; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc12g0326251 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc12g0326251
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationCMiso1.1chr12:16708994..16712816
RNA-Seq ExpressionCmc12g0326251
SyntenyCmc12g0326251
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAA0062452.1 hypothetical protein E6C27_scaffold130G00330 [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-5493.22Show/hide
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TYK08719.1 hypothetical protein E5676_scaffold76G00220 [Cucumis melo var. makuwa]2.2e-3994.51Show/hide
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TYK27431.1 hypothetical protein E5676_scaffold325G001260 [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-5493.22Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UHW5 Retrotransposon protein6.6e-4582.91Show/hide
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A0A5A7UL03 Retrotransposon protein8.6e-4582.5Show/hide
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A0A5A7V2L2 Uncharacterized protein9.2e-5593.22Show/hide
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A0A5D3CED6 Uncharacterized protein1.1e-3994.51Show/hide
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A0A5D3DUQ6 Uncharacterized protein9.2e-5593.22Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGTATTGTCAAGAACTTCTTTTGTTCATTCCTAATGTTTATTTTAAATGAAAGAAACTAGTCAGAATTTTCGAAAAGCGTTATAACGGCTATTTATATAGGTTTA
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TACAAATTAAATTTGAAAACGATAGAGTAGATTTGAATTGATTTTTTAATTGTTTAAATAATAAGCATTATAAATATAAAAGAAATATTTATAAACACATCTAAA
AAGATCATCCAAACATGGATGTAAATTTGAACGCTTAGAAATCTCCTAGACACACAAGTTTTGTAATTATTAAAATATATAATAGGGTAAGAACTTGAAAGTTAA
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