; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cmc12g0330201 (gene) of Melon (Charmono) v1.1 genome

Gene IDCmc12g0330201
OrganismCucumis melo var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionDUF1685 domain-containing protein
Genome locationCMiso1.1chr12:21271138..21272390
RNA-Seq ExpressionCmc12g0330201
SyntenyCmc12g0330201
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012881 - Protein of unknown function DUF1685


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057058.1 DUF1685 domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-12096.8Show/hide
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XP_016898936.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489359 [Cucumis melo]2.1e-10586.4Show/hide
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XP_023001638.1 uncharacterized protein LOC111495710 [Cucurbita maxima]1.6e-8171.54Show/hide
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XP_031737252.1 uncharacterized protein LOC105434498 [Cucumis sativus]4.3e-11188.84Show/hide
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XP_038895996.1 uncharacterized protein LOC120084174 [Benincasa hispida]2.0e-10083.6Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV26 Uncharacterized protein2.1e-11188.84Show/hide
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A0A1S4DSH1 uncharacterized protein LOC1034893591.0e-10586.4Show/hide
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A0A5A7UPL7 DUF1685 domain-containing protein5.0e-12196.8Show/hide
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A0A6J1EH41 uncharacterized protein LOC1114340581.7e-7667.59Show/hide
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A0A6J1KR35 uncharacterized protein LOC1114957107.8e-8271.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42760.1 unknown protein2.5e-3241.18Show/hide
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        E+LL LF+  W ER +F K     N         + +  +    ++L     SF++ R  +       SSK S  SSS+     SP SVL       KLQ
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        TI S K++      E  R L  E+  + + +++    RTR+   +S+S+LE+EELKGFMDLGFVFSE+D K S L SI+PGL RL KK++  +KEEEEEE
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Query:  EEEEERKLGG-EISRPYLSEAWEAMEEEEEKEELAKKPLMMKWRFP----SNQIDMKDNLKWWAHAVASTVR
        EE+   K+GG   +RPYLSEAW+     + K+++  +   +KWR P    ++++D+KDNL+ WAHAVAST+R
Subjt:  EEEEERKLGG-EISRPYLSEAWEAMEEEEEKEELAKKPLMMKWRFP----SNQIDMKDNLKWWAHAVASTVR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACTTCGAGCAACTTCTCAATCTCTTCGATTCATTCTGGTTCGAGCGTGGAGTCTTCAACAAACATCCTTTTCTATCAAACCCACAAAACCTACAACCTCAA
ATTCACCATCCCGATTCATTACCCAAGGAATCATTCATCATCCCACGGCTTCCAACCAGATCGATAAGCGAAGATTTAAGCTCAAAATTAAGCTTTATGTCCAGT
TCCAATTCACCCGATTCAGTTCTCTTTTCTCCAAAGCTTCAAACGATCTTTTCCAGCAAGGACATCGCCGGAGCAGAGTCGCCGGAGACAAGCCGTAAGTTGGAA
ATTGAGCGGAGGACAAAAACAGAGTACAGGAGGAGGTATAGAGGAAGAAGAACGAGACGGTCGGAAAGTCGGAGCCTTTCAGAGCTGGAATTCGAGGAGCTAAAA
GGGTTTATGGATTTGGGATTTGTTTTCTCGGAAGAGGATAAAGGTTCGAGCTTGGCGTCGATAGTTCCCGGATTGAACAGGCTAGGGAAAAAGGAAGAGAAAGAA
AGTAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGAAAATTGGGTGGTGAAATTTCGAGGCCTTATCTTTCAGAAGCTTGGGAAGCTATGGAGGAAGAA
GAAGAAAAAGAGGAGTTGGCGAAGAAACCATTGATGATGAAATGGAGGTTTCCTTCTAATCAGATTGATATGAAAGATAATCTAAAATGGTGGGCTCATGCTGTT
GCTTCTACTGTCAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTTCAAGGGCTTTTTGGTAACAACACACGTCTTTTAAACCCTACGTATATAAAAAGGACATTAGTTTCTCAAAAACCAAATTAACCAAATAACAAAATATTCAT
AGACACACCTCTGTTTTCAGCCGCCATTGATGGACTTCGAGCAACTTCTCAATCTCTTCGATTCATTCTGGTTCGAGCGTGGAGTCTTCAACAAACATCCTTTTC
TATCAAACCCACAAAACCTACAACCTCAAATTCACCATCCCGATTCATTACCCAAGGAATCATTCATCATCCCACGGCTTCCAACCAGATCGATAAGCGAAGATT
TAAGCTCAAAATTAAGCTTTATGTCCAGTTCCAATTCACCCGATTCAGTTCTCTTTTCTCCAAAGCTTCAAACGATCTTTTCCAGCAAGGACATCGCCGGAGCAG
AGTCGCCGGAGACAAGCCGTAAGTTGGAAATTGAGCGGAGGACAAAAACAGAGTACAGGAGGAGGTATAGAGGAAGAAGAACGAGACGGTCGGAAAGTCGGAGCC
TTTCAGAGCTGGAATTCGAGGAGCTAAAAGGGTTTATGGATTTGGGATTTGTTTTCTCGGAAGAGGATAAAGGTTCGAGCTTGGCGTCGATAGTTCCCGGATTGA
ACAGGCTAGGGAAAAAGGAAGAGAAAGAAAGTAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGAAAATTGGGTGGTGAAATTTCGAGGCCTTATCTTT
CAGAAGCTTGGGAAGCTATGGAGGAAGAAGAAGAAAAAGAGGAGTTGGCGAAGAAACCATTGATGATGAAATGGAGGTTTCCTTCTAATCAGATTGATATGAAAG
ATAATCTAAAATGGTGGGCTCATGCTGTTGCTTCTACTGTCAGATGACATTACTCGAATGCAATTTTTGAATTGTAAATTTTTGGAGCTGTTTCTTAAATTTTGA
TCTGATATCAATGTTTGGGATATTGAAAGCTAATGTGTAAATATATATCCAGAAATTTCTTGGGAATTCTTGCTTCTCTTTCAATTATATAGATTGAGAATCAAC
ATTTTTGTTATGATAATTGGTATTTGTTTTTCCAATTAGACTTTTATTCTTTTAAAAGTTGGAATTTCATATGAATTTTCTTGTAATCATTAGATATTAAAAGAA
GGGCAATCTATGAAGTTATCGTAATTTTTGTGAGCCACTCAATCATTAATGTATC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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IERRTKTEYRRRYRGRRTRRSESRSLSELEFEELKGFMDLGFVFSEEDKGSSLASIVPGLNRLGKKEEKESKEEEEEEEEEEERKLGGEISRPYLSEAWEAMEEE
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