFVEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACE
Query: SSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFF
SSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFF
Subjt: SSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVFTLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFF
Query: TQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEK
TQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEK
Subjt: TQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEK
Query: RRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREMADFV
RRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREMADFV
Subjt: RRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREMADFV
|
|
| A0A5A7TG62 Reverse transcriptase | 1.6e-248 | 85.52 | Show/hide |
Query: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
++D SMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQL GATVFSKIDLRSGYHQLRIRD DIPKTAF SRYG+YEF+V+SFGLTNAP+VFMDLMNR
Subjt: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
Query: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
TEAEHEEHLHQVLETLRAN LY KFSKCEFWL+KV+FLGHVVSS+GVSVDPA++EAV+NWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFV
Subjt: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
Query: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
E FSRIAS LT LTRK TPFV SPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSG+FVIYSDASKKGLG VLMQQ KVVA ASRQLK +E NYPTHDLEL AVVF
Subjt: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
Query: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
LKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFTQ ELNMR+RRWLELVKDYDCEILYHPGKANVV DALSRKVAH A LITKQ PLLRDFERAE AVSVGEVTSQ
Subjt: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
Query: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
LAQLSVQPTLRQ+II AQLNDPYLVEKRR+VETGQGEDFSISSDDGL FEGRLCVPEDS V+TELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVY W MKRE+
Subjt: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
Query: ADFVSRCLVCQ
ADFVSRCLVCQ
Subjt: ADFVSRCLVCQ
|
|
| A0A5A7TVN9 Reverse transcriptase | 1.3e-248 | 85.52 | Show/hide |
Query: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
++D SMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQL GATVFSKIDLRSGYHQLRIRD DIPKTAF SRYG+YEF+VISFGLTNAP+VFMDLMNR
Subjt: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
Query: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
TEAEHEEHLHQVLETLRAN+LY KFSKCEFWL+KV+FLGHVVSS+GVSVDPA++EAV+NWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFV
Subjt: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
Query: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
E SRIAS LT LTRK TPFV SPACE SFQELKQKLVTAPVLTVPDGSG+FVIYSDASKKGLG VLMQQ KVVA ASRQLK HE NYPTHDLELAAVVF
Subjt: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
Query: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
LKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFTQ ELNMR+RRWLELVKDYDCEILYHPGKANVV D+LSRKVAH AALITKQ PLLRDFERAE AVSVGEVT+Q
Subjt: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
Query: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
LAQLSVQPTLRQ+II AQLNDPYL EKRR+VETGQGEDFSISSDDGL FEGRLCVPEDS VKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVY W MKRE+
Subjt: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
Query: ADFVSRCLVCQ
ADFVSRCLVCQ
Subjt: ADFVSRCLVCQ
|
|
| A0A5A7UN68 Reverse transcriptase | 3.6e-248 | 86.3 | Show/hide |
Query: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
++D SMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLP+IDDLFDQL GATVFSKIDL+SGYHQLRIRDSDIPKTAF SRY +YEFIV+SFGLTNAP+VFMDLMNR
Subjt: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
Query: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
TEAEHEEHLHQVLETLRAN+LYVKFSKCEFWLKKV+FLGHVVSS+GVS+DPA++EAV+NWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFV
Subjt: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
Query: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
E FSRIAS LT LTRK TPFV SPACESSFQELKQKLVTAPVLT+PDGSGSFVIYSDASKKGLG VLMQQ KVVA ASRQLKSHE NY HDLELAAVVF
Subjt: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
Query: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
LKIW HYLYGEKIQI+T+HKSLKYFFTQ +LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVV DALSRKVAH AALITKQAPLLRDFERAE AVSVGEVTSQ
Subjt: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
Query: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSI SDDGL FE RLCVPEDS VKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVY W NMKRE+
