| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
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| KAA0040321.1 RNA-directed DNA polymerase-like protein [Cucumis melo var. makuwa] | 8.0e-69 | 77.91 | Show/hide |
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MSP EYQ+LH+HI+DLLKKGH KPSLS C ALLTPKKD SWRMCVD+RAIN+ITVKYRF IP IGDLLD LGKATIFSKIDLRSG HQIRIR DEWK
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T FKTNEGLFEW+V+PFGLSNAP+ FMRLMN+V HPFLN++I+VYFDDILV N + +H+ HL
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| KAA0054966.1 transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.1e-70 | 78.44 | Show/hide |
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MSP EY++LHD IE+LLKKGHIKPS S C V ALLTPKKD +WRMCVD+RAIN+ITVKYRF IP + DLLD LG A IFSKIDLRS HQIRIRP DEWK
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TAFKTNEGLFEWLV+PF LSNAPSTFMRLMNKVLHPFLN++IIVYFDDILV S + HLQH+ +LF
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| XP_011648447.2 uncharacterized protein LOC105434464 [Cucumis sativus] | 5.3e-73 | 79.04 | Show/hide |
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MSP+EY+ LHDHIE+LLKKGHIKPSLS C V ALLT KKD SWRMCVD+RAIN+ITVKYRFSIP I DLLD LGKA+IFSKIDL+SG HQIRIRP DEWK
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T FKT EGLFEW+V+PFGLSNAP+TFMRLMN++LHPFLN++I+VYFDDILV S N E+HL HL K+F
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| XP_016900497.1 PREDICTED: RNA-directed DNA polymerase homolog [Cucumis melo] | 2.4e-73 | 79.64 | Show/hide |
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MSP+EYQVLHDHIE+LLKKGHIKPSLS C V ALLTPKKD +WRMC+D RAIN+ITVKY F IP IGDLLD LGKAT+FSKI+L+SG HQIRIRP D+WK
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TAFKTNEGLF+WLV+P GLSNAPSTFMRLMN+VL+PFLN++I+VYFDDIL SNN E+H+QHL KLF
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| XP_020877200.1 uncharacterized protein LOC110227444 [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata] | 2.9e-63 | 66.87 | Show/hide |
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MSP+E++ L +EDLL+KGHI+ SLS C V ALL PKKD +WRMCVD+RAIN+ITV+YRF IP + DLLD +GKAT+F+K+DL+SG HQIRIRP DEWK
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TAFKT EGLFEWLV+PFGLSNAPSTFMR+MN+ L PF+ +++++YFDDIL+ S++ +DH+ HL K+
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S4DWY8 RNA-directed DNA polymerase homolog | 1.2e-73 | 79.64 | Show/hide |
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MSP+EYQVLHDHIE+LLKKGHIKPSLS C V ALLTPKKD +WRMC+D RAIN+ITVKY F IP IGDLLD LGKAT+FSKI+L+SG HQIRIRP D+WK
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Query: TAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHLGKLF
TAFKTNEGLF+WLV+P GLSNAPSTFMRLMN+VL+PFLN++I+VYFDDIL SNN E+H+QHL KLF
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| A0A2U1P6A2 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 2.0e-62 | 68.07 | Show/hide |
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MSPKE +L + +E+LL+KGHI+ S+S C V ALLTPKKD SWRMCVD+RAIN+ITV+YRF IP + DLLD L A +FSKIDLRSG HQIRI+P DEWK
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Query: TAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHLGKL
TAFKT +GL+EWLV+PFGLSNAPSTFMRLM +VL PF+ ++++VYFDDILV S ++HL HL K+
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| A0A5D3DGR0 Reverse transcriptase | 5.4e-71 | 78.44 | Show/hide |
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MSP EY++LHD IE+LLKKGHIKPS S C V ALLTPKKD +WRMCVD+RAIN+ITVKYRF IP + DLLD LG A IFSKIDLRS HQIRIRP DEWK
Subjt: MSPKEYQVLHDHIEDLLKKGHIKPSLSQCTVLALLTPKKDRSWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPIDEWK
Query: TAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHLGKLF
TAFKTNEGLFEWLV+PF LSNAPSTFMRLMNKVLHPFLN++IIVYFDDILV S + HLQH+ +LF
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| A0A5D3DIC3 RNA-directed DNA polymerase-like protein | 3.9e-69 | 77.91 | Show/hide |
Query: MSPKEYQVLHDHIEDLLKKGHIKPSLSQCTVLALLTPKKDRSWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPIDEWK
MSP EYQ+LH+HI+DLLKKGH KPSLS C ALLTPKKD SWRMCVD+RAIN+ITVKYRF IP IGDLLD LGKATIFSKIDLRSG HQIRIR DEWK
