| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0032454.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.6e-157 | 93.88 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
MEKLVNEMLVS IIRPSASPYSS VLLVKKKDGSWRF VDYRALNNVT+PDKFPIPVVEELFDELGGASLF+KIDLKAGYHQIRMVD DIEKT FRTH+G
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
Query: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
HYEFLVMPF LTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVL+FFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLIS+KGVEVDP+KI
Subjt: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
Query: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
KAIT WPKPTNV ETRGFLGLTGYYRKFVHHY TLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALP+LALPMFDKPFEIETDASGY +GAV
Subjt: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
|
|
| KAA0048423.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.6e-157 | 93.88 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
MEKLVNEMLVS IIRPSASPYSS VLLVKKKDGSWRF VDYRALNNVT+PDKFPIPVVEELFDELGGASLF+KIDLKAGYHQIRMVD DIEKT FRTH+G
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
Query: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
HYEFLVMPF LTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVL+FFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLIS+KGVEVDP+KI
Subjt: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
Query: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
KAIT WPKPTNV ETRGFLGLTGYYRKFVHHY TLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALP+LALPMFDKPFEIETDASGY +GAV
Subjt: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
|
|
| KAA0065392.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.6e-157 | 93.88 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
MEKLVNEMLVS IIRPSASPYSS VLLVKKKDGSWRF VDYRALNNVT+PDKFPIPVVEELFDELGGASLF+KIDLKAGYHQIRMVD DIEKT FRTH+G
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
Query: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
HYEFLVMPF LTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVL+FFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLIS+KGVEVDP+KI
Subjt: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
Query: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
KAIT WPKPTNV ETRGFLGLTGYYRKFVHHY TLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALP+LALPMFDKPFEIETDASGY +GAV
Subjt: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
|
|
| TYK22240.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.6e-157 | 93.88 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
MEKLVNEMLVS IIRPSASPYSS VLLVKKKDGSWRF VDYRALNNVT+PDKFPIPVVEELFDELGGASLF+KIDLKAGYHQIRMVD DIEKT FRTH+G
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
Query: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
HYEFLVMPF LTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVL+FFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLIS+KGVEVDP+KI
Subjt: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
Query: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
KAIT WPKPTNV ETRGFLGLTGYYRKFVHHY TLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALP+LALPMFDKPFEIETDASGY +GAV
Subjt: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
|
|
| TYK30083.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.6e-157 | 93.88 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
MEKLVNEMLVS IIRPSASPYSS VLLVKKKDGSWRF VDYRALNNVT+PDKFPIPVVEELFDELGGASLF+KIDLKAGYHQIRMVD DIEKT FRTH+G
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
Query: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
HYEFLVMPF LTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVL+FFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLIS+KGVEVDP+KI
Subjt: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
Query: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
KAIT WPKPTNV ETRGFLGLTGYYRKFVHHY TLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALP+LALPMFDKPFEIETDASGY +GAV
Subjt: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SMQ7 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 1.7e-157 | 93.88 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
MEKLVNEMLVS IIRPSASPYSS VLLVKKKDGSWRF VDYRALNNVT+PDKFPIPVVEELFDELGGASLF+KIDLKAGYHQIRMVD DIEKT FRTH+G
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
Query: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
HYEFLVMPF LTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVL+FFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLIS+KGVEVDP+KI
Subjt: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
Query: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
KAIT WPKPTNV ETRGFLGLTGYYRKFVHHY TLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALP+LALPMFDKPFEIETDASGY +GAV
Subjt: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
|
|
| A0A5A7TXP9 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 1.7e-157 | 93.88 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
MEKLVNEMLVS IIRPSASPYSS VLLVKKKDGSWRF VDYRALNNVT+PDKFPIPVVEELFDELGGASLF+KIDLKAGYHQIRMVD DIEKT FRTH+G
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
Query: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
HYEFLVMPF LTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVL+FFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLIS+KGVEVDP+KI
Subjt: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
Query: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
KAIT WPKPTNV ETRGFLGLTGYYRKFVHHY TLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALP+LALPMFDKPFEIETDASGY +GAV
Subjt: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
|
|
| A0A5D3B8Y6 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 1.7e-157 | 93.88 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
MEKLVNEMLVS IIRPSASPYSS VLLVKKKDGSWRF VDYRALNNVT+PDKFPIPVVEELFDELGGASLF+KIDLKAGYHQIRMVD DIEKT FRTH+G
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
Query: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
HYEFLVMPF LTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVL+FFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLIS+KGVEVDP+KI
Subjt: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
Query: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
KAIT WPKPTNV ETRGFLGLTGYYRKFVHHY TLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALP+LALPMFDKPFEIETDASGY +GAV
Subjt: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
|
|
| A0A5D3DYS4 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 1.7e-157 | 93.88 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