Subjt: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
Query: ADFVSRCLVCQ
ADFVSRCLVCQ
Subjt: ADFVSRCLVCQ
|
|
| A0A5A7V646 Reverse transcriptase | 3.6e-248 | 85.13 | Show/hide |
Query: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
++D SMRLCIDYRELNKVT+KNRYPLPRIDDLFDQL GATVFSKIDLRSGYHQLRIRD DIPKTAF SRYG+YEF+V+SFGLTNAP+VFMDLMNR
Subjt: RRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMNR-----
Query: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
TEAEHEEHLHQVLETLRAN+LY KFSKCEFWL+KV+FLGHVVSS+GVSVDPA++EAV+NWPRPSTVS+I SFLGLAGYYRRFV
Subjt: -----------------TEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRFV
Query: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
E FSRIAS LT LTRK TPFV SPACE SFQELKQKLVTAPVLTVPDGSG+FVIYSDASKK LG VLMQQ KVVA ASRQLK+HE NYPTHDLELAAVVF
Subjt: EHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSKVVASASRQLKSHEHNYPTHDLELAAVVF
Query: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
LKIWRHYLYGEKIQI+TDHKSLKYFFTQ ELNMR+RRWLELVKDYDCEILYHPGKANVV DALSRKVAH AALITKQ PLLRDFERAE VSVGEVT+Q
Subjt: TLKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQNELNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAENAVSVGEVTSQ
Query: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
LAQLSVQPTLRQ+II AQLNDPYL EKRR+VETGQGEDFSISSDDGL FEGRLCVPEDS VKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVY W MKRE+
Subjt: LAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLVEKRRLVETGQGEDFSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMYQDLRSVYLWSNMKREM
Query: ADFVSRCLVCQ
ADFVSRCLVCQ
Subjt: ADFVSRCLVCQ
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein | 2.2e-64 | 28.65 | Show/hide |
Query: PRRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMN-----
P+++ ++R+ +DY+ LNK N YPLP I+ L ++ G+T+F+K+DL+S YH +R+R D K AF G +E++V+ +G++ AP+ F +N
Subjt: PRRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMN-----
Query: -----------------RTEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRF
++E+EH +H+ VL+ L+ L + +KCEF +V F+G+ +S KG + ++ V W +P ++ FLG Y R+F
Subjt: -----------------RTEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRF
Query: VEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSK-----VVASASRQLKSHEHNYPTHDLE
+ S++ L L +K+ + +P + + +KQ LV+ PVL D S ++ +DAS +G VL Q+ V S ++ + NY D E
Subjt: VEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSK-----VVASASRQLKSHEHNYPTHDLE
Query: LAAVVFTLKIWRHYLYG--EKIQIFTDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAEN
+ A++ +LK WRHYL E +I TDH++L T N R RW ++D++ EI Y PG AN + DALSR ++ + P+ +D E +N
Subjt: LAAVVFTLKIWRHYLYG--EKIQIFTDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAEN
Query: AVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGED-FSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMY
+++ + Q+S+ + +++ ND L+ E +R+ E Q +D I+S D ++ +P D+ + ++ + H +HPG +
Subjt: AVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGED-FSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMY
Query: QDLRSVYLWSNMKREMADFVSRCLVCQ
+ + W +++++ ++V C CQ
Subjt: QDLRSVYLWSNMKREMADFVSRCLVCQ
|
|
| P0CT35 Transposon Tf2-2 polyprotein | 2.2e-64 | 28.65 | Show/hide |
Query: PRRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMN-----
P+++ ++R+ +DY+ LNK N YPLP I+ L ++ G+T+F+K+DL+S YH +R+R D K AF G +E++V+ +G++ AP+ F +N
Subjt: PRRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMN-----
Query: -----------------RTEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRF
++E+EH +H+ VL+ L+ L + +KCEF +V F+G+ +S KG + ++ V W +P ++ FLG Y R+F
Subjt: -----------------RTEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRF
Query: VEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSK-----VVASASRQLKSHEHNYPTHDLE
+ S++ L L +K+ + +P + + +KQ LV+ PVL D S ++ +DAS +G VL Q+ V S ++ + NY D E
Subjt: VEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSK-----VVASASRQLKSHEHNYPTHDLE
Query: LAAVVFTLKIWRHYLYG--EKIQIFTDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAEN
+ A++ +LK WRHYL E +I TDH++L T N R RW ++D++ EI Y PG AN + DALSR ++ + P+ +D E +N
Subjt: LAAVVFTLKIWRHYLYG--EKIQIFTDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAEN
Query: AVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGED-FSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMY
+++ + Q+S+ + +++ ND L+ E +R+ E Q +D I+S D ++ +P D+ + ++ + H +HPG +
Subjt: AVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGED-FSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMY
Query: QDLRSVYLWSNMKREMADFVSRCLVCQ
+ + W +++++ ++V C CQ
Subjt: QDLRSVYLWSNMKREMADFVSRCLVCQ
|
|