Subjt: MSPKEYQVLHDHIEDLLKKGHIKPSLSQCTVLALLTPKKDRSWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPIDEWK
Query: TAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHL
T FKTNEGLFEW+V+PFGLSNAP+ FMRLMN+V HPFLN++I+VYFDDILV N + +H+ HL
Subjt: TAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHL
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| A0A5D3DIG3 RNA-directed DNA polymerase-like protein | 1.2e-73 | 79.64 | Show/hide |
Query: MSPKEYQVLHDHIEDLLKKGHIKPSLSQCTVLALLTPKKDRSWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPIDEWK
MSP+EYQVLHDHIE+LLKKGHIKPSLS C V ALLTPKKD +WRMC+D RAIN+ITVKY F IP IGDLLD LGKAT+FSKI+L+SG HQIRIRP D+WK
Subjt: MSPKEYQVLHDHIEDLLKKGHIKPSLSQCTVLALLTPKKDRSWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPIDEWK
Query: TAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHLGKLF
TAFKTNEGLF+WLV+P GLSNAPSTFMRLMN+VL+PFLN++I+VYFDDIL SNN E+H+QHL KLF
Subjt: TAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHLGKLF
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 3.6e-32 | 42.11 | Show/hide |
Query: PKEY-QVLHDHIEDLLKKGHIKPSLSQCTVLALLTPKKD-----RSWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPI
P+ Y Q + I+D+L +G I+ S S + PKK + +R+ +D R +N+ITV R IP + ++L LG+ F+ IDL G HQI + P
Subjt: PKEY-QVLHDHIEDLLKKGHIKPSLSQCTVLALLTPKKD-----RSWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPI
Query: DEWKTAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHLGKLF
KTAF T G +E+L +PFGL NAP+TF R MN +L P LN++ +VY DDI+V S + ++HLQ LG +F
Subjt: DEWKTAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHLGKLF
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| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 1.4e-28 | 37.8 | Show/hide |
Query: LHDHIEDLLKKGHIKPSLSQCTVLALLTPKKD-----RSWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPIDEWKTAF
+ + ++++L +G I+ S S + PKK +R+ +D R +N+IT+ R+ IP + ++L LGK F+ IDL G HQI + KTAF
Subjt: LHDHIEDLLKKGHIKPSLSQCTVLALLTPKKD-----RSWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPIDEWKTAF
Query: KTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHLGKLF
T G +E+L +PFGL NAP+TF R MN +L P LN++ +VY DDI++ S + +HL + +F
Subjt: KTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHLGKLF
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| P31843 RNA-directed DNA polymerase homolog | 1.1e-28 | 48 | Show/hide |
Query: SWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPIDEWKTAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQY
S RMC+D RA+ ++T+K ++ IP + DL D L +AT F+K+DLRSG Q+RI DE KT T G FE+ V+PFGL+NA +TF LMN VL+ +L+ +
Subjt: SWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPIDEWKTAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQY
Query: IIVYFDDILV---SSNNREDHLQHL
++VY DD++V SN+ +H++HL
Subjt: IIVYFDDILV---SSNNREDHLQHL
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| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 7.3e-33 | 42.94 | Show/hide |
Query: MSPKEYQVLHDHIEDLLKKGHIKPSLSQCTVLALLTPKKDRSWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPIDEWK
++ K Q ++ ++ LL I PS S C+ +L PKKD ++R+CVD R +N+ T+ F +P I +LL +G A IF+ +DL SG HQI + P D +K
Subjt: MSPKEYQVLHDHIEDLLKKGHIKPSLSQCTVLALLTPKKDRSWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPIDEWK
Query: TAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHL
TAF T G +E+ V+PFGL NAPSTF R M +++ VY DDIL+ S + E+H +HL
Subjt: TAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHL
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| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 7.3e-33 | 42.94 | Show/hide |
Query: MSPKEYQVLHDHIEDLLKKGHIKPSLSQCTVLALLTPKKDRSWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPIDEWK
++ K Q ++ ++ LL I PS S C+ +L PKKD ++R+CVD R +N+ T+ F +P I +LL +G A IF+ +DL SG HQI + P D +K
Subjt: MSPKEYQVLHDHIEDLLKKGHIKPSLSQCTVLALLTPKKDRSWRMCVDNRAINQITVKYRFSIPWIGDLLDPLGKATIFSKIDLRSGCHQIRIRPIDEWK
Query: TAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHL
TAF T G +E+ V+PFGL NAPSTF R M +++ VY DDIL+ S + E+H +HL
Subjt: TAFKTNEGLFEWLVLPFGLSNAPSTFMRLMNKVLHPFLNQYIIVYFDDILVSSNNREDHLQHL
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