MEKLVNEMLVS IIRPSASPYSS VLLVKKKDGSWRF VDYRALNNVT+PDKFPIPVVEELFDELGGASLF+KIDLKAGYHQIRMVD DIEKT FRTH+G
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
Query: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
HYEFLVMPF LTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVL+FFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLIS+KGVEVDP+KI
Subjt: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
Query: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
KAIT WPKPTNV ETRGFLGLTGYYRKFVHHY TLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALP+LALPMFDKPFEIETDASGY +GAV
Subjt: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
|
|
| A0A5D3E1V9 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 1.7e-157 | 93.88 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
MEKLVNEMLVS IIRPSASPYSS VLLVKKKDGSWRF VDYRALNNVT+PDKFPIPVVEELFDELGGASLF+KIDLKAGYHQIRMVD DIEKT FRTH+G
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
Query: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
HYEFLVMPF LTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVL+FFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLIS+KGVEVDP+KI
Subjt: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
Query: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
KAIT WPKPTNV ETRGFLGLTGYYRKFVHHY TLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALP+LALPMFDKPFEIETDASGY +GAV
Subjt: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGAV
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 1.8e-66 | 44.19 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLV-KKKDGS----WRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTF
+E + +ML IIR S SPY+S + +V KK+D S +R +DYR LN +T+ D+ PIP ++E+ +LG + F+ IDL G+HQI M + KT F
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLV-KKKDGS----WRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTF
Query: RTHKGHYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEV
T GHYE+L MPF L NAPATFQ MN I RP L K L++ DDI+++S + ++HL+ + +VF L K L KC F + +LGH+++ G++
Subjt: RTHKGHYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEV
Query: DPKKIKAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGG--FKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGA
+P+KI+AI K+P PT E + FLGLTGYYRKF+ ++A +A P+T+ LKK N E + AF+KLK + P+L +P F K F + TDAS +GA
Subjt: DPKKIKAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGG--FKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGA
Query: V
V
Subjt: V
|
|
| P10401 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon gypsy | 1.5e-57 | 37.86 | Show/hide |
Query: VNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKK------DGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTH
V ++L IIRPS SPY+S +V KK + + R +D+R LN TIPD++P+P + + LG A F+ +DLK+GYHQI + + D EKT+F +
Subjt: VNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKK------DGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTH
Query: KGHYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPK
G YEF +PF L NA + FQ ++ + R + K ++ DD++I+S N DH++H++ V L + +++K F VEYLG ++S G + DP+
Subjt: KGHYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPK
Query: KIKAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLL------------KKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPV-LALPMFDKPFEIETD
K+KAI ++P+P V + R FLGL YYR F+ +A +A P+T +L KK ++N AF++L+ + + V L P F KPF++ TD
Subjt: KIKAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLL------------KKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPV-LALPMFDKPFEIETD
Query: ASGYRVGAV
AS +GAV
Subjt: ASGYRVGAV
|
|
| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 3.8e-69 | 45.85 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKD-----GSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTF
+E V EML +IR S SPY+S +V KK +R +DYR LN +TIPD++PIP ++E+ +LG F+ IDL G+HQI M + I KT F
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKD-----GSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTF
Query: RTHKGHYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEV
T GHYE+L MPF L NAPATFQ MN+I RP L K L++ DDI+I+S + +HL +++VF L L KC F + +LGH+++ G++
Subjt: RTHKGHYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEV
Query: DPKKIKAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAE--QAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGA
+P K+KAI +P PT E R FLGLTGYYRKF+ +YA +A P+T LKK + E +AFEKLK +I P+L LP F+K F + TDAS +GA
Subjt: DPKKIKAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAE--QAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIETDASGYRVGA
Query: V
V
Subjt: V
|
|
| Q8I7P9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus | 8.8e-66 | 40.84 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKK-----DGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTF
+E+ ++E+L IIRPS SPY+S + +V KK + +R VD++ LN VTIPD +PIP + LG A F+ +DL +G+HQI M + DI KT F
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKK-----DGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTF
Query: RTHKGHYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEV
T G YEFL +PF L NAPA FQ +++ I R ++ K ++ DDI+++S +++ H K++ +V L K L N +K F +VE+LG+++++ G++
Subjt: RTHKGHYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEV
Query: DPKKIKAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLK------------KGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIE
DPKK++AI++ P PT+V E + FLG+T YYRKF+ YA +A PLT L + K + A Q+F LK + + +LA P F KPF +
Subjt: DPKKIKAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLK------------KGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKPFEIE
Query: TDASGYRVGAV
TDAS + +GAV
Subjt: TDASGYRVGAV
|
|
| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 5.7e-57 | 41.02 | Show/hide |
Query: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
+ K+V ++L + I PS SP SS V+LV KKDG++R VDYR LN TI D FP+P ++ L +G A +F+ +DL +GYHQI M +D KT F T G
Subjt: MEKLVNEMLVSVIIRPSASPYSSLVLLVKKKDGSWRFYVDYRALNNVTIPDKFPIPVVEELFDELGGASLFSKIDLKAGYHQIRMVDRDIEKTTFRTHKG
Query: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
YE+ VMPF L NAP+TF M FR +FV ++ DDILI+S + E+H KH++ V L+ L +KKC F + E+LG+ I + + K
Subjt: HYEFLVMPFELTNAPATFQSLMNSIFRPYLRKFVLIFFDDILIYSRNWEDHLKHMEIVFLVLRKHELFANRKKCSFGLAKVEYLGHLISSKGVEVDPKKI
Query: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKP-FEIETDASGYRVGAV
AI +P P V + + FLG+ YYR+F+ + + +A P+ QL +W + ++A +KLK+A+ PVL +P +K + + TDAS +GAV
Subjt: KAITKWPKPTNVCETRGFLGLTGYYRKFVHHYATLAAPLTQLLKKGGFKWNAEAEQAFEKLKEAMIALPVLALPMFDKP-FEIETDASGYRVGAV
|
|