| P0CT36 Transposon Tf2-3 polyprotein | 2.2e-64 | 28.65 | Show/hide |
Query: PRRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMN-----
P+++ ++R+ +DY+ LNK N YPLP I+ L ++ G+T+F+K+DL+S YH +R+R D K AF G +E++V+ +G++ AP+ F +N
Subjt: PRRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMN-----
Query: -----------------RTEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRF
++E+EH +H+ VL+ L+ L + +KCEF +V F+G+ +S KG + ++ V W +P ++ FLG Y R+F
Subjt: -----------------RTEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRF
Query: VEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSK-----VVASASRQLKSHEHNYPTHDLE
+ S++ L L +K+ + +P + + +KQ LV+ PVL D S ++ +DAS +G VL Q+ V S ++ + NY D E
Subjt: VEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSK-----VVASASRQLKSHEHNYPTHDLE
Query: LAAVVFTLKIWRHYLYG--EKIQIFTDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAEN
+ A++ +LK WRHYL E +I TDH++L T N R RW ++D++ EI Y PG AN + DALSR ++ + P+ +D E +N
Subjt: LAAVVFTLKIWRHYLYG--EKIQIFTDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAEN
Query: AVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGED-FSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMY
+++ + Q+S+ + +++ ND L+ E +R+ E Q +D I+S D ++ +P D+ + ++ + H +HPG +
Subjt: AVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGED-FSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMY
Query: QDLRSVYLWSNMKREMADFVSRCLVCQ
+ + W +++++ ++V C CQ
Subjt: QDLRSVYLWSNMKREMADFVSRCLVCQ
|
|
| P0CT37 Transposon Tf2-4 polyprotein | 2.2e-64 | 28.65 | Show/hide |
Query: PRRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMN-----
P+++ ++R+ +DY+ LNK N YPLP I+ L ++ G+T+F+K+DL+S YH +R+R D K AF G +E++V+ +G++ AP+ F +N
Subjt: PRRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMN-----
Query: -----------------RTEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRF
++E+EH +H+ VL+ L+ L + +KCEF +V F+G+ +S KG + ++ V W +P ++ FLG Y R+F
Subjt: -----------------RTEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRF
Query: VEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSK-----VVASASRQLKSHEHNYPTHDLE
+ S++ L L +K+ + +P + + +KQ LV+ PVL D S ++ +DAS +G VL Q+ V S ++ + NY D E
Subjt: VEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSK-----VVASASRQLKSHEHNYPTHDLE
Query: LAAVVFTLKIWRHYLYG--EKIQIFTDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAEN
+ A++ +LK WRHYL E +I TDH++L T N R RW ++D++ EI Y PG AN + DALSR ++ + P+ +D E +N
Subjt: LAAVVFTLKIWRHYLYG--EKIQIFTDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAEN
Query: AVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGED-FSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMY
+++ + Q+S+ + +++ ND L+ E +R+ E Q +D I+S D ++ +P D+ + ++ + H +HPG +
Subjt: AVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGED-FSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMY
Query: QDLRSVYLWSNMKREMADFVSRCLVCQ
+ + W +++++ ++V C CQ
Subjt: QDLRSVYLWSNMKREMADFVSRCLVCQ
|
|
| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 2.2e-64 | 28.65 | Show/hide |
Query: PRRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMN-----
P+++ ++R+ +DY+ LNK N YPLP I+ L ++ G+T+F+K+DL+S YH +R+R D K AF G +E++V+ +G++ AP+ F +N
Subjt: PRRDRSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLHGATVFSKIDLRSGYHQLRIRDSDIPKTAFHSRYGYYEFIVISFGLTNAPSVFMDLMN-----
Query: -----------------RTEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRF
++E+EH +H+ VL+ L+ L + +KCEF +V F+G+ +S KG + ++ V W +P ++ FLG Y R+F
Subjt: -----------------RTEAEHEEHLHQVLETLRANRLYVKFSKCEFWLKKVSFLGHVVSSKGVSVDPAEMEAVSNWPRPSTVSKIHSFLGLAGYYRRF
Query: VEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSK-----VVASASRQLKSHEHNYPTHDLE
+ S++ L L +K+ + +P + + +KQ LV+ PVL D S ++ +DAS +G VL Q+ V S ++ + NY D E
Subjt: VEHFSRIASLLTLLTRKETPFVSSPACESSFQELKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGYVLMQQSK-----VVASASRQLKSHEHNYPTHDLE
Query: LAAVVFTLKIWRHYLYG--EKIQIFTDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAEN
+ A++ +LK WRHYL E +I TDH++L T N R RW ++D++ EI Y PG AN + DALSR ++ + P+ +D E +N
Subjt: LAAVVFTLKIWRHYLYG--EKIQIFTDHKSLKYFFTQNE--LNMRKRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVVDALSRKVAHPAALITKQAPLLRDFERAEN
Query: AVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGED-FSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMY
+++ + Q+S+ + +++ ND L+ E +R+ E Q +D I+S D ++ +P D+ + ++ + H +HPG +
Subjt: AVSVGEVTSQLAQLSVQPTLRQRIIVAQLNDPYLV-----EKRRLVETGQGED-FSISSDDGLTFEGRLCVPEDSVVKTELLTEAHSSPFTMHPGSTKMY
Query: QDLRSVYLWSNMKREMADFVSRCLVCQ
+ + W +++++ ++V C CQ
Subjt: QDLRSVYLWSNMKREMADFVSRCLVCQ
|
|